MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_010334	CA	3	6	5179059	5179064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16502	NC_010334	AGC	2	6	5179126	5179131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_010334	GAG	2	6	5179155	5179160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16504	NC_010334	GGC	2	6	5179182	5179187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_010334	AAG	2	6	5179204	5179209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_010334	GAT	2	6	5179220	5179225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16507	NC_010334	CTG	2	6	5179320	5179325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_010334	CTG	2	6	5179366	5179371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16509	NC_010334	AGC	2	6	5179410	5179415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_010334	TTA	2	6	5179426	5179431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_010334	A	6	6	5179482	5179487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_010334	A	6	6	5180979	5180984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_010334	TTA	2	6	5180990	5180995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_010334	TAC	2	6	5181005	5181010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_010334	TTAA	2	8	5181398	5181405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_010334	GCA	2	6	5181419	5181424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_010334	ACAA	2	8	5181448	5181455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16518	NC_010334	AGCCT	2	10	5181477	5181486	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16519	NC_010334	TAT	2	6	5181492	5181497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_010334	AAG	2	6	5181514	5181519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_010334	TAAG	2	8	5182483	5182490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_010334	AT	3	6	5182511	5182516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_010334	ATTA	2	8	5182596	5182603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_010334	AG	3	6	5184007	5184012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_010334	TG	3	6	5184030	5184035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_010334	TAA	2	6	5184184	5184189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_010334	ACATA	2	10	5184219	5184228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16528	NC_010334	TAA	3	9	5184258	5184266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_010334	TAA	2	6	5184286	5184291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16530	NC_010334	AG	3	6	5184294	5184299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_010334	CT	3	6	5184309	5184314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16532	NC_010334	ATT	2	6	5184376	5184381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_010334	TTTA	2	8	5184383	5184390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16534	NC_010334	AG	3	6	5184401	5184406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_010334	GCA	2	6	5184524	5184529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16536	NC_010334	TAGA	2	8	5185452	5185459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_010334	CTAG	2	8	5188076	5188083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16538	NC_010334	TAA	2	6	5188093	5188098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_010334	CAA	2	6	5188101	5188106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16540	NC_010334	AAG	2	6	5188114	5188119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_010334	AGG	2	6	5188131	5188136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_010334	ATT	2	6	5188198	5188203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_010334	TCC	2	6	5188541	5188546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16544	NC_010334	AAC	2	6	5188554	5188559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16545	NC_010334	GCC	2	6	5188579	5188584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16546	NC_010334	CCTT	2	8	5188627	5188634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16547	NC_010334	T	6	6	5188633	5188638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_010334	TTTAA	2	10	5188652	5188661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_010334	T	7	7	5188726	5188732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_010334	AATT	2	8	5188753	5188760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_010334	ACTT	2	8	5188775	5188782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16552	NC_010334	CGG	2	6	5188787	5188792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16553	NC_010334	TGC	2	6	5188796	5188801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16554	NC_010334	GC	3	6	5188800	5188805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16555	NC_010334	ATT	2	6	5189899	5189904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_010334	ATCA	2	8	5189995	5190002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16557	NC_010334	ATT	2	6	5190004	5190009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_010334	A	8	8	5190946	5190953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_010334	C	6	6	5192614	5192619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16560	NC_010334	ATAA	2	8	5192638	5192645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_010334	TA	3	6	5192749	5192754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_010334	A	6	6	5192760	5192765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_010334	AT	3	6	5192838	5192843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16564	NC_010334	A	8	8	5192894	5192901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_010334	TTAAAA	2	12	5192910	5192921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_010334	ATTC	2	8	5192939	5192946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16567	NC_010334	ATTTA	2	10	5192961	5192970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_010334	T	6	6	5193453	5193458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_010334	CAA	2	6	5193494	5193499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16570	NC_010334	GAGG	2	8	5193542	5193549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_010334	ACA	2	6	5193557	5193562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16572	NC_010334	CT	3	6	5195438	5195443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16573	NC_010334	TTAAA	2	10	5195453	5195462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_010334	TTCGA	2	10	5196307	5196316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16575	NC_010334	TAT	2	6	5196323	5196328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16576	NC_010334	GAAAC	2	10	5196332	5196341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16577	NC_010334	A	6	6	5196411	5196416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16578	NC_010334	TTTA	2	8	5198664	5198671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_010334	CTT	2	6	5198684	5198689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16580	NC_010334	CAA	2	6	5198755	5198760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16581	NC_010334	ATC	2	6	5198763	5198768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16582	NC_010334	AAT	2	6	5198803	5198808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16583	NC_010334	TAAA	2	8	5198813	5198820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_010334	A	6	6	5198825	5198830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16585	NC_010334	T	6	6	5198847	5198852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16586	NC_010334	TTA	2	6	5200281	5200286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16587	NC_010334	TTA	2	6	5200311	5200316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16588	NC_010334	CGACT	2	10	5200321	5200330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16589	NC_010334	TTA	2	6	5200715	5200720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16590	NC_010334	CAA	2	6	5200731	5200736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16591	