MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010334	GAT	2	6	168312	168317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010334	AGG	2	6	169760	169765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010334	ATTG	2	8	171914	171921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010334	GCT	2	6	171974	171979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_010334	TCTCT	2	10	171985	171994	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
506	NC_010334	A	8	8	172025	172032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010334	ATA	2	6	172039	172044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010334	GT	3	6	172059	172064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010334	TAAA	2	8	172081	172088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010334	GAGAT	2	10	172102	172111	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010334	ATA	2	6	172149	172154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010334	ATCATT	2	12	172155	172166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_010334	TA	4	8	172179	172186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010334	A	7	7	172189	172195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010334	ATTA	2	8	172215	172222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010334	GATT	2	8	172247	172254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010334	TGAC	2	8	172290	172297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_010334	A	8	8	172312	172319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010334	ATC	2	6	172328	172333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_010334	GT	3	6	172348	172353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010334	GAT	2	6	172393	172398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010334	AAT	2	6	172442	172447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010334	TTA	2	6	172472	172477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010334	AACCA	2	10	173035	173044	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
525	NC_010334	GTT	3	9	173092	173100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010334	TAAA	2	8	173789	173796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010334	CGGG	2	8	173798	173805	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
528	NC_010334	ATC	2	6	173827	173832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010334	GGC	2	6	173890	173895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_010334	T	6	6	173910	173915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010334	A	6	6	174025	174030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010334	CAG	2	6	174033	174038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010334	AG	3	6	174037	174042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010334	CTG	2	6	174044	174049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_010334	GTT	2	6	179380	179385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010334	TGG	2	6	179403	179408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010334	AAT	2	6	179432	179437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010334	AGGG	2	8	179529	179536	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010334	GGT	2	6	179631	179636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010334	G	6	6	179826	179831	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010334	TAGC	2	8	179860	179867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_010334	TCG	2	6	179944	179949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010334	CAAA	2	8	181385	181392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_010334	GCTT	2	8	181403	181410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_010334	TAA	2	6	181453	181458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010334	TG	3	6	181516	181521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010334	TGA	2	6	181577	181582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010334	GGGT	2	8	181663	181670	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010334	TCCTT	2	10	181696	181705	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
550	NC_010334	GTTT	2	8	181729	181736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010334	TTTA	2	8	181743	181750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010334	A	6	6	181784	181789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010334	GAT	2	6	181801	181806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010334	ATAA	2	8	186492	186499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010334	GTA	2	6	187538	187543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010334	ATTA	2	8	187576	187583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010334	AGAAT	2	10	187613	187622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010334	CTT	2	6	187629	187634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_010334	ATC	2	6	187732	187737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010334	T	6	6	188981	188986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010334	TC	3	6	188998	189003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_010334	TGA	2	6	189037	189042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010334	T	8	8	189081	189088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010334	TGT	2	6	189860	189865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010334	ATTA	2	8	189911	189918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010334	TAA	2	6	189920	189925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010334	GGC	2	6	189934	189939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_010334	AAT	2	6	189956	189961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010334	ATT	2	6	190016	190021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010334	CG	3	6	190069	190074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_010334	TTGC	2	8	190100	190107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_010334	TAG	2	6	190130	190135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010334	AGC	2	6	190166	190171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010334	CAA	2	6	190193	190198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010334	CTTTA	2	10	190249	190258	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_010334	TTCG	2	8	190285	190292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_010334	GAA	2	6	190308	190313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_010334	TCA	2	6	190384	190389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010334	TAA	2	6	191369	191374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010334	TAA	2	6	191421	191426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010334	AAAG	2	8	191484	191491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010334	AAAG	2	8	191508	191515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010334	TCA	2	6	191548	191553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010334	CGA	2	6	191565	191570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_010334	AGC	2	6	191655	191660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010334	TTG	2	6	191665	191670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010334	A	6	6	191773	191778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010334	TA	3	6	193011	193016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010334	TCTT	2	8	193042	193049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_010334	AGAC	2	8	193058	193065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_010334	TGA	2	6	193486	193491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_010334	AGT	3	9	194343	194351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_010334	TG	3	6	194491	194496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010334	GGAG	2	8	195704	195711	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010334	ATA	2	6	196540	196545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010334	ATT	2	6	196546	196551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010334	TCAG	2	8	197560	197567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_010334	TGT	2	6	197611	197616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010334	T	6	6	198855	198860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010334	AAC	2	6	198986	198991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010334	ACA	2	6	199097	199102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010334	C	6	6	199107	199112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
608	NC_010334	TTTC	2	8	199122	199129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_010334	GCC	2	6	199143	199148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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611	NC_010334	G	6	6	199297	199302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010334	CAG	2	6	199468	199473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010334	AACT	2	8	199592	199599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_010334	CCA	2	6	199667	199672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_010334	GT	3	6	200973	200978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010334	AGT	2	6	200990	200995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010334	TTTA	2	8	201004	201011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010334	TTG	2	6	201023	201028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010334	TGA	2	6	201070	201075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010334	GTC	2	6	202397	202402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010334	CTA	2	6	202426	202431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010334	GAG	2	6	202432	202437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010334	TAG	2	6	202443	202448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010334	AG	3	6	202447	202452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010334	CGA	2	6	202453	202458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010334	T	6	6	202469	202474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010334	G	6	6	202495	202500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010334	ACT	2	6	205005	205010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010334	GTT	2	6	205019	205024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010334	A	6	6	205044	205049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_010334	TTA	2	6	205070	205075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010334	GGT	2	6	205113	205118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010334	TAA	3	9	205214	205222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010334	GCAACT	2	12	205290	205301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_010334	TTAA	2	8	205309	205316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010334	ACG	2	6	206965	206970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_010334	GAT	2	6	207013	207018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010334	ATC	2	6	207030	207035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010334	GGT	2	6	213829	213834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010334	TAC	2	6	213837	213842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_010334	T	7	7	213857	213863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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