MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 8745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010380	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010380	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010380	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010380	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010380	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010380	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010380	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010380	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010380	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010380	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010380	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010380	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010380	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010380	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010380	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010380	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010380	A	7	7	4341	4347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010380	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010380	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010380	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010380	GA	3	6	14333	14338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010380	CT	3	6	14348	14353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010380	T	6	6	14353	14358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010380	A	8	8	14940	14947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010380	A	7	7	14950	14956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010380	AGT	2	6	14965	14970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010380	AAC	2	6	15014	15019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010380	CGG	2	6	15060	15065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010380	TGA	2	6	15118	15123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010380	A	7	7	15123	15129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010380	A	7	7	15134	15140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010380	A	6	6	15154	15159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010380	GA	3	6	15208	15213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010380	ACA	2	6	15270	15275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010380	GTA	2	6	15282	15287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010380	A	7	7	15298	15304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010380	TGAG	2	8	15329	15336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010380	GGC	2	6	15384	15389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010380	AGG	2	6	15419	15424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010380	GCTT	2	8	15426	15433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010380	CCTG	2	8	15474	15481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010380	TGG	2	6	15603	15608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010380	CGA	2	6	15627	15632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010380	GCA	2	6	15701	15706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010380	CGC	2	6	15748	15753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010380	GTGA	2	8	15754	15761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010380	TGT	2	6	15787	15792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010380	AGA	2	6	15796	15801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010380	CAG	2	6	15870	15875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010380	AGCG	2	8	15925	15932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010380	TAG	2	6	15977	15982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010380	AT	3	6	16054	16059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010380	GGA	2	6	16060	16065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010380	CT	3	6	16085	16090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010380	GAA	2	6	16324	16329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010380	GGT	2	6	16398	16403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010380	GTC	2	6	16412	16417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010380	TCGTG	2	10	16421	16430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010380	CAT	2	6	16480	16485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010380	TAA	2	6	16515	16520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010380	GGA	2	6	16524	16529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010380	ATC	2	6	16548	16553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010380	AC	3	6	16575	16580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010380	CGC	2	6	16714	16719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010380	AC	3	6	16744	16749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010380	CAC	2	6	16759	16764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010380	AGCC	2	8	16806	16813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010380	GAT	2	6	16829	16834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010380	CCT	2	6	16885	16890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010380	TAAGGA	2	12	16894	16905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010380	AGG	2	6	16984	16989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010380	GA	3	6	17022	17027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010380	GTA	2	6	17099	17104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010380	TAA	2	6	17106	17111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010380	GTTAA	2	10	17142	17151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010380	CGA	2	6	17187	17192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010380	ACG	2	6	17205	17210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010380	GTAA	2	8	17228	17235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010380	GAT	2	6	17238	17243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010380	GTA	2	6	17275	17280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010380	GAG	2	6	17308	17313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010380	TAG	2	6	17376	17381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010380	GCGA	2	8	17384	17391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010380	AGG	2	6	17398	17403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010380	AGA	2	6	17463	17468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010380	AG	3	6	17491	17496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010380	CGG	2	6	17547	17552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010380	GGA	2	6	17579	17584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010380	GGGAG	2	10	17660	17669	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010380	ACA	2	6	17697	17702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010380	ATG	2	6	17764	17769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010380	GGA	2	6	17897	17902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010380	TC	3	6	17983	17988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010380	ACC	2	6	18163	18168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010380	AAT	2	6	18183	18188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010380	AGC	2	6	18243	18248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010380	ATTC	2	8	18250	18257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010380	TG	3	6	18372	18377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010380	GAG	2	6	18393	18398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010380	GA	3	6	18523	18528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010380	ACA	2	6	18549	18554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010380	CTAA	2	8	18604	18611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010380	GTCT	2	8	18629	18636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010380	TAG	2	6	18706	18711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010380	GA	3	6	18819	18824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010380	CT	3	6	18935	18940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010380	GAT	2	6	18953	18958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010380	CGG	2	6	19044	19049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010380	GA	3	6	19142	19147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010380	TAGG	2	8	19260	19267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010380	TAC	2	6	19314	19319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010380	CCT	2	6	19402	19407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010380	GGT	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010380	TCG	2	6	19653	19658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010380	CGT	2	6	19733	19738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010380	AGGGA	2	10	19871	19880	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010380	TA	3	6	19937	19942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010380	GA	3	6	19957	19962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010380	GAAGTG	2	12	19982	19993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010380	ACTAAT	2	12	20012	20023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010380	AGT	2	6	20191	20196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010380	GTA	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010380	ATG	2	6	20281	20286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010380	T	6	6	20340	20345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010380	TAA	3	9	20352	20360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010380	GAA	2	6	20423	20428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010380	AAGCT	2	10	20429	20438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010380	CTTT	2	8	20460	20467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010380	T	6	6	20465	20470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010380	TGA	2	6	20518	20523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010380	ATT	2	6	20525	20530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010380	T	6	6	20581	20586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010380	GTG	2	6	20691	20696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010380	TTA	2	6	20739	20744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010380	TTG	2	6	20804	20809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010380	GAT	2	6	20857	20862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010380	AGTTGA	2	12	21048	21059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010380	TGA	2	6	21070	21075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010380	ATA	2	6	21130	21135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010380	TTC	2	6	21151	21156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010380	CAT	2	6	21180	21185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010380	T	7	7	21242	21248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010380	ATA	2	6	21268	21273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010380	TA	3	6	21276	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010380	TTG	2	6	21404	21409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010380	T	6	6	21456	21461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010380	A	6	6	21478	21483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010380	ATA	2	6	21785	21790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010380	T	6	6	21819	21824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010380	TCT	2	6	21857	21862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010380	T	6	6	21877	21882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010380	TAA	2	6	21887	21892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010380	AAG	2	6	23307	23312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010380	TTG	2	6	23323	23328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_010380	TAG	2	6	25673	25678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010380	T	7	7	33081	33087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_010380	T	6	6	33659	33664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_010380	CTCA	2	8	98131	98138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
295	NC_010380	T	6	6	98207	98212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010380	GTT	2	6	98220	98225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_010380	CAT	2	6	98237	98242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_010380	GAC	2	6	98430	98435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_010380	AAC	2	6	98480	98485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_010380	ATCCAT	2	12	98502	98513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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309	NC_010380	TAC	2	6	98861	98866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_010380	TAC	2	6	98933	98938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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322	NC_010380	T	6	6	99225	99230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_010380	AATA	2	8	99244	99251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_010380	TAA	2	6	119708	119713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_010380	T	7	7	119786	119792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_010380	GTT	2	6	119873	119878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_010380	TGAC	2	8	119947	119954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
427	NC_010380	AGC	2	6	119993	119998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_010380	TTC	2	6	123623	123628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_010380	T	6	6	123635	123640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_010380	TATT	2	8	123667	123674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_010380	T	6	6	123691	123696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_010380	TGA	2	6	128441	128446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_010380	TGA	2	6	131522	131527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_010380	A	7	7	143706	143712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_010380	AAC	2	6	143959	143964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_010380	TA	3	6	151139	151144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_010380	TAA	2	6	151152	151157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_010380	TCT	2	6	152869	152874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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