MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010658	GCT	2	6	161846	161851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010658	CG	3	6	161935	161940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_010658	ATT	3	9	163439	163447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010658	TGT	2	6	163838	163843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010658	TCT	2	6	163872	163877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010658	CT	3	6	163876	163881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_010658	TGT	2	6	164574	164579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010658	ATA	2	6	164589	164594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010658	GGTCC	2	10	164685	164694	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
510	NC_010658	T	6	6	164875	164880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010658	CAG	2	6	164923	164928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010658	GGA	2	6	165179	165184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010658	GCT	2	6	165196	165201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010658	CGG	2	6	165222	165227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010658	TGA	2	6	165261	165266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010658	CG	3	6	165267	165272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_010658	GAA	2	6	167717	167722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010658	CAC	2	6	169246	169251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_010658	TCA	2	6	169266	169271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_010658	TACGT	2	10	169297	169306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_010658	GGA	2	6	169334	169339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010658	TGGC	2	8	169344	169351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_010658	CAT	2	6	169398	169403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010658	GCG	2	6	169451	169456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010658	GTC	2	6	169516	169521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_010658	ATG	2	6	169678	169683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010658	TTG	2	6	169708	169713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010658	GGA	2	6	169734	169739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010658	TGA	2	6	169745	169750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010658	GATC	2	8	169809	169816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_010658	TCAA	2	8	169817	169824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_010658	GTG	2	6	169831	169836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010658	TTG	2	6	169841	169846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010658	ACA	2	6	169893	169898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_010658	TAA	2	6	169929	169934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010658	TGG	2	6	169937	169942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010658	TGG	2	6	169964	169969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010658	AGA	2	6	170010	170015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010658	AAC	2	6	170033	170038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010658	ACG	2	6	170143	170148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010658	TGG	3	9	170150	170158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010658	GCT	2	6	170183	170188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010658	TGC	2	6	170303	170308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010658	GGC	2	6	170319	170324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010658	GTT	2	6	170367	170372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010658	TGA	2	6	170445	170450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010658	TGC	2	6	170456	170461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010658	GGC	2	6	170515	170520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010658	TGGCC	2	10	171018	171027	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
550	NC_010658	TTC	2	6	171061	171066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010658	A	6	6	171093	171098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010658	TCG	2	6	171903	171908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010658	CAA	2	6	171922	171927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_010658	CGG	2	6	171929	171934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010658	ATC	2	6	171941	171946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010658	A	8	8	171959	171966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010658	CGT	2	6	171975	171980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010658	A	6	6	175561	175566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010658	AT	4	8	176417	176424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010658	CAA	2	6	176544	176549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010658	GC	3	6	176583	176588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_010658	AAC	2	6	176649	176654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010658	AC	4	8	176653	176660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_010658	TA	3	6	176733	176738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010658	GCC	2	6	178599	178604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_010658	CTT	2	6	178614	178619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_010658	GAAA	2	8	178723	178730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010658	ATAA	2	8	179470	179477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010658	TTG	2	6	179532	179537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010658	GC	3	6	179559	179564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_010658	AAATA	2	10	179625	179634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010658	TAA	2	6	179638	179643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010658	TG	4	8	179699	179706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010658	GTCTG	2	10	179710	179719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
575	NC_010658	CGC	2	6	180325	180330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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578	NC_010658	AGT	2	6	181672	181677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010658	T	8	8	181717	181724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_010658	A	6	6	181771	181776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010658	G	6	6	182543	182548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010658	AGTT	2	8	184777	184784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010658	GAA	2	6	184787	184792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010658	ATA	2	6	184796	184801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010658	GTAGTG	2	12	187257	187268	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010658	TTA	2	6	188938	188943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_010658	AAGG	2	8	196530	196537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010658	AGG	2	6	196545	196550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010658	CGC	2	6	199154	199159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_010658	CCT	2	6	201007	201012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_010658	CCT	2	6	201142	201147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_010658	AAG	2	6	202134	202139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010658	AAAC	2	8	202872	202879	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_010658	AT	3	6	202898	202903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010658	T	6	6	202926	202931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010658	CGC	2	6	202953	202958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_010658	C	6	6	203017	203022	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
