MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010658	GCA	2	6	1070576	1070581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_010658	AGTA	2	8	1072188	1072195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_010658	GCA	2	6	1072266	1072271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_010658	ATT	2	6	1072285	1072290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_010658	TAA	2	6	1072297	1072302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010658	TAA	3	9	1072331	1072339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010658	ATT	2	6	1072343	1072348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_010658	TCC	2	6	1072499	1072504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_010658	ATT	2	6	1072508	1072513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010658	TCA	2	6	1072583	1072588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_010658	AG	3	6	1072601	1072606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010658	ATT	2	6	1072694	1072699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_010658	T	7	7	1072727	1072733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010658	ATAA	2	8	1072835	1072842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010658	GATGC	2	10	1076615	1076624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_010658	CGC	2	6	1076652	1076657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_010658	GCAA	2	8	1076663	1076670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_010658	CGC	2	6	1076701	1076706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_010658	AAC	2	6	1076769	1076774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_010658	CAA	2	6	1076825	1076830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_010658	GAT	2	6	1076884	1076889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_010658	GAT	2	6	1076897	1076902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_010658	CCT	2	6	1076910	1076915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_010658	AAC	2	6	1076919	1076924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_010658	TAT	2	6	1077016	1077021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_010658	GAT	4	12	1077053	1077064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_010658	TCAC	2	8	1077117	1077124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_010658	CGC	2	6	1077215	1077220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_010658	TGTT	2	8	1077284	1077291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010658	TGG	3	9	1077339	1077347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010658	ATCA	2	8	1077395	1077402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_010658	A	6	6	1077431	1077436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_010658	A	6	6	1077494	1077499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010658	GCT	2	6	1077562	1077567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_010658	AAT	2	6	1081852	1081857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010658	GCG	2	6	1087119	1087124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_010658	AATG	2	8	1087193	1087200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_010658	ACAAAA	2	12	1087223	1087234	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5039	NC_010658	TAA	2	6	1088691	1088696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010658	AAC	2	6	1088701	1088706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_010658	GCG	2	6	1091618	1091623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_010658	GCG	2	6	1091715	1091720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_010658	AACAA	2	10	1091811	1091820	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5044	NC_010658	GCTGGG	2	12	1095832	1095843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5045	NC_010658	ACT	2	6	1095852	1095857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_010658	AAC	2	6	1095896	1095901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_010658	A	6	6	1096930	1096935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_010658	ATT	2	6	1096954	1096959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_010658	GT	3	6	1097030	1097035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_010658	TA	3	6	1097083	1097088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_010658	AAT	2	6	1097115	1097120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010658	TTG	2	6	1098121	1098126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_010658	GTT	2	6	1098141	1098146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010658	TA	3	6	1098148	1098153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_010658	AAC	2	6	1098166	1098171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_010658	GCAT	2	8	1098299	1098306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_010658	A	6	6	1098415	1098420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010658	TGA	2	6	1100426	1100431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010658	ATG	2	6	1100455	1100460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010658	A	6	6	1101929	1101934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_010658	TA	3	6	1101943	1101948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_010658	AAT	2	6	1101949	1101954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_010658	ATA	2	6	1101962	1101967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_010658	ATTA	2	8	1101976	1101983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_010658	TAT	2	6	1101988	1101993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_010658	T	7	7	1102061	1102067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010658	CTC	2	6	1102108	1102113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_010658	TAT	2	6	1102131	1102136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_010658	CTTA	2	8	1102160	1102167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_010658	A	6	6	1102192	1102197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010658	TAT	2	6	1102215	1102220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_010658	T	6	6	1102350	1102355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_010658	TTA	2	6	1102451	1102456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_010658	TCA	2	6	1102477	1102482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_010658	CAA	2	6	1102580	1102585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_010658	CTT	2	6	1102654	1102659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_010658	ATC	2	6	1102684	1102689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_010658	TGATG	2	10	1102695	1102704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_010658	AGA	2	6	1102727	1102732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_010658	ATT	2	6	1102751	1102756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_010658	TAA	2	6	