MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010334	TGA	2	6	1665608	1665613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010334	AGA	2	6	1665656	1665661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010334	TCA	2	6	1665706	1665711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_010334	TTTG	2	8	1665756	1665763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_010334	TG	3	6	1665826	1665831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_010334	GTT	2	6	1665874	1665879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_010334	TTTA	2	8	1665915	1665922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_010334	A	6	6	1665930	1665935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010334	CGT	2	6	1665980	1665985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_010334	GT	3	6	1665996	1666001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_010334	ATTG	2	8	1666044	1666051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_010334	TTTG	2	8	1666129	1666136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_010334	T	6	6	1666137	1666142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010334	TA	3	6	1666314	1666319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_010334	CAC	2	6	1666365	1666370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_010334	AAG	2	6	1669423	1669428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_010334	GAA	2	6	1669473	1669478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_010334	A	6	6	1669508	1669513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010334	TTG	2	6	1669559	1669564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_010334	GCA	2	6	1669698	1669703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_010334	ATG	2	6	1670317	1670322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_010334	T	6	6	1670334	1670339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_010334	A	6	6	1670455	1670460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_010334	A	6	6	1672579	1672584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_010334	ATA	2	6	1672702	1672707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_010334	GAA	2	6	1672803	1672808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010334	ATC	2	6	1672824	1672829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010334	ACC	2	6	1672917	1672922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_010334	ATC	2	6	1672929	1672934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_010334	GAA	2	6	1672949	1672954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_010334	CCA	2	6	1672965	1672970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_010334	AATG	2	8	1677268	1677275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_010334	CTAGT	2	10	1677291	1677300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5534	NC_010334	GTCCA	2	10	1677317	1677326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5535	NC_010334	AGT	2	6	1677347	1677352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_010334	CAA	2	6	1677386	1677391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_010334	A	7	7	1678046	1678052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_010334	TTTTAT	2	12	1678068	1678079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_010334	ATG	2	6	1679223	1679228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_010334	GAG	2	6	1679292	1679297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_010334	TAAA	2	8	1681835	1681842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_010334	AGCT	2	8	1681847	1681854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_010334	T	7	7	1682014	1682020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_010334	GCG	2	6	1684225	1684230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_010334	TAT	2	6	1687433	1687438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_010334	GAA	2	6	1687468	1687473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_010334	AAAG	2	8	1687543	1687550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_010334	TTCA	2	8	1687657	1687664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_010334	GGC	2	6	1687716	1687721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_010334	ACT	2	6	1688771	1688776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_010334	T	7	7	1688784	1688790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010334	TAA	2	6	1688832	1688837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_010334	TAA	2	6	1694798	1694803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010334	TTA	2	6	1694836	1694841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010334	TATC	2	8	1695916	1695923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_010334	AGATA	2	10	1695978	1695987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_010334	TG	3	6	1695998	1696003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010334	AT	4	8	1696110	1696117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_010334	TTG	2	6	1696145	1696150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_010334	TAGTA	2	10	1696268	1696277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010334	GCA	2	6	1697134	1697139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_010334	TGA	2	6	1697186	1697191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010334	ATT	2	6	1697230	1697235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_010334	C	6	6	1697303	1697308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5565	NC_010334	TTA	2	6	1697317	1697322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010334	GTT	2	6	1697365	1697370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_010334	GCT	2	6	1698782	1698787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_010334	AT	3	6	1700173	1700178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_010334	TCA	2	6	1701108	1701113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_010334	ATG	2	6	1701116	1701121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_010334	TAT	2	6	1701142	1701147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010334	AT	3	6	1701150	1701155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_010334	ATTT	2	8	1701195	1701202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010334	TTCA	2	8	1701218	1701225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_010334	ATT	2	6	1701244	1701249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_010334	TAA	2	6	1701290	1701295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_010334	TTA	2	6	1701304	1701309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010334	CCT	2	6	1701337	1701342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_010334	TTA	2	6	1701358	1701363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_010334	TTA	2	6	1701373	1701378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_010334	TTAA	2	8	1701388	1701395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010334	ATT	2	6	1701399	1701404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_010334	TTA	2	6	1701455	1701460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010334	TTA	2	6	1701468	1701473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010334	TTA	2	6	1701510	1701515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_010334	TTA	2	6	1701523	1701528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_010334	TAT	2	6	1701569	1701574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_010334	AAT	2	6	1701596	1701601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_010334	GTAA	2	8	1701634	1701641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_010334	TGG	3	9	1701663	1701671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_010334	TGT	2	6	1701673	1701678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_010334	T	6	6	1701678	1701683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_010334	ACA	2	6	1701710	1701715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_010334	AATT	2	8	1701756	1701763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_010334	ATA	2	6	1701798	1701803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_010334	TAA	2	6	1701810	1701815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010334	ACTA	2	8	1701875	1701882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_010334	ACTA	2	8	1701913	1701920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_010334	ATA	2	6	1701935	1701940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_010334	GAGAT	2	10	1703527	1703536	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_010334	AGT	2	6	1704250	1704255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010334	GCT	3	9	1704268	1704276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010334	ATT	2	6	1705765	1705770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_010334	AGA	2	6	1706407	1706412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_010334	CAA	2	6	1708686	1708691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_010334	CAA	2	6	1708754	1708759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_010334	AG	3	6	1708790	1708795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010334	AGC	2	6	1708798	1708803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_010334	GCG	2	6	1708858	1708863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_010334	CTAC	2	8	1708889	1708896	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_010334	GGT	2	6	1708904	1708909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010334	TTA	2	6	1708977	1708982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_010334	TTCC	2	8	1708995	1709002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_010334	CTCC	2	8	1709242	1709249	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5615	NC_010334	ATC	2	6	1709343	1709348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_010334	CTT	2	6	1709380	1709385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_010334	TAC	2	6	1709416	1709421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_010334	AATG	2	8	1709480	1709487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_010334	AGG	2	6	1709522	1709527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010334	AGA	2	6	1709530	1709535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_010334	TTG	2	6	1709549	1709554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_010334	AAACTA	2	12	1709594	1709605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5623	NC_010334	ATT	2	6	1709666	1709671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010334	TA	3	6	1714667	1714672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010334	TGA	2	6	1714756	1714761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_010334	ATGC	2	8	1714826	1714833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5627	NC_010334	T	6	6	1714881	1714886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_010334	GTA	2	6	1714958	1714963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_010334	TCA	2	6	1716174	1716179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_010334	CCT	2	6	1716232	1716237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5632	NC_010334	GGC	2	6	1716393	1716398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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