MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010334	AGG	2	6	509783	509788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010334	GA	4	8	509823	509830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010334	GA	3	6	511784	511789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010334	CTTG	2	8	511814	511821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_010334	GTT	2	6	511859	511864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010334	CTTG	2	8	511898	511905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_010334	GTT	2	6	511943	511948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010334	CTTG	2	8	511982	511989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_010334	TAAA	2	8	513863	513870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010334	A	6	6	513879	513884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010334	T	6	6	513929	513934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010334	T	6	6	513990	513995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010334	ATT	2	6	514108	514113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010334	ATAA	2	8	514130	514137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010334	A	6	6	514165	514170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010334	TGA	2	6	514172	514177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010334	ATTCTC	2	12	514207	514218	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010334	GGA	2	6	514232	514237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010334	TAA	2	6	514271	514276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010334	TAA	2	6	514284	514289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010334	T	6	6	514297	514302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010334	ATG	2	6	514360	514365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010334	ATTAA	2	10	515995	516004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010334	AGC	2	6	518534	518539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_010334	ATT	2	6	519188	519193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010334	T	6	6	519217	519222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010334	T	6	6	519288	519293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010334	GGT	2	6	519324	519329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010334	T	7	7	519332	519338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010334	ATC	2	6	519407	519412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010334	TGT	2	6	519445	519450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010334	T	6	6	519555	519560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010334	CGC	2	6	519598	519603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_010334	CTT	2	6	519630	519635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010334	GT	3	6	520986	520991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010334	T	6	6	521034	521039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010334	ACC	2	6	521054	521059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_010334	A	6	6	521128	521133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010334	TAA	2	6	521149	521154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010334	CCT	2	6	521166	521171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_010334	ATAA	2	8	521212	521219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010334	ACT	2	6	523272	523277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_010334	TAAG	2	8	523769	523776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010334	TTTG	2	8	523816	523823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010334	AAT	2	6	523977	523982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010334	TTG	2	6	524001	524006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010334	TCT	2	6	524021	524026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_010334	AAG	2	6	524051	524056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010334	GCT	2	6	524118	524123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010334	TGT	2	6	524197	524202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010334	AAC	2	6	524236	524241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_010334	AGA	2	6	524734	524739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010334	TAAGT	2	10	536830	536839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010334	TA	3	6	536873	536878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010334	TAA	2	6	538928	538933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010334	GCAG	2	8	538935	538942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_010334	TAA	2	6	540155	540160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010334	GT	3	6	540277	540282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010334	T	6	6	540292	540297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010334	ATA	2	6	540304	540309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010334	ATA	2	6	541707	541712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010334	CAA	2	6	542669	542674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_010334	GAA	2	6	545432	545437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010334	T	6	6	545461	545466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010334	AAAG	2	8	545522	545529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010334	TA	4	8	545536	545543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010334	A	6	6	545728	545733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010334	AG	3	6	545836	545841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010334	CTT	2	6	545931	545936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_010334	CGC	2	6	545952	545957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_010334	CCT	2	6	545979	545984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_010334	GCT	2	6	546009	546014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_010334	TG	3	6	546076	546081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010334	A	6	6	546131	546136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010334	AATG	2	8	546143	546150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010334	GAA	2	6	546216	546221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_010334	A	7	7	546224	546230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010334	GGC	2	6	546271	546276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_010334	GCG	2	6	546335	546340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_010334	AGG	2	6	546430	546435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_010334	TGG	2	6	546486	546491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010334	CGA	2	6	546510	546515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010334	GAT	2	6	546535	546540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010334	GCA	2	6	546584	546589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010334	GT	3	6	546637	546642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010334	GAA	2	6	546643	546648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010334	GAG	2	6	546677	546682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010334	AGA	2	6	546726	546731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010334	CAG	2	6	546752	546757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_010334	G	6	6	546899	546904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010334	GGC	2	6	546963	546968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_010334	GAA	2	6	547206	547211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_010334	TGC	2	6	547282	547287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_010334	GTC	2	6	547294	547299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_010334	CCTTAT	2	12	547346	547357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_010334	TGG	2	6	547372	547377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010334	GGA	2	6	547408	547413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010334	GAC	2	6	547421	547426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010334	TCA	2	6	547433	547438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_010334	AC	3	6	547628	547633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_010334	CCT	2	6	547769	547774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_010334	GTT	2	6	547797	547802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010334	CA	3	6	547810	547815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_010334	AAAG	2	8	547830	547837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010334	GGT	2	6	547900	547905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010334	CCA	2	6	547922	547927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_010334	AAAG	2	8	547946	547953	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010334	TTTG	2	8	547972	547979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010334	GCCT	2	8	548018	548025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_010334	AGG	2	6	548033	548038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010334	CCA	2	6	548063	548068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_010334	T	6	6	548150	548155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010334	GTT	2	6	548227	548232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010334	A	6	6	548256	548261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010334	GTT	2	6	548301	548306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010334	GTT	2	6	548316	548321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010334	TGA	2	6	548325	548330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010334	TGG	2	6	548465	548470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010334	GTA	2	6	548501	548506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010334	TAGTG	2	10	548607	548616	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010334	GGA	2	6	548652	548657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010334	TAG	2	6	548681	548686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010334	GCGA	2	8	548689	548696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_010334	AACT	2	8	548782	548789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_010334	G	6	6	548838	548843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010334	TCC	2	6	548848	548853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_010334	CTGA	2	8	548868	548875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_010334	GGA	2	6	549158	549163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010334	AC	3	6	549168	549173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_010334	TGA	2	6	549192	549197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010334	AC	3	6	549375	549380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_010334	CGTC	2	8	549393	549400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_010334	AAC	2	6	549412	549417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_010334	AGC	2	6	549502	549507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_010334	AAAG	2	8	549516	549523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1911	NC_010334	TA	3	6	626589	626594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_010334	TA	3	6	626700	626705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_010334	TAA	2	6	626984	626989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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