MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010334	ATG	2	6	2632145	2632150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_010334	T	6	6	2632215	2632220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_010334	CAG	2	6	2632293	2632298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_010334	GCT	2	6	2632307	2632312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_010334	GATA	2	8	2632339	2632346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_010334	TAA	2	6	2632356	2632361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_010334	TCGT	2	8	2632375	2632382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8508	NC_010334	TG	4	8	2632396	2632403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_010334	A	6	6	2632414	2632419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_010334	TCT	2	6	2632429	2632434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_010334	CTA	2	6	2632512	2632517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_010334	TAA	2	6	2632631	2632636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_010334	CCG	2	6	2632669	2632674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_010334	TGC	2	6	2633324	2633329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_010334	ACG	2	6	2633350	2633355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_010334	CAG	2	6	2635221	2635226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_010334	CAAAA	2	10	2635240	2635249	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8518	NC_010334	GCC	2	6	2635251	2635256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_010334	AAC	2	6	2635260	2635265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_010334	GGC	2	6	2635287	2635292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_010334	CAA	2	6	2636645	2636650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_010334	TAAGG	2	10	2636725	2636734	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_010334	ACT	2	6	2636749	2636754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_010334	TAA	2	6	2636795	2636800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_010334	ACA	2	6	2636905	2636910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_010334	TTTAGT	2	12	2636913	2636924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_010334	AG	3	6	2637013	2637018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_010334	TAA	2	6	2637034	2637039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_010334	AAG	2	6	2637064	2637069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_010334	GATT	2	8	2637104	2637111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_010334	ATA	2	6	2637119	2637124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_010334	GTT	2	6	2637136	2637141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_010334	GAT	2	6	2640396	2640401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_010334	GGT	2	6	2640406	2640411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_010334	GTA	2	6	2640485	2640490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_010334	GAG	2	6	2640576	2640581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_010334	GGT	2	6	2640606	2640611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_010334	TAT	2	6	2640655	2640660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_010334	TTAA	2	8	2641505	2641512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_010334	ACA	2	6	2643209	2643214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_010334	T	6	6	2643242	2643247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_010334	GTCT	2	8	2643352	2643359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8543	NC_010334	CTAA	2	8	2643384	2643391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_010334	GAA	2	6	2643421	2643426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_010334	ATTAA	2	10	2643457	2643466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_010334	TAG	2	6	2643510	2643515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_010334	TTA	2	6	2645790	2645795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_010334	ATG	2	6	2645803	2645808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_010334	ATA	2	6	2645843	2645848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_010334	AAG	2	6	2645849	2645854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_010334	CAAT	2	8	2645857	2645864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8552	NC_010334	A	6	6	2645881	2645886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_010334	TCT	2	6	2647325	2647330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_010334	CTT	2	6	2647417	2647422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_010334	ATT	2	6	2647443	2647448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_010334	T	7	7	2647573	2647579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_010334	A	6	6	2647638	2647643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_010334	GTT	2	6	2647665	2647670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_010334	TAAA	2	8	2648930	2648937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_010334	TA	3	6	2648939	2648944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_010334	TA	3	6	2648983	2648988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_010334	T	6	6	2648991	2648996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_010334	GA	3	6	2650265	2650270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_010334	T	6	6	2650310	2650315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_010334	TAC	2	6	2650807	2650812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_010334	AT	3	6	2650827	2650832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_010334	CTG	2	6	2650843	2650848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_010334	A	6	6	2656186	2656191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_010334	GT	3	6	2656284	2656289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_010334	G	7	7	2656305	2656311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_010334	ATA	2	6	2656367	2656372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_010334	TCA	2	6	2656479	2656484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_010334	ATC	2	6	2656532	2656537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_010334	TACATC	5	30	2656538	2656567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_010334	TAC	2	6	2656600	2656605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_010334	AAC	2	6	2656643	2656648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_010334	AGT	2	6	2656712	2656717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_010334	ACG	2	6	2656730	2656735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_010334	AACT	2	8	2656746	2656753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8580	NC_010334	CA	3	6	2656910	2656915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8581	NC_010334	GC	3	6	2656916	2656921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_010334	CTG	2	6	2656988	2656993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_010334	ATG	2	6	2657147	2657152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_010334	CAA	2	6	2657157	2657162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_010334	ACT	2	6	2657195	2657200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8587	NC_010334	GTT	2	6	2657321	2657326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_010334	TTG	2	6	2657339	2657344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_010334	ATT	2	6	2657373	2657378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8591	NC_010334	GCG	2	6	2657474	2657479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_010334	AAC	2	6	2657599	2657604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_010334	ACT	2	6	2657772	2657777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8596	NC_010334	ACA	2	6	2657987	2657992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_010334	ACA	2	6	2657996	2658001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_010334	AATA	2	8	2658096	2658103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_010334	TAC	2	6	2658165	2658170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_010334	AAT	2	6	2658201	2658206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_010334	GC	3	6	2658252	2658257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_010334	TCT	2	6	2658454	2658459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_010334	CGG	2	6	2658467	2658472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_010334	TAG	2	6	2658657	2658662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_010334	AT	3	6	2658674	2658679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_010334	AAAGC	2	10	2658703	2658712	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8607	NC_010334	TAG	2	6	2658805	2658810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_010334	TTA	2	6	2658832	2658837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_010334	TTA	2	6	2660165	2660170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_010334	TATTG	2	10	2660210	2660219	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_010334	CTT	3	9	2660472	2660480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_010334	ATA	2	6	2660541	2660546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_010334	CAGC	2	8	2660560	2660567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8614	NC_010334	TCAA	2	8	2661057	2661064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8615	NC_010334	T	6	6	2661129	2661134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_010334	GCCTT	2	10	2661155	2661164	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8617	NC_010334	AAT	2	6	2661272	2661277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_010334	TAA	2	6	2661287	2661292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_010334	CAG	2	6	2664518	2664523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_010334	T	7	7	2664568	2664574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_010334	T	6	6	2664614	2664619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_010334	AAC	2	6	2664630	2664635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_010334	TAA	2	6	2664641	2664646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_010334	AAT	3	9	2665210	2665218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_010334	AGAA	2	8	2665219	2665226	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_010334	TAG	2	6	2668610	2668615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_010334	GA	4	8	2668632	2668639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_010334	ATC	2	6	2669433	2669438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_010334	AAT	2	6	2670455	2670460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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