MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010334	A	6	6	5038505	5038510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_010334	TTAAA	2	10	5038960	5038969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_010334	TCTA	2	8	5039497	5039504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16004	NC_010334	CAG	2	6	5039574	5039579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_010334	ATCT	2	8	5039586	5039593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16006	NC_010334	GT	3	6	5039625	5039630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_010334	AACA	2	8	5039637	5039644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_010334	CATT	2	8	5039666	5039673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16009	NC_010334	GC	3	6	5039712	5039717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16010	NC_010334	TA	4	8	5040960	5040967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_010334	CAAA	2	8	5040983	5040990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16012	NC_010334	TTTA	2	8	5040999	5041006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_010334	TAA	2	6	5041983	5041988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_010334	TCAG	2	8	5042013	5042020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16015	NC_010334	ACT	2	6	5042041	5042046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_010334	ACTTA	2	10	5042053	5042062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16017	NC_010334	A	6	6	5042175	5042180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_010334	TGA	2	6	5043440	5043445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_010334	A	6	6	5043459	5043464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_010334	GA	3	6	5043526	5043531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_010334	A	6	6	5043555	5043560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_010334	TAT	2	6	5043594	5043599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_010334	TGG	2	6	5043720	5043725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_010334	ATT	2	6	5043950	5043955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_010334	A	7	7	5043957	5043963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_010334	T	7	7	5043977	5043983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_010334	CAT	2	6	5044048	5044053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_010334	TGT	2	6	5044066	5044071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_010334	ATA	2	6	5044074	5044079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_010334	CCT	2	6	5044099	5044104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16031	NC_010334	GAA	2	6	5047157	5047162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_010334	TTCT	2	8	5047190	5047197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16033	NC_010334	TCA	2	6	5047202	5047207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_010334	ACC	2	6	5047225	5047230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_010334	TGA	2	6	5047295	5047300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_010334	TCA	2	6	5047412	5047417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_010334	A	6	6	5047429	5047434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_010334	A	6	6	5047499	5047504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_010334	T	6	6	5047525	5047530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_010334	GCGGA	2	10	5047541	5047550	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16041	NC_010334	GGT	2	6	5047803	5047808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_010334	ATT	2	6	5047882	5047887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_010334	AC	3	6	5048029	5048034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_010334	AGC	2	6	5048228	5048233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_010334	ATC	2	6	5048242	5048247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_010334	ACG	2	6	5048282	5048287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_010334	TGA	2	6	5048362	5048367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_010334	CCG	2	6	5048390	5048395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16049	NC_010334	ACC	2	6	5048477	5048482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16050	NC_010334	CTC	2	6	5048596	5048601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16051	NC_010334	GAG	2	6	5048615	5048620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_010334	CCA	2	6	5048640	5048645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16053	NC_010334	GGT	2	6	5048701	5048706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_010334	ACTCC	2	10	5048719	5048728	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16055	NC_010334	CGA	2	6	5048735	5048740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_010334	CAT	2	6	5048896	5048901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_010334	GCC	2	6	5048971	5048976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16058	NC_010334	CAAT	2	8	5049018	5049025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16059	NC_010334	CAC	2	6	5049158	5049163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16060	NC_010334	TC	3	6	5049223	5049228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_010334	ACC	2	6	5049253	5049258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_010334	CTA	2	6	5049282	5049287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_010334	AGA	2	6	5049299	5049304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_010334	ACT	2	6	5049327	5049332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_010334	TCA	2	6	5049333	5049338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_010334	TCA	2	6	5049352	5049357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_010334	CAAC	2	8	5049420	5049427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_010334	CTAGC	2	10	5049434	5049443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16069	NC_010334	TC	3	6	5049452	5049457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16070	NC_010334	CCTTCA	2	12	5049658	5049669	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16071	NC_010334	CTC	2	6	5049685	5049690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16072	NC_010334	CGACT	2	10	5049765	5049774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16073	NC_010334	CTTT	2	8	5049789	5049796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16074	NC_010334	ATG	2	6	5049799	5049804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_010334	GCT	2	6	5049805	5049810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_010334	GTT	2	6	5049895	5049900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_010334	ACG	2	6	5049910	5049915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_010334	GT	3	6	5049932	5049937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_010334	GAG	2	6	5050062	5050067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_010334	TCA	2	6	5050115	5050120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_010334	GT	3	6	5050139	5050144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_010334	TCC	2	6	5050149	5050154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16083	NC_010334	GTCA	2	8	5050436	5050443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16084	NC_010334	GGA	2	6	5050459	5050464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_010334	C	6	6	5050469	5050474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16086	NC_010334	AGTT	2	8	5050523	5050530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_010334	TCGC	2	8	5050616	5050623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16090	NC_010334	CACTA	2	10	5050696	5050705	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16091	NC_010334	TAC	2	6	5050806	5050811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16093	NC_010334	GTT	2	6	5050903	5050908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16095	NC_010334	T	6	6	5051051	5051056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_010334	AAC	2	6	5051080	5051085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_010334	A	6	6	5051157	5051162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16099	NC_010334	CCT	2	6	5051274	5051279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16100	NC_010334	AGGC	2	8	5051287	5051294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16101	NC_010334	CAAA	2	8	5051333	5051340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16102	NC_010334	TCTT	2	8	5051358	5051365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16103	NC_010334	TGG	2	6	5051385	5051390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_010334	ACC	2	6	5051407	5051412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16105	NC_010334	CTTT	2	8	5051475	5051482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16106	NC_010334	TG	3	6	5051497	5051502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_010334	CAA	2	6	5051509	5051514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_010334	AGG	2	6	5051538	5051543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_010334	GT	3	6	5051679	5051684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_010334	GT	3	6	5051848	5051853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_010334	ATG	2	6	5051873	5051878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_010334	CGT	2	6	5051885	5051890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_010334	TCC	2	6	5051899	5051904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_010334	CCA	2	6	5051935	5051940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_010334	ATAAGG	2	12	5051955	5051966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_010334	GAC	2	6	5052013	5052018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_010334	GCA	2	6	5052025	5052030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_010334	TTC	2	6	5052101	5052106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_010334	GCC	2	6	5052344	5052349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_010334	C	6	6	5052408	5052413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16121	NC_010334	GCT	2	6	5052554	5052559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_010334	CTT	2	6	5052579	5052584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_010334	TCC	2	6	5052628	5052633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16124	NC_010334	CTT	2	6	5052663	5052668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_010334	CA	3	6	5052669	5052674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16126	NC_010334	CTG	2	6	5052722	5052727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_010334	ATC	2	6	5052772	5052777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16129	NC_010334	CCA	2	6	5052821	5052826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16130	NC_010334	CCT	2	6	5052877	5052882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16131	NC_010334	CCG	2	6	5052971	5052976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16132	NC_010334	GCC	2	6	5053036	5053041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16133	NC_010334	T	7	7	5053082	5053088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_010334	CTT	2	6	5053090	5053095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16165	NC_010334	ACA	2	6	5065827	5065832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16168	NC_010334	CA	3	6	5070690	5070695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16169	NC_010334	CCA	2	6	5070699	5070704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16251	NC_010334	CAT	2	6	5108471	5108476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16256	NC_010334	GATT	2	8	5109605	5109612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16257	NC_010334	CAA	2	6	5109625	5109630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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