MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae CGSP14 chromosome

Total Repeats: 3311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010582	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010582	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010582	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010582	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010582	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010582	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010582	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010582	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010582	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010582	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010582	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010582	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010582	AGT	2	6	14965	14970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010582	AAC	2	6	15014	15019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010582	CGG	2	6	15060	15065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010582	TGA	2	6	15118	15123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010582	ACA	2	6	15270	15275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010582	GTA	2	6	15282	15287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010582	GGC	2	6	15383	15388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010582	AGG	2	6	15418	15423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010582	TGG	2	6	15602	15607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010582	CGA	2	6	15626	15631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010582	GCA	2	6	15700	15705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010582	CGC	2	6	15747	15752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010582	TGT	2	6	15786	15791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010582	AGA	2	6	15795	15800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010582	CAG	2	6	15869	15874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010582	TAG	2	6	15976	15981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010582	GGA	2	6	16058	16063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010582	GAA	2	6	16322	16327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010582	GGT	2	6	16396	16401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010582	GTC	2	6	16410	16415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010582	CAT	2	6	16478	16483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010582	TAA	2	6	16513	16518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010582	GGA	2	6	16522	16527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010582	ATC	2	6	16546	16551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010582	CGC	2	6	16712	16717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010582	CAC	2	6	16757	16762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010582	GAT	2	6	16827	16832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010582	CCT	2	6	16883	16888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010582	AGG	2	6	16982	16987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010582	GTA	2	6	17097	17102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010582	TAA	2	6	17104	17109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010582	CGA	2	6	17185	17190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010582	ACG	2	6	17203	17208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010582	GAT	2	6	17236	17241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010582	GTA	2	6	17273	17278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010582	GAG	2	6	17306	17311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010582	TAG	2	6	17374	17379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010582	AGA	2	6	17460	17465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010582	CGG	2	6	17544	17549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010582	GGA	2	6	17576	17581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010582	ACA	2	6	17694	17699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010582	ATG	2	6	17761	17766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010582	GGA	2	6	17894	17899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010582	ACC	2	6	18160	18165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010582	AAT	2	6	18180	18185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010582	AGC	2	6	18240	18245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010582	GAG	2	6	18390	18395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010582	ACA	2	6	18546	18551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010582	TAG	2	6	18703	18708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010582	GAT	2	6	18950	18955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010582	CGG	2	6	19040	19045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010582	TAC	2	6	19307	19312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010582	CCT	2	6	19395	19400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010582	GGT	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010582	TCG	2	6	19646	19651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010582	CGT	2	6	19726	19731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010582	AGT	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010582	GTA	2	6	20251	20256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010582	ATG	2	6	20274	20279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010582	TAA	3	9	20345	20353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010582	TGA	2	6	20816	20821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010582	AAG	2	6	20879	20884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010582	GAA	2	6	20899	20904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010582	TTA	3	9	21046	21054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010582	GAG	2	6	21102	21107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010582	TCC	2	6	21131	21136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010582	GAA	2	6	21311	21316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010582	TGA	2	6	21405	21410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010582	ATT	2	6	21412	21417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010582	TTG	2	6	21647	21652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010582	GAT	2	6	21700	21705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010582	AAG	2	6	22065	22070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010582	ATA	2	6	22110	22115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010582	TTG	2	6	22246	22251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010582	ATA	2	6	22627	22632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010582	TCT	2	6	22699	22704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010582	TAA	2	6	22729	22734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010582	AAG	2	6	24149	24154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010582	CCT	2	6	24156	24161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010582	TTG	2	6	24165	24170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010582	ATA	2	6	24199	24204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010582	ATA	3	9	24260	24268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010582	ATA	2	6	24796	24801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010582	GGA	2	6	24839	24844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010582	CAG	2	6	24848	24853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010582	AAT	2	6	24913	24918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010582	ATA	2	6	24931	24936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010582	TCT	2	6	26015	26020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010582	ATG	2	6	30152	30157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010582	CTT	2	6	30179	30184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010582	GAT	2	6	31262	31267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010582	TAG	2	6	31304	31309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010582	ATA	2	6	31346	31351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010582	AGA	2	6	31357	31362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010582	ATT	2	6	31769	31774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010582	ACA	2	6	31819	31824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010582	CAA	2	6	31845	31850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010582	GAA	2	6	32168	32173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010582	TCT	2	6	32224	32229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010582	TAT	2	6	32336	32341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010582	ATA	2	6	32402	32407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010582	CTA	2	6	32487	32492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010582	TCC	2	6	32654	32659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010582	TAT	2	6	32747	32752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010582	TAT	2	6	32768	32773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010582	TCC	2	6	35547	35552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010582	GTA	2	6	35559	35564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010582	TGA	2	6	35598	35603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010582	AGG	2	6	35607	35612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010582	GTA	2	6	37630	37635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010582	AGG	2	6	37659	37664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010582	GAT	2	6	41229	41234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010582	TAT	2	6	41623	41628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010582	TAG	2	6	41634	41639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010582	GAT	2	6	41663	41668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010582	GAA	2	6	41701	41706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010582	ATG	2	6	41744	41749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010582	ATT	2	6	41763	41768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010582	TAA	2	6	41914	41919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010582	GTT	2	6	42129	42134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010582	AGC	2	6	42249	42254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010582	AAT	2	6	45854	45859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010582	TTC	2	6	45879	45884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010582	CTA	2	6	45919	45924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010582	AAC	2	6	46854	46859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010582	TGA	2	6	50698	50703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010582	TGA	2	6	53779	53784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010582	TTG	2	6	53823	53828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_010582	TAT	2	6	241953	241958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_010582	TAT	2	6	242372	242377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_010582	TTA	2	6	242383	242388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_010582	AGG	2	6	242395	242400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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