599	NC_010658	A	6	6	203897	203902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010658	A	7	7	205704	205710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010658	CTT	2	6	207813	207818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010658	ATT	2	6	207821	207826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010658	TGT	2	6	207829	207834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010658	ATT	2	6	209523	209528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010658	TAT	2	6	209529	209534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010658	ATCA	2	8	209621	209628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_010658	TTA	2	6	209688	209693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010658	GAC	2	6	210336	210341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010658	CGG	2	6	210367	210372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010658	CA	3	6	210386	210391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_010658	CGGTT	2	10	210398	210407	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
612	NC_010658	TG	3	6	210528	210533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010658	GGC	2	6	210682	210687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010658	ACT	2	6	210796	210801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010658	TTG	2	6	210893	210898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010658	CGA	2	6	210921	210926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010658	GCA	2	6	210995	211000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010658	GAA	2	6	211054	211059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010658	GGA	2	6	211090	211095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010658	AGA	2	6	211137	211142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010658	CAG	2	6	211163	211168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010658	G	6	6	211310	211315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010658	GGA	2	6	211354	211359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010658	GGC	2	6	211374	211379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_010658	GAA	2	6	211617	211622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010658	TGC	2	6	211693	211698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010658	GTC	2	6	211705	211710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010658	TTG	2	6	211766	211771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010658	CCGG	2	8	211780	211787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_010658	GGA	2	6	211818	211823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010658	TCA	2	6	211843	211848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010658	AC	3	6	211869	211874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_010658	CGT	2	6	211937	211942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010658	AC	3	6	212038	212043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_010658	GTAG	2	8	212079	212086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010658	CCT	2	6	212179	212184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_010658	AAG	2	6	212192	212197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010658	CA	3	6	212214	212219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_010658	TGA	2	6	212227	212232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010658	GGT	2	6	212269	212274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010658	GGT	2	6	212304	212309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_010658	AGG	2	6	212414	212419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
643	NC_010658	CCA	2	6	212444	212449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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645	NC_010658	A	6	6	212468	212473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_010658	AAC	2	6	212555	212560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_010658	GTT	2	6	212565	212570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
648	NC_010658	TC	3	6	212577	212582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
649	NC_010658	GAT	2	6	212598	212603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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653	NC_010658	G	6	6	213038	213043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
654	NC_010658	TCC	2	6	213048	213053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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656	NC_010658	GTAC	2	8	213152	213159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
657	NC_010658	GGA	2	6	213357	213362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
658	NC_010658	AC	3	6	213575	213580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
659	NC_010658	CGTC	2	8	213593	213600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
660	NC_010658	AAC	2	6	213612	213617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_010658	AGC	2	6	213702	213707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_010658	CAT	2	6	213708	213713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_010658	AAAG	2	8	213716	213723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
664	NC_010658	TGT	2	6	213809	213814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_010658	G	6	6	214052	214057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_010658	TTA	2	6	214409	214414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
672	NC_010658	CGG	2	6	214533	214538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_010658	ACC	2	6	214804	214809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
675	NC_010658	TGG	2	6	214864	214869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
676	NC_010658	TCC	2	6	214890	214895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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686	NC_010658	GA	3	6	215562	215567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
687	NC_010658	TGA	2	6	215614	215619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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693	NC_010658	TTA	2	6	215879	215884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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697	NC_010658	AGA	2	6	217776	217781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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702	NC_010658	T	6	6	219453	219458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_010658	TG	3	6	236120	236125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_010658	CAT	2	6	239925	239930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
763	NC_010658	GAC	2	6	239949	239954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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767	NC_010658	A	6	6	240198	240203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_010658	CG	3	6	240427	240432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
773	NC_010658	A	6	6	240470	240475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_010658	G	6	6	270752	270757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
917	NC_010658	C	6	6	270779	270784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
918	NC_010658	TA	3	6	270790	270795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_010658	AATT	2	8	275765	275772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_010658	AT	3	6	275859	275864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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