MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 7006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010475	T	6	6	665527	665532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010475	TAATG	2	10	668338	668347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010475	AAAGC	2	10	668416	668425	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_010475	TCG	2	6	668444	668449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_010475	T	6	6	668451	668456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010475	GCG	2	6	668574	668579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_010475	AGA	2	6	668593	668598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010475	GCA	2	6	668611	668616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010475	CAT	2	6	668643	668648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010475	CGG	2	6	668694	668699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_010475	TA	3	6	668821	668826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010475	GGCA	2	8	670111	670118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_010475	A	7	7	670120	670126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010475	A	7	7	670163	670169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010475	TC	3	6	670214	670219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_010475	GTT	2	6	670281	670286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010475	GTA	2	6	670313	670318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010475	TCC	2	6	670366	670371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_010475	GAC	2	6	670390	670395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010475	AAAC	2	8	670414	670421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_010475	CCA	2	6	670425	670430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_010475	CTC	2	6	670460	670465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_010475	TCA	2	6	670517	670522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010475	ATT	2	6	670726	670731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010475	A	7	7	670919	670925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010475	GTCTA	2	10	670950	670959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_010475	TACT	2	8	671001	671008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_010475	CTT	2	6	672633	672638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010475	TCCC	2	8	672704	672711	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1530	NC_010475	CAT	2	6	673889	673894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010475	GATT	2	8	673905	673912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010475	TTG	2	6	673973	673978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010475	T	6	6	674015	674020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010475	AGCA	2	8	674033	674040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_010475	TCC	2	6	674059	674064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_010475	ATT	2	6	674096	674101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010475	ATTA	2	8	674160	674167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010475	ATTT	2	8	674199	674206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010475	T	6	6	674697	674702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010475	CGC	2	6	675476	675481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_010475	T	6	6	675484	675489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010475	G	6	6	676220	676225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010475	A	7	7	676236	676242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010475	ATT	2	6	676315	676320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010475	CGA	2	6	676331	676336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_010475	CACCC	2	10	676355	676364	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1547	NC_010475	C	6	6	676362	676367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1548	NC_010475	ATC	2	6	676408	676413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_010475	ATT	2	6	680858	680863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010475	TAA	2	6	680917	680922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010475	CACT	2	8	680928	680935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_010475	TGA	2	6	680938	680943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010475	TCAAA	2	10	680978	680987	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_010475	AT	3	6	682313	682318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010475	T	7	7	682318	682324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010475	TAAAG	2	10	682370	682379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010475	T	8	8	684132	684139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010475	C	6	6	685558	685563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1559	NC_010475	CTT	2	6	685663	685668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_010475	AT	3	6	685672	685677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010475	A	7	7	685728	685734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010475	CCT	2	6	686299	686304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_010475	CTT	2	6	686316	686321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010475	CTA	2	6	686338	686343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_010475	T	7	7	686377	686383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010475	T	8	8	686408	686415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010475	T	7	7	686432	686438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010475	C	6	6	686488	686493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1569	NC_010475	TGC	2	6	686632	686637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_010475	TCC	2	6	687669	687674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_010475	TGT	2	6	689108	689113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010475	TGG	2	6	689160	689165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010475	GT	3	6	689194	689199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010475	CAAC	2	8	689219	689226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_010475	TTG	2	6	689257	689262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010475	CGG	2	6	690118	690123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_010475	A	6	6	690171	690176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010475	CAGC	2	8	690611	690618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_010475	TCT	2	6	690651	690656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_010475	TCC	2	6	690693	690698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_010475	ACT	2	6	690737	690742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_010475	ATC	2	6	692663	692668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010475	TTGA	2	8	692716	692723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010475	TAA	2	6	692769	692774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_010475	TCGT	2	8	692775	692782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_010475	GTT	2	6	694092	694097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010475	CGAT	2	8	694130	694137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_010475	GCT	2	6	694154	694159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_010475	TGG	2	6	694164	694169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010475	TAT	2	6	694247	694252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010475	TCAA	2	8	694300	694307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_010475	A	6	6	694306	694311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_010475	T	6	6	695003	695008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010475	TTG	2	6	695018	695023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010475	A	6	6	697746	697751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010475	CGT	2	6	698820	698825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010475	ACT	2	6	698831	698836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_010475	AAC	2	6	698918	698923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_010475	TCT	2	6	699989	699994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010475	CTG	2	6	699997	700002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_010475	CTATC	2	10	700040	700049	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1604	NC_010475	AGA	2	6	700058	700063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010475	T	8	8	700102	700109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010475	A	6	6	702231	702236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010475	TCC	2	6	702237	702242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_010475	GGAG	2	8	702245	702252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010475	TGT	2	6	702774	702779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010475	CAA	2	6	702804	702809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_010475	T	7	7	702812	702818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010475	TTCAAG	2	12	702820	702831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1613	NC_010475	A	7	7	704043	704049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010475	T	8	8	706730	706737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010475	TGCGG	2	10	706782	706791	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1616	NC_010475	A	6	6	706808	706813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010475	AGG	2	6	707676	707681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010475	GTCG	2	8	711292	711299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_010475	AAG	2	6	711360	711365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010475	TCA	2	6	711388	711393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_010475	TTC	2	6	711403	711408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010475	CGC	2	6	711425	711430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_010475	TGT	2	6	711483	711488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010475	TAAA	2	8	711943	711950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010475	ATC	2	6	712054	712059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_010475	TGG	2	6	712075	712080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010475	T	6	6	712139	712144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010475	TAG	2	6	712164	712169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010475	GTT	2	6	712183	712188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010475	CAG	2	6	712223	712228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_010475	T	7	7	715906	715912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010475	GCC	2	6	715938	715943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_010475	TAG	2	6	716509	716514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010475	A	6	6	718926	718931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_010475	TAA	2	6	722847	722852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_010475	T	6	6	724940	724945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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