MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	AAT	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010474	TAG	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010474	ATT	2	6	7374	7379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010474	CAT	2	6	7382	7387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010474	CAA	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010474	AAT	2	6	7519	7524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010474	TTG	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010474	GTT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010474	ATT	2	6	10873	10878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010474	CTG	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010474	ATT	2	6	11003	11008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010474	ATT	2	6	11063	11068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010474	TAA	2	6	11125	11130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010474	TAT	2	6	11145	11150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010474	GGA	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010474	GAC	2	6	11249	11254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010474	TAT	2	6	11514	11519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010474	AGG	2	6	11712	11717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010474	CAC	2	6	12416	12421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010474	CAA	2	6	12460	12465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010474	CTA	2	6	12482	12487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010474	TCC	2	6	14252	14257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010474	TAC	2	6	14325	14330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010474	GTG	2	6	14367	14372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010474	GAA	2	6	14447	14452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010474	ATG	2	6	14456	14461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010474	TGC	2	6	14708	14713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010474	ATG	3	9	14738	14746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010474	GGA	2	6	14768	14773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010474	TGG	2	6	14825	14830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010474	TCT	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010474	GGT	2	6	21715	21720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010474	CAC	2	6	22065	22070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010474	ATG	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010474	GGA	2	6	22246	22251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010474	ATT	2	6	23327	23332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010474	AGA	2	6	25873	25878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010474	GTT	2	6	32238	32243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010474	AGC	2	6	32267	32272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010474	TAG	2	6	32300	32305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010474	ACT	2	6	33944	33949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010474	AAT	2	6	34076	34081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010474	TAT	2	6	35103	35108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010474	TGT	2	6	35115	35120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010474	TAG	2	6	36048	36053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010474	GTC	2	6	36618	36623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010474	AAT	2	6	36628	36633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010474	GAG	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010474	ATT	2	6	39909	39914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010474	ATT	2	6	39935	39940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010474	CAG	2	6	39992	39997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010474	TGG	2	6	40790	40795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010474	CAA	2	6	42764	42769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010474	ATT	2	6	42772	42777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010474	TTA	2	6	42824	42829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010474	TCA	2	6	42841	42846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010474	TCC	2	6	42902	42907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010474	CAA	2	6	42908	42913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010474	CCA	2	6	42922	42927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010474	TCA	2	6	42988	42993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010474	TTC	2	6	43006	43011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010474	TTA	2	6	43042	43047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010474	CAA	2	6	43404	43409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010474	GAT	2	6	44199	44204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010474	TCA	2	6	46477	46482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010474	AGG	2	6	46485	46490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010474	CTG	2	6	46847	46852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010474	ACC	2	6	46878	46883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010474	TGC	2	6	46900	46905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010474	AAG	2	6	47145	47150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010474	GAT	2	6	47194	47199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010474	CAA	2	6	47267	47272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010474	GGT	2	6	47321	47326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010474	GCA	2	6	47330	47335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010474	ATC	2	6	47391	47396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010474	CGC	2	6	47444	47449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010474	TGG	2	6	47451	47456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010474	TTG	2	6	48395	48400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010474	GCG	2	6	48431	48436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010474	TGG	2	6	48483	48488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010474	TGG	2	6	48502	48507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010474	GTG	2	6	48515	48520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010474	AAC	2	6	48536	48541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010474	TTA	2	6	48682	48687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010474	CGC	2	6	48769	48774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010474	ATT	2	6	48879	48884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010474	GAG	2	6	48890	48895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010474	CTT	2	6	48897	48902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010474	CAG	2	6	49905	49910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010474	TGC	2	6	51353	51358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010474	CAA	2	6	51615	51620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010474	AGC	2	6	51726	51731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010474	GGA	2	6	52703	52708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010474	ACA	2	6	52738	52743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010474	CCA	2	6	53218	53223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010474	CGA	2	6	53283	53288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010474	AGA	2	6	53304	53309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010474	AAT	2	6	53823	53828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010474	TCT	2	6	53924	53929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010474	TCT	2	6	54117	54122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010474	GTG	2	6	56412	56417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010474	TCA	2	6	59383	59388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010474	GAA	2	6	61102	61107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010474	TCA	2	6	61166	61171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010474	AAC	3	9	61190	61198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010474	ATT	2	6	65563	65568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010474	TGA	2	6	65759	65764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010474	TTG	2	6	67489	67494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010474	ATT	2	6	67805	67810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010474	ATT	2	6	68033	68038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010474	TTG	2	6	68039	68044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010474	TTA	2	6	68215	68220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010474	TCA	2	6	68224	68229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010474	TCG	2	6	68258	68263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010474	CCT	2	6	68285	68290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010474	AGA	2	6	68324	68329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010474	ATG	2	6	68399	68404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010474	TCC	2	6	73604	73609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010474	TTA	2	6	73621	73626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010474	CTT	2	6	73689	73694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010474	ATT	2	6	73917	73922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010474	ATA	2	6	74054	74059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010474	ATT	2	6	74087	74092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010474	ATT	2	6	74918	74923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010474	TTG	2	6	78008	78013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010474	ACT	2	6	78051	78056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010474	CCT	2	6	80232	80237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010474	CGA	2	6	80349	80354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010474	GTG	2	6	80388	80393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010474	TCA	2	6	80849	80854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010474	TTC	2	6	80930	80935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010474	TGC	2	6	80936	80941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010474	GGC	2	6	81064	81069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010474	GTA	2	6	81200	81205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010474	GGT	2	6	84539	84544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010474	CAC	2	6	84608	84613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010474	CTG	2	6	84738	84743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010474	TTG	2	6	84777	84782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010474	CGT	2	6	84844	84849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010474	TCC	2	6	85046	85051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.