MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	TAAGGA	2	12	16894	16905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010380	GAAGTG	2	12	19982	19993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010380	ACTAAT	2	12	20012	20023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010380	AGTTGA	2	12	21048	21059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010380	TTTTTA	2	12	27880	27891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010380	CAGGCT	2	12	57399	57410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010380	GTTACA	2	12	69457	69468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010380	ATCCAT	2	12	98502	98513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010380	CAGGCT	2	12	99049	99060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010380	TAAAAA	2	12	114257	114268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010380	AAAAAT	2	12	135240	135251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010380	TTCTAT	2	12	142819	142830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010380	TAAAAT	2	12	151004	151015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010380	TAAAAA	2	12	167623	167634	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010380	AAGCAG	2	12	171324	171335	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010380	TTTGCT	2	12	209951	209962	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010380	ATAAAA	2	12	210342	210353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010380	CACTAA	2	12	258798	258809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010380	ATTTTG	2	12	265650	265661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010380	TTTTAC	2	12	275349	275360	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010380	AGATAA	2	12	301784	301795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010380	CATAAT	2	12	303851	303862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010380	TTTCTT	2	12	305725	305736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010380	TCTTAA	2	12	321559	321570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010380	GGTTGC	2	12	338584	338595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010380	ATTTAA	2	12	353900	353911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010380	ATTTAT	2	12	370267	370278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010380	GAAAAA	2	12	397158	397169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010380	GCAGTT	2	12	439336	439347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010380	AGAAAT	2	12	493281	493292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010380	ATGAAG	2	12	503950	503961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010380	CATCTC	2	12	529292	529303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010380	AGTTGA	2	12	529411	529422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010380	GCTTGC	2	12	548211	548222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010380	TGCTTT	2	12	596702	596713	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010380	GCAATT	2	12	616307	616318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010380	GAAAGA	2	12	616517	616528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010380	AAAATG	2	12	617385	617396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010380	TCTTTT	2	12	628508	628519	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010380	TTTTTA	2	12	667265	667276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010380	AAAGTT	2	12	678424	678435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010380	ACTTCT	2	12	696912	696923	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010380	GAGATG	2	12	699368	699379	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010380	GATATT	2	12	745008	745019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010380	AAATTA	2	12	766630	766641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010380	CTTATT	2	12	776767	776778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010380	AGATTG	2	12	791484	791495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010380	TTTTCA	2	12	834496	834507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010380	TCTTTA	2	12	847460	847471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010380	GATAGA	2	12	849393	849404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010380	TCTTGT	2	12	850038	850049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010380	AAAAAC	2	12	862469	862480	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010380	TTCGGG	2	12	885747	885758	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010380	CATCTC	2	12	888118	888129	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010380	AGTTGA	2	12	888237	888248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010380	TCCCCC	2	12	918287	918298	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_010380	TTAAAA	2	12	921826	921837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010380	TATAAA	2	12	925309	925320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010380	TCAAGT	2	12	945136	945147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010380	CTTTTC	2	12	945664	945675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010380	CCATCA	2	12	945766	945777	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010380	TTTTTA	2	12	991011	991022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010380	CTATTT	2	12	1002487	1002498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010380	AAAAAG	2	12	1002536	1002547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010380	GATAGA	2	12	1009903	1009914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010380	TTTTCT	2	12	1012823	1012834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010380	TAAAAA	2	12	1043475	1043486	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010380	TGTCAA	2	12	1049103	1049114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010380	AGTTGA	2	12	1075651	1075662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010380	CATCTC	2	12	1094886	1094897	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010380	AGTTGA	2	12	1095005	1095016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010380	TCTATC	2	12	1124066	1124077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010380	TTTGAA	2	12	1132951	1132962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010380	ATTTTT	2	12	1140946	1140957	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010380	AGATTG	2	12	1158764	1158775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010380	GATAAG	2	12	1158844	1158855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010380	TGAATT	2	12	1161063	1161074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010380	CTAAAA	2	12	1165079	1165090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010380	TCAGAA	2	12	1173899	1173910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010380	ATTTTT	2	12	1175374	1175385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010380	AATTTT	2	12	1197365	1197376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010380	TTTTTG	2	12	1208692	1208703	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010380	GTTTGT	2	12	1217867	1217878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010380	ACTTGA	2	12	1219688	1219699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010380	TACTTC	2	12	1219727	1219738	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010380	TGAAAA	2	12	1233485	1233496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010380	AGAAAA	2	12	1271302	1271313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010380	CTGGTG	2	12	1271477	1271488	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010380	CACGAA	2	12	1318996	1319007	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010380	TAAAAA	2	12	1332529	1332540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010380	CTAAAT	2	12	1343420	1343431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010380	TTGTCG	2	12	1361358	1361369	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010380	TAGGTA	2	12	1386499	1386510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010380	TTGAAA	2	12	1397475	1397486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010380	GATGGT	2	12	1426281	1426292	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010380	TTTTAT	2	12	1437829	1437840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010380	TTTCCT	2	12	1441320	1441331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010380	ATGAAA	2	12	1463428	1463439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010380	TGCTTC	2	12	1483223	1483234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010380	ACTAAA	2	12	1484546	1484557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010380	AAATTT	2	12	1499306	1499317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010380	TACCTT	2	12	1510125	1510136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010380	CTTTCT	2	12	1596292	1596303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010380	TCAATA	2	12	1602519	1602530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010380	CCGTTT	2	12	1602866	1602877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010380	ACTGGC	2	12	1610103	1610114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010380	TGACGC	2	12	1650647	1650658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010380	AACTTG	2	12	1689771	1689782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010380	CAATTC	2	12	1696431	1696442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010380	ATTTGA	2	12	1712817	1712828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010380	TAATCA	2	12	1720984	1720995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010380	CACTTC	2	12	1772472	1772483	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010380	TCTATT	2	12	1788803	1788814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010380	GAACAT	2	12	1803232	1803243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010380	CTTTCT	2	12	1822340	1822351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010380	TAGGCT	2	12	1823271	1823282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010380	ATATCA	2	12	1828008	1828019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010380	TCATTA	2	12	1835019	1835030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010380	TAATCA	2	12	1853772	1853783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010380	TCAACT	2	12	1859587	1859598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010380	GAGATG	2	12	1859706	1859717	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010380	TCAACT	2	12	1878632	1878643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010380	GAGATG	2	12	1878751	1878762	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010380	TAAAAA	2	12	1879609	1879620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010380	TATTAG	2	12	1881364	1881375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010380	CACTTC	2	12	1881395	1881406	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010380	TCCTTA	2	12	1884483	1884494	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010380	TGTATT	2	12	1887055	1887066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010380	TCAACT	2	12	1890333	1890344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010380	GAGATG	2	12	1890452	1890463	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010380	CCAGTC	2	12	1899544	1899555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010380	AATTGA	2	12	1906643	1906654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010380	AAAAAC	2	12	1916459	1916470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_010380	CCAGAA	2	12	1921559	1921570	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010380	AGGACA	2	12	1965896	1965907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_010380	AAAAAT	2	12	1969666	1969677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010380	TATTAG	2	12	1981796	1981807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_010380	ATGATT	2	12	1997918	1997929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_010380	TATTAG	2	12	2056274	2056285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010380	CACTTC	2	12	2056305	2056316	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_010380	GAGATA	2	12	2211872	2211883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010380	AAATCA	2	12	2213324	2213335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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159	NC_010380	AGAAGT	2	12	2238949	2238960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.