MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010334	CTAA	2	8	1858047	1858054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_010334	CGG	2	6	1858164	1858169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_010334	ATGT	2	8	1858220	1858227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010334	AAGC	2	8	1858240	1858247	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_010334	CGG	2	6	1858349	1858354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_010334	ATGT	2	8	1858405	1858412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010334	AAGC	2	8	1858425	1858432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_010334	CGG	2	6	1858534	1858539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_010334	TGA	2	6	1858587	1858592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010334	AAGC	2	8	1858608	1858615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_010334	AGA	2	6	1858695	1858700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010334	AGC	2	6	1858734	1858739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_010334	CGG	2	6	1858741	1858746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_010334	CGG	2	6	1858857	1858862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_010334	TGA	2	6	1858911	1858916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010334	AAGC	2	8	1858933	1858940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_010334	AGA	2	6	1859020	1859025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010334	AGC	2	6	1859059	1859064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_010334	CGG	2	6	1859066	1859071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_010334	CGG	2	6	1859182	1859187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_010334	TGA	2	6	1859235	1859240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010334	AAGC	2	8	1859256	1859263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_010334	AGA	2	6	1859343	1859348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010334	AGC	2	6	1859382	1859387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_010334	CGG	2	6	1859389	1859394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_010334	CGG	2	6	1859505	1859510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010334	ATGT	2	8	1859561	1859568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010334	AAGC	2	8	1859581	1859588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_010334	CGG	2	6	1859690	1859695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_010334	TAA	2	6	1859749	1859754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_010334	CCA	2	6	1859845	1859850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_010334	GAT	2	6	1859864	1859869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_010334	ACC	2	6	1859882	1859887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_010334	GGT	2	6	1859892	1859897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010334	T	7	7	1859897	1859903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_010334	TTTGA	2	10	1859949	1859958	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_010334	TAC	2	6	1860004	1860009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_010334	GCA	2	6	1860039	1860044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_010334	TATT	2	8	1860088	1860095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010334	GTT	2	6	1860132	1860137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010334	TGAG	2	8	1860209	1860216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_010334	TGT	2	6	1860291	1860296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010334	ACT	2	6	1862155	1862160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010334	CAGT	2	8	1862161	1862168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_010334	AATC	2	8	1862210	1862217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_010334	TAAA	2	8	1862227	1862234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_010334	TATT	2	8	1862242	1862249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010334	TGA	2	6	1862282	1862287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_010334	GCAG	2	8	1862288	1862295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_010334	GA	3	6	1864405	1864410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_010334	ATC	2	6	1864457	1864462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_010334	T	7	7	1865997	1866003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010334	ATC	2	6	1866011	1866016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010334	TAA	2	6	1866025	1866030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010334	TCA	2	6	1866091	1866096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_010334	TTTA	2	8	1866097	1866104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010334	AAT	2	6	1866602	1866607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010334	TG	3	6	1868157	1868162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_010334	TTA	2	6	1868164	1868169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_010334	TAA	2	6	1868240	1868245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010334	TTA	2	6	1869154	1869159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_010334	TTTA	2	8	1869259	1869266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010334	T	6	6	1870605	1870610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_010334	TTGG	2	8	1870942	1870949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_010334	GAT	2	6	1870962	1870967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_010334	T	6	6	1871046	1871051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_010334	TGAT	2	8	1871092	1871099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_010334	TCT	2	6	1871620	1871625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_010334	AGAA	2	8	1871628	1871635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010334	CTTTT	2	10	1871651	1871660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6071	NC_010334	AATT	2	8	1872396	1872403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010334	CAT	2	6	1873183	1873188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_010334	T	6	6	1873445	1873450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010334	TTG	2	6	1873460	1873465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_010334	TCT	2	6	1873467	1873472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_010334	T	7	7	1874606	1874612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_010334	TTA	2	6	1874622	1874627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010334	G	6	6	1874647	1874652	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_010334	AAG	2	6	1875889	1875894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_010334	A	6	6	1879078	1879083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_010334	T	6	6	1879101	1879106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_010334	T	6	6	1879136	1879141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_010334	CTG	2	6	1879190	1879195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_010334	AGC	2	6	1879204	1879209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_010334	TGA	2	6	1879222	1879227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_010334	T	6	6	1879251	1879256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_010334	TCA	2	6	1880028	1880033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_010334	TG	3	6	1881036	1881041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_010334	T	6	6	1881716	1881721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_010334	TCAAA	2	10	1881727	1881736	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6091	NC_010334	TTAT	2	8	1883224	1883231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010334	ATC	2	6	1885756	1885761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_010334	CAT	2	6	1885824	1885829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_010334	AT	3	6	1885919	1885924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010334	TTA	2	6	1885930	1885935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010334	T	6	6	1886200	1886205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010334	CAA	2	6	1886313	1886318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_010334	TTGTT	2	10	1886336	1886345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010334	T	6	6	1886360	1886365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_010334	ATC	2	6	1886698	1886703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_010334	TACA	2	8	1886720	1886727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_010334	AGT	2	6	1886780	1886785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010334	T	6	6	1886808	1886813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_010334	TG	3	6	1887330	1887335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_010334	TGT	2	6	1887337	1887342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_010334	TAA	2	6	1887396	1887401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_010334	A	7	7	1887441	1887447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_010334	TTA	2	6	1887464	1887469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_010334	TC	3	6	1888420	1888425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_010334	AGT	2	6	1888435	1888440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_010334	TAA	2	6	1890089	1890094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010334	T	6	6	1890221	1890226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_010334	GTA	2	6	1890234	1890239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_010334	ATT	2	6	1890728	1890733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010334	T	6	6	1890732	1890737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_010334	GT	3	6	1890780	1890785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010334	AGT	2	6	1892033	1892038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_010334	T	7	7	1893356	1893362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_010334	T	6	6	1895646	1895651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_010334	AG	3	6	1895694	1895699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_010334	CGAG	2	8	1895796	1895803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_010334	CTAT	2	8	1895807	1895814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6123	NC_010334	TTAA	2	8	1895824	1895831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_010334	CTT	2	6	1896101	1896106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_010334	TTAACT	2	12	1896160	1896171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6126	NC_010334	CAAA	2	8	1896250	1896257	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_010334	CG	3	6	1896620	1896625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_010334	TA	3	6	1896642	1896647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010334	GAAG	2	8	1896649	1896656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_010334	T	8	8	1897128	1897135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_010334	CTA	2	6	1897138	1897143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6133	NC_010334	TAT	2	6	1897202	1897207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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