MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010658	GAT	2	6	1185537	1185542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010658	TAA	2	6	1185666	1185671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010658	GACT	2	8	1185701	1185708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_010658	CT	3	6	1185725	1185730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_010658	GCAG	2	8	1185741	1185748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5506	NC_010658	GTG	3	9	1185809	1185817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_010658	CG	3	6	1185846	1185851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_010658	GATGGC	2	12	1185933	1185944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5509	NC_010658	GC	3	6	1185943	1185948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_010658	GCAGA	2	10	1185967	1185976	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5511	NC_010658	GGC	2	6	1186029	1186034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_010658	TGA	2	6	1186059	1186064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_010658	GAAA	2	8	1186080	1186087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010658	GTC	2	6	1186166	1186171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_010658	TGA	2	6	1186215	1186220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010658	A	6	6	1186228	1186233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_010658	CCT	2	6	1186274	1186279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_010658	GTCTGG	2	12	1186328	1186339	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5519	NC_010658	GGC	2	6	1186383	1186388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_010658	CGC	2	6	1186466	1186471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_010658	A	6	6	1186566	1186571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_010658	CAGC	2	8	1186716	1186723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_010658	GCC	2	6	1186774	1186779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_010658	CTG	2	6	1186813	1186818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_010658	GCTG	2	8	1186854	1186861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_010658	CAG	2	6	1186909	1186914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_010658	GCG	2	6	1186915	1186920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010658	CAG	3	9	1186930	1186938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_010658	GGC	2	6	1186950	1186955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_010658	CAA	2	6	1186979	1186984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_010658	CAC	2	6	1187137	1187142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_010658	TTC	2	6	1187156	1187161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_010658	GAA	2	6	1187170	1187175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_010658	CAG	2	6	1187198	1187203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_010658	CTGC	2	8	1187260	1187267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_010658	CCG	2	6	1187306	1187311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_010658	CTG	2	6	1187360	1187365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_010658	GCCCA	2	10	1187384	1187393	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5539	NC_010658	AAC	2	6	1187419	1187424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_010658	CAC	2	6	1187474	1187479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_010658	ACC	2	6	1187545	1187550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_010658	GCT	2	6	1187571	1187576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_010658	CTT	2	6	1187666	1187671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_010658	GCT	2	6	1187776	1187781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_010658	TGT	2	6	1188158	1188163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_010658	ATTG	2	8	1188432	1188439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_010658	AAAC	2	8	1188490	1188497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_010658	ACC	2	6	1190546	1190551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_010658	TGT	2	6	1190610	1190615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_010658	CTT	2	6	1190714	1190719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_010658	AAT	2	6	1190720	1190725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010658	ATT	2	6	1195377	1195382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_010658	TAAA	2	8	1195424	1195431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010658	GGGGA	2	10	1195437	1195446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010658	A	6	6	1195456	1195461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_010658	TAA	2	6	1195479	1195484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_010658	ATA	2	6	1197568	1197573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010658	TCAC	2	8	1198686	1198693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_010658	GGC	2	6	1198709	1198714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_010658	TAA	2	6	1199867	1199872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010658	GTA	2	6	1199903	1199908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010658	A	6	6	1199936	1199941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010658	TC	3	6	1201282	1201287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_010658	GTT	2	6	1201325	1201330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_010658	TTAT	2	8	1201331	1201338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010658	ATT	2	6	1201345	1201350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_010658	TAT	2	6	1201384	1201389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_010658	ATTT	2	8	1201396	1201403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_010658	GGA	2	6	1201422	1201427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_010658	TTG	2	6	1201464	1201469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_010658	ATA	2	6	1201518	1201523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010658	AGG	2	6	1201553	1201558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_010658	TAG	2	6	1201567	1201572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010658	GAT	2	6	1201583	1201588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_010658	TAC	2	6	1201655	1201660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_010658	A	6	6	1201754	1201759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_010658	ATTA	2	8	1201763	1201770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010658	TA	3	6	1201782	1201787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010658	ATT	2	6	1201854	1201859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_010658	TA	3	6	1201981	1201986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_010658	ATA	2	6	1201990	1201995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010658	ACATG	2	10	1202006	1202015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5583	NC_010658	TA	3	6	1202040	1202045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010658	GAT	2	6	1202087	1202092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010658	GTT	2	6	1202147	1202152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_010658	AT	3	6	1202160	1202165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_010658	ATT	2	6	1202241	1202246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_010658	ATC	2	6	1202275	1202280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_010658	ATA	2	6	1202774	1202779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_010658	TGT	2	6	1202937	1202942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_010658	TCC	2	6	1203725	1203730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_010658	AAT	2	6	1203767	1203772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_010658	ATT	2	6	1203839	1203844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_010658	ACGTA	2	10	1203866	1203875	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5595	NC_010658	GAT	2	6	1203887	1203892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_010658	ATT	2	6	1203925	1203930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010658	T	6	6	1203929	1203934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010658	TTTAGC	2	12	1203968	1203979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5599	NC_010658	AAT	2	6	1204103	1204108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_010658	TGCC	2	8	1204109	1204116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_010658	CTGA	2	8	1204151	1204158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_010658	CAG	2	6	1204243	1204248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010658	TCA	2	6	1204278	1204283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_010658	GAT	2	6	1204319	1204324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_010658	A	6	6	1204365	1204370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_010658	GATT	2	8	1204411	1204418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_010658	T	7	7	1204548	1204554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010658	CCG	2	6	1204580	1204585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_010658	A	6	6	1204751	1204756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_010658	TCA	2	6	1204770	1204775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_010658	CAAAT	2	10	1204847	1204856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5612	NC_010658	ATTCC	2	10	1204858	1204867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5613	NC_010658	CAG	2	6	1204904	1204909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_010658	CAA	2	6	1204912	1204917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_010658	TAT	2	6	1204918	1204923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_010658	AT	3	6	1204952	1204957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_010658	TTC	2	6	1204970	1204975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_010658	A	6	6	1204995	1205000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_010658	GGT	2	6	1205902	1205907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010658	TCT	2	6	1205964	1205969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_010658	TCTT	2	8	1205974	1205981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_010658	A	6	6	1206017	1206022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_010658	ATG	2	6	1206076	1206081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010658	A	6	6	1206132	1206137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010658	TTG	2	6	1206180	1206185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_010658	GCAT	2	8	1206225	1206232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5627	NC_010658	CAG	2	6	1206302	1206307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_010658	CTT	2	6	1206383	1206388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_010658	AAT	2	6	1206459	1206464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_010658	TTA	2	6	1206603	1206608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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