MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	GGTTG	2	10	21702	21711	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010474	AATTG	2	10	37882	37891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010474	AAAAG	2	10	50180	50189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010474	AATGT	2	10	51187	51196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010474	GCTTT	2	10	54097	54106	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010474	AAATT	2	10	74063	74072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010474	GAAAA	2	10	79878	79887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010474	GTCAA	2	10	80883	80892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010474	TTGGC	2	10	84957	84966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010474	AATCC	2	10	86802	86811	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010474	CTGAC	2	10	89137	89146	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010474	AATTA	2	10	94592	94601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010474	AGGTC	2	10	96118	96127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010474	CACAA	2	10	118231	118240	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010474	AGGTA	2	10	121208	121217	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010474	TAGAA	2	10	126604	126613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010474	GCTTT	2	10	128534	128543	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010474	TTTCT	2	10	128558	128567	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010474	TAAAA	2	10	156703	156712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010474	AAATA	2	10	157650	157659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010474	ATTTT	2	10	160239	160248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010474	TGGAA	2	10	175464	175473	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010474	GTAAA	2	10	178131	178140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010474	TAAAT	2	10	179933	179942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.