1102788	1102793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_010658	AAT	2	6	1102828	1102833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_010658	AGA	2	6	1102878	1102883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_010658	TGA	2	6	1102914	1102919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_010658	GAA	2	6	1102953	1102958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_010658	AAT	2	6	1102986	1102991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_010658	AAAG	2	8	1103001	1103008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010658	CTG	2	6	1103042	1103047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_010658	T	6	6	1103222	1103227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010658	A	6	6	1103233	1103238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_010658	TAGG	2	8	1105596	1105603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_010658	AAT	2	6	1105606	1105611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_010658	T	6	6	1108787	1108792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_010658	CATA	2	8	1108812	1108819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_010658	CAT	2	6	1108820	1108825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_010658	AT	3	6	1108824	1108829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_010658	T	6	6	1110314	1110319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010658	T	7	7	1110346	1110352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_010658	A	6	6	1110366	1110371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_010658	ATA	2	6	1110377	1110382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010658	CAG	2	6	1110393	1110398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_010658	TGG	3	9	1110459	1110467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_010658	GAA	2	6	1110496	1110501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010658	AT	3	6	1111710	1111715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_010658	A	7	7	1112827	1112833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010658	T	6	6	1112864	1112869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_010658	ACC	2	6	1112920	1112925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_010658	ACA	2	6	1112931	1112936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_010658	ATT	2	6	1112947	1112952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010658	AGA	2	6	1112967	1112972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_010658	TAA	2	6	1113078	1113083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_010658	ATT	2	6	1113087	1113092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_010658	GTG	2	6	1114181	1114186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_010658	T	8	8	1114199	1114206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_010658	ACA	3	9	1114217	1114225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_010658	A	6	6	1121330	1121335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010658	CAC	2	6	1121380	1121385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_010658	CA	3	6	1121409	1121414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_010658	GAT	2	6	1121435	1121440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010658	TGA	2	6	1121443	1121448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010658	TGG	2	6	1121449	1121454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_010658	T	6	6	1121550	1121555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_010658	AT	3	6	1121556	1121561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_010658	AATG	2	8	1121583	1121590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_010658	AGG	2	6	1121600	1121605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010658	TAAT	2	8	1121695	1121702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010658	TTAA	2	8	1121709	1121716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_010658	CAT	2	6	1121721	1121726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_010658	ATTC	2	8	1122267	1122274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_010658	GAAT	2	8	1122278	1122285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_010658	CAG	2	6	1123180	1123185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_010658	CGC	2	6	1123188	1123193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_010658	ATT	2	6	1124151	1124156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_010658	C	7	7	1124186	1124192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5135	NC_010658	A	6	6	1124217	1124222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_010658	TCA	2	6	1124241	1124246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_010658	TCAT	2	8	1124275	1124282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5139	NC_010658	GATA	2	8	1124307	1124314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5142	NC_010658	T	6	6	1124368	1124373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_010658	TAA	3	9	1125780	1125788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_010658	T	7	7	1125818	1125824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_010658	T	6	6	1125829	1125834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_010658	TAA	2	6	1125849	1125854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_010658	CCA	2	6	1125897	1125902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5151	NC_010658	CTG	2	6	1125987	1125992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5153	NC_010658	TGA	2	6	1126202	1126207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5163	NC_010658	ATG	2	6	1126786	1126791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5165	NC_010658	CTG	2	6	1126892	1126897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5202	NC_010658	TATC	2	8	1133387	1133394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5253	NC_010658	T	6	6	1143212	1143217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_010658	GTT	2	6	1143224	1143229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_010658	CATT	2	8	1143348	1143355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5258	NC_010658	T	6	6	1143394	1143399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_010658	AAC	2	6	1143404	1143409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_010658	T	7	7	1143606	1143612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_010658	TTA	2	6	1143657	1143662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_010658	AT	3	6	1143697	1143702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_010658	AGGC	2	8	1144616	1144623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5267	NC_010658	CAG	2	6	1144784	1144789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5270	NC_010658	CTG	2	6	1144893	1144898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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