MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010658	TA	3	6	282559	282564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010658	ATA	2	6	283428	283433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010658	TTA	2	6	283467	283472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010658	GAG	2	6	283480	283485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010658	GAT	2	6	283599	283604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010658	CA	3	6	283641	283646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_010658	CAG	2	6	283666	283671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010658	AGC	2	6	283722	283727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_010658	AGGA	2	8	283760	283767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010658	CTG	2	6	283775	283780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010658	GCC	2	6	283783	283788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_010658	GTT	2	6	283798	283803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010658	TGC	2	6	283818	283823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010658	CTC	2	6	283885	283890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_010658	AAG	2	6	283892	283897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010658	A	6	6	283917	283922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010658	TAT	2	6	284854	284859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010658	ACA	2	6	284862	284867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010658	GCG	2	6	284880	284885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010658	AAT	2	6	284960	284965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010658	CT	3	6	284992	284997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_010658	TTC	2	6	285028	285033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010658	ACC	2	6	285069	285074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_010658	AAT	2	6	285125	285130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010658	GGT	2	6	285170	285175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010658	GT	3	6	285282	285287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010658	CAG	2	6	285298	285303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010658	TACGGT	2	12	285365	285376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1029	NC_010658	TTG	2	6	285378	285383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010658	TTC	2	6	286585	286590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010658	GAA	2	6	286596	286601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010658	AAT	2	6	286621	286626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010658	GGT	2	6	288453	288458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010658	TGAA	2	8	288469	288476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010658	TAC	2	6	288495	288500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_010658	AAT	2	6	288533	288538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010658	CAG	2	6	288763	288768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010658	AAG	2	6	288782	288787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010658	CTTCT	2	10	291520	291529	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1040	NC_010658	TCT	2	6	293174	293179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010658	GAA	2	6	293206	293211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010658	ATG	2	6	293249	293254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010658	T	6	6	293300	293305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010658	GTAA	2	8	293315	293322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010658	AT	3	6	293332	293337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010658	TAA	2	6	293355	293360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010658	TG	3	6	293387	293392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010658	ATT	2	6	293397	293402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010658	CAAA	2	8	293431	293438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_010658	ATA	2	6	293474	293479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010658	T	6	6	293877	293882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010658	GCT	2	6	294006	294011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010658	CGG	2	6	294032	294037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010658	A	6	6	294101	294106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010658	TAT	2	6	294107	294112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010658	GATGG	2	10	294126	294135	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010658	GCGG	2	8	294177	294184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_010658	T	6	6	294186	294191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010658	A	7	7	294246	294252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010658	GC	3	6	294327	294332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_010658	CGCTG	2	10	294442	294451	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1062	NC_010658	TAC	2	6	294476	294481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010658	GCT	2	6	294556	294561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010658	CCG	2	6	294621	294626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_010658	ACAGGC	2	12	294655	294666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010658	GCC	2	6	294692	294697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_010658	TTG	2	6	294899	294904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010658	CACGCC	2	12	295082	295093	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_010658	GTGATG	2	12	295163	295174	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010658	CAGT	2	8	295216	295223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_010658	GCG	2	6	295232	295237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_010658	GCC	2	6	295250	295255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_010658	GACC	2	8	295270	295277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_010658	TCT	2	6	295287	295292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010658	GCC	2	6	295304	295309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_010658	T	7	7	295361	295367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010658	CAA	2	6	297894	297899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010658	TAT	2	6	298378	298383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010658	T	6	6	298452	298457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010658	CGC	2	6	298519	298524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_010658	GAA	2	6	299118	299123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010658	TAA	2	6	299397	299402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010658	AACAAT	2	12	299414	299425	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1084	NC_010658	CTG	2	6	299471	299476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_010658	AAGT	2	8	299502	299509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010658	CAG	2	6	299512	299517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_010658	ACG	2	6	299545	299550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_010658	CAGC	2	8	300263	300270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_010658	CT	3	6	300654	300659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_010658	ATA	3	9	300667	300675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010658	TGC	2	6	300683	300688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010658	T	6	6	300691	300696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010658	AT	3	6	300706	300711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010658	TCA	2	6	300719	300724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010658	TTG	2	6	300760	300765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010658	ATA	2	6	301134	301139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010658	TGC	2	6	301141	301146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010658	ATT	2	6	301154	301159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010658	CCG	2	6	301162	301167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_010658	AAT	2	6	301173	301178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010658	TTG	2	6	302183	302188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010658	CGG	2	6	302219	302224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_010658	TATTGA	2	12	302260	302271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010658	A	7	7	302271	302277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010658	CCTGA	2	10	304353	304362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1106	NC_010658	CCA	2	6	304387	304392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_010658	C	6	6	304408	304413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1108	NC_010658	GAC	2	6	304422	304427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010658	CTGG	2	8	304451	304458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_010658	G	6	6	304495	304500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010658	CAT	2	6	304670	304675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010658	CGC	2	6	304752	304757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_010658	CTG	2	6	306092	306097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_010658	T	6	6	310505	310510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010658	CGA	2	6	310546	310551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010658	TATT	2	8	310612	310619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010658	ACA	2	6	310620	310625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010658	T	6	6	312775	312780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010658	TGGT	2	8	312828	312835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010658	TA	3	6	312849	312854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010658	CCT	2	6	312872	312877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_010658	ACTG	2	8	312926	312933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_010658	TTC	2	6	312960	312965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_010658	ATC	2	6	313019	313024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_010658	ACA	2	6	313054	313059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_010658	T	6	6	314449	314454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010658	AGG	2	6	315877	315882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010658	TCC	3	9	315922	315930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_010658	GAT	2	6	315946	315951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010658	TCA	2	6	315992	315997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010658	ATG	2	6	316008	316013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010658	CAAAG	2	10	316053	316062	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_010658	TGC	2	6	316117	316122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010658	GAA	2	6	316140	316145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010658	AGC	2	6	316165	316170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_010658	GCC	2	6	316215	316220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_010658	T	6	6	316286	316291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_010658	CAT	2	6	316360	316365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_010658	ATC	2	6	316381	316386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_010658	TGC	2	6	316601	316606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1166	NC_010658	GTG	2	6	317608	317613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_010658	AACA	2	8	357966	357973	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1250	NC_010658	T	6	6	358378	358383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_010658	AAC	3	9	358427	358435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_010658	T	8	8	362314	362321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_010658	GTG	2	6	362346	362351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_010658	TCAGG	2	10	362902	362911	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1262	NC_010658	GTT	2	6	364902	364907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_010658	ATG	2	6	364949	364954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_010658	GATG	2	8	364956	364963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_010658	CAG	2	6	364987	364992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_010658	AGA	2	6	365019	365024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_010658	CAG	2	6	365026	365031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_010658	CCAT	2	8	365129	365136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1269	NC_010658	ACTG	2	8	365237	365244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1500	NC_010658	AAGC	2	8	406044	406051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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