MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010334	ATT	2	6	1254646	1254651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010334	TG	4	8	1254661	1254668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_010334	TCT	2	6	1254748	1254753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_010334	A	6	6	1254770	1254775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_010334	GCAAA	2	10	1256973	1256982	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4006	NC_010334	TGT	2	6	1256999	1257004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010334	TGTT	2	8	1257038	1257045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_010334	T	8	8	1257050	1257057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010334	TA	3	6	1257116	1257121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_010334	GTT	2	6	1257148	1257153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010334	TTG	2	6	1257176	1257181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_010334	ATGTTT	2	12	1257215	1257226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_010334	TAA	2	6	1257245	1257250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010334	AT	3	6	1257266	1257271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_010334	AGA	2	6	1257284	1257289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010334	AAC	2	6	1257381	1257386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_010334	T	6	6	1258238	1258243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010334	GCG	2	6	1258283	1258288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_010334	ATC	2	6	1258339	1258344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_010334	GC	3	6	1258435	1258440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_010334	GCT	2	6	1258463	1258468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_010334	TTGT	2	8	1258477	1258484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010334	GTG	2	6	1258520	1258525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010334	GCT	2	6	1258565	1258570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_010334	CT	3	6	1258641	1258646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_010334	GGC	2	6	1258674	1258679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_010334	CTG	2	6	1258712	1258717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_010334	ACA	2	6	1258779	1258784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_010334	TGAG	2	8	1258996	1259003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_010334	TCA	2	6	1259014	1259019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_010334	TCA	2	6	1259022	1259027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_010334	TCT	2	6	1259046	1259051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_010334	TTGG	2	8	1259058	1259065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_010334	TCTGAG	2	12	1259106	1259117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4035	NC_010334	GCTT	2	8	1259151	1259158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_010334	GGC	2	6	1259198	1259203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_010334	TAA	2	6	1259213	1259218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010334	GGC	2	6	1259219	1259224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_010334	TAA	2	6	1259290	1259295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010334	CAT	2	6	1259303	1259308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_010334	TGT	2	6	1259323	1259328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_010334	TAAA	2	8	1259379	1259386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010334	A	6	6	1259384	1259389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010334	AT	3	6	1259444	1259449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_010334	TG	3	6	1261854	1261859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010334	GAT	2	6	1261870	1261875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010334	GTT	2	6	1261876	1261881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010334	T	6	6	1261921	1261926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010334	A	6	6	1262068	1262073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010334	TG	3	6	1262160	1262165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010334	ATT	2	6	1262169	1262174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010334	TTG	2	6	1262181	1262186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010334	GAT	2	6	1262387	1262392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010334	TAT	2	6	1262440	1262445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010334	TAAA	2	8	1262493	1262500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_010334	AGC	2	6	1262529	1262534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_010334	TGA	2	6	1262535	1262540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010334	AGG	2	6	1262552	1262557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010334	GTT	2	6	1262577	1262582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_010334	ATGT	2	8	1264347	1264354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_010334	T	6	6	1264382	1264387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_010334	A	7	7	1265581	1265587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_010334	T	7	7	1265604	1265610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_010334	CAA	2	6	1265624	1265629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_010334	TTA	2	6	1266175	1266180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010334	ACC	2	6	1266219	1266224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_010334	GCTTTT	2	12	1266604	1266615	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4068	NC_010334	ATA	2	6	1266690	1266695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010334	TTG	2	6	1266816	1266821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_010334	AAAT	2	8	1268282	1268289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010334	ATA	2	6	1270868	1270873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010334	CAT	2	6	1273775	1273780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_010334	TAAT	2	8	1273863	1273870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_010334	GC	3	6	1273877	1273882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_010334	TGG	3	9	1273969	1273977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_010334	A	6	6	1274040	1274045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_010334	ATAA	2	8	1274047	1274054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_010334	A	6	6	1274053	1274058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_010334	TTA	2	6	1276290	1276295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010334	AC	3	6	1278989	1278994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_010334	TGCT	2	8	1279004	1279011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_010334	T	8	8	1279035	1279042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_010334	AAC	2	6	1280740	1280745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_010334	CTG	2	6	1280746	1280751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_010334	TAA	2	6	1280850	1280855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_010334	TGAC	2	8	1280856	1280863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_010334	CAA	2	6	1282429	1282434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_010334	GAT	2	6	1282444	1282449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_010334	ATAA	2	8	1282463	1282470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010334	ATT	2	6	1282487	1282492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010334	TGC	2	6	1283493	1283498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_010334	TTAA	2	8	1283526	1283533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_010334	T	6	6	1283553	1283558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_010334	AGC	2	6	1283566	1283571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_010334	TGAA	2	8	1284291	1284298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_010334	AAGAT	2	10	1284347	1284356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010334	GATA	2	8	1284373	1284380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_010334	CTT	2	6	1284442	1284447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_010334	TGA	2	6	1284478	1284483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_010334	TAA	2	6	1284506	1284511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_010334	ATTT	2	8	1284525	1284532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_010334	TGA	2	6	1284641	1284646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_010334	GAT	2	6	1284647	1284652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010334	TAATT	2	10	1284676	1284685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010334	AATA	2	8	1284694	1284701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_010334	TAA	2	6	1284724	1284729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010334	TAG	2	6	1286119	1286124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_010334	TAT	2	6	1286148	1286153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_010334	A	6	6	1286211	1286216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_010334	A	6	6	1287388	1287393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_010334	TTTAG	2	10	1287427	1287436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_010334	TCT	2	6	1288192	1288197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_010334	TTA	2	6	1289454	1289459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010334	TTTTA	2	10	1289483	1289492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010334	GCA	2	6	1289653	1289658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_010334	GGCTT	2	10	1289696	1289705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4117	NC_010334	TTG	2	6	1293603	1293608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010334	TAA	2	6	1293623	1293628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010334	TTTGG	2	10	1293692	1293701	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010334	AGATG	2	10	1293785	1293794	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_010334	TAA	2	6	1293807	1293812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_010334	T	8	8	1293905	1293912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010334	GAT	2	6	1293933	1293938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_010334	AG	3	6	1293977	1293982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_010334	AGG	2	6	1293987	1293992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_010334	A	6	6	1294008	1294013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_010334	TAAG	2	8	1294106	1294113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_010334	TTCA	2	8	1294116	1294123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_010334	TAC	2	6	1300044	1300049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_010334	TAC	2	6	1300069	1300074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_010334	A	6	6	1300089	1300094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_010334	GATA	2	8	1300099	1300106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_010334	AATC	2	8	1300115	1300122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_010334	ACTA	2	8	1300171	1300178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_010334	TGCTT	2	10	1300378	1300387	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4137	NC_010334	AT	3	6	1300410	1300415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_010334	TAAT	2	8	1300481	1300488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_010334	T	7	7	1300519	1300525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_010334	TTTG	2	8	1301528	1301535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_010334	TAT	2	6	1301618	1301623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4144	NC_010334	AGA	2	6	1302111	1302116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4150	NC_010334	A	6	6	1305124	1305129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_010334	TATT	2	8	1305138	1305145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_010334	TTG	2	6	1305285	1305290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4157	NC_010334	T	7	7	1305364	1305370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4175	NC_010334	T	7	7	1310407	1310413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_010334	GTCA	2	8	1336385	1336392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4262	NC_010334	GGT	2	6	1338799	1338804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_010334	GT	3	6	1341131	1341136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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