NC_010334	ACTCAA	2	12	5200743	5200754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16592	NC_010334	TCA	2	6	5200770	5200775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16593	NC_010334	ATG	2	6	5200781	5200786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16594	NC_010334	CA	3	6	5205260	5205265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16595	NC_010334	CATTTT	2	12	5205270	5205281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16596	NC_010334	T	6	6	5205278	5205283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16597	NC_010334	TA	4	8	5205368	5205375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_010334	AGC	2	6	5205396	5205401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16599	NC_010334	AAC	2	6	5205520	5205525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16600	NC_010334	AAG	2	6	5205543	5205548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_010334	CTT	2	6	5205687	5205692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16602	NC_010334	A	7	7	5205701	5205707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16603	NC_010334	T	7	7	5205722	5205728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16604	NC_010334	CTT	2	6	5212666	5212671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16605	NC_010334	ATA	2	6	5212844	5212849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16606	NC_010334	TAT	2	6	5214581	5214586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16607	NC_010334	GTT	2	6	5214597	5214602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16608	NC_010334	CTAAT	2	10	5214623	5214632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16609	NC_010334	TTA	2	6	5214635	5214640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_010334	TCA	2	6	5214753	5214758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_010334	AAC	2	6	5214765	5214770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16612	NC_010334	ATCA	2	8	5215442	5215449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16613	NC_010334	TAT	2	6	5215451	5215456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16614	NC_010334	TTTGC	2	10	5217475	5217484	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16615	NC_010334	TA	3	6	5217552	5217557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_010334	TTA	2	6	5217564	5217569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16617	NC_010334	TGATC	2	10	5217651	5217660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16618	NC_010334	GATCA	2	10	5217753	5217762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16619	NC_010334	ATA	2	6	5217765	5217770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16620	NC_010334	TAAA	2	8	5217789	5217796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16621	NC_010334	ACA	2	6	5217849	5217854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16622	NC_010334	ATT	2	6	5218328	5218333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16623	NC_010334	ATT	2	6	5218392	5218397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16624	NC_010334	GCT	2	6	5218398	5218403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16625	NC_010334	ATT	2	6	5218405	5218410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16626	NC_010334	CAT	2	6	5218417	5218422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16627	NC_010334	TTTGAT	2	12	5218431	5218442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16628	NC_010334	TCT	2	6	5218443	5218448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16629	NC_010334	TA	3	6	5218470	5218475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16630	NC_010334	T	7	7	5218493	5218499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16631	NC_010334	CTAC	2	8	5218693	5218700	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16632	NC_010334	GAT	2	6	5218702	5218707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16633	NC_010334	ATT	2	6	5218717	5218722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16634	NC_010334	ATT	2	6	5219730	5219735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16635	NC_010334	A	6	6	5219764	5219769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16636	NC_010334	T	6	6	5219786	5219791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16637	NC_010334	TTTAAT	2	12	5219821	5219832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16638	NC_010334	TTTA	2	8	5219887	5219894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16639	NC_010334	CTTT	2	8	5219907	5219914	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16640	NC_010334	ATA	2	6	5220913	5220918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16641	NC_010334	T	7	7	5221029	5221035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16642	NC_010334	ATT	2	6	5221099	5221104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16643	NC_010334	GAC	2	6	5221108	5221113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16644	NC_010334	CAA	2	6	5221137	5221142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16645	NC_010334	ATGT	2	8	5221172	5221179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16646	NC_010334	TGG	2	6	5221185	5221190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16647	NC_010334	GGGA	2	8	5221210	5221217	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16648	NC_010334	TC	3	6	5221228	5221233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16649	NC_010334	CGAA	2	8	5221239	5221246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16650	NC_010334	A	6	6	5221273	5221278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16651	NC_010334	T	6	6	5221295	5221300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16652	NC_010334	A	6	6	5221983	5221988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16653	NC_010334	TGT	2	6	5222083	5222088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16654	NC_010334	ACT	2	6	5222096	5222101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16655	NC_010334	G	9	9	5222138	5222146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16656	NC_010334	GTT	2	6	5222161	5222166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16657	NC_010334	ATC	2	6	5222185	5222190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16658	NC_010334	T	6	6	5222336	5222341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16659	NC_010334	A	6	6	5222420	5222425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16660	NC_010334	TAGA	2	8	5222433	5222440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16661	NC_010334	GGAT	2	8	5222505	5222512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16662	NC_010334	TTG	2	6	5222534	5222539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16663	NC_010334	TC	3	6	5222559	5222564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16664	NC_010334	T	7	7	5222586	5222592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16665	NC_010334	AGT	2	6	5222654	5222659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16666	NC_010334	ATT	2	6	5222690	5222695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16667	NC_010334	CTAAT	2	10	5224085	5224094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16668	NC_010334	TA	3	6	5224122	5224127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16669	NC_010334	A	6	6	5224134	5224139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16670	NC_010334	TAA	2	6	5226579	5226584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16671	NC_010334	A	6	6	5226597	5226602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16672	NC_010334	A	6	6	5226614	5226619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16673	NC_010334	CTA	2	6	5226718	5226723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16676	NC_010334	TAT	2	6	5226799	5226804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16677	NC_010334	GATC	2	8	5226806	5226813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16678	NC_010334	ATCT	2	8	5226904	5226911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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