MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010334	CG	3	6	1547310	1547315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_010334	GCT	2	6	1547427	1547432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_010334	TA	3	6	1547518	1547523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010334	ACT	2	6	1548259	1548264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_010334	AGT	2	6	1548283	1548288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010334	GAAAA	2	10	1548348	1548357	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010334	CT	3	6	1550083	1550088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_010334	CTG	2	6	1550122	1550127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_010334	CTG	2	6	1550152	1550157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_010334	GCT	2	6	1550168	1550173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_010334	ATTA	2	8	1550174	1550181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010334	T	6	6	1550187	1550192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_010334	TAA	2	6	1550226	1550231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010334	TGA	2	6	1550275	1550280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010334	TG	3	6	1550290	1550295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_010334	TG	3	6	1550427	1550432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_010334	TTA	2	6	1550459	1550464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_010334	AGC	2	6	1550587	1550592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_010334	ATC	2	6	1550664	1550669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_010334	TCA	2	6	1550769	1550774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_010334	GGT	2	6	1550812	1550817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_010334	AAG	2	6	1550827	1550832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_010334	TTTA	2	8	1550839	1550846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_010334	AG	3	6	1550850	1550855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010334	A	7	7	1551918	1551924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_010334	GCA	2	6	1551949	1551954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_010334	TC	3	6	1554723	1554728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_010334	TAT	2	6	1554736	1554741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_010334	TGT	2	6	1554743	1554748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010334	T	9	9	1554844	1554852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010334	AG	3	6	1554906	1554911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_010334	CTT	2	6	1554968	1554973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_010334	CCG	2	6	1554976	1554981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_010334	CTT	2	6	1555004	1555009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_010334	AAG	2	6	1555041	1555046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010334	T	6	6	1555064	1555069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_010334	TGGT	2	8	1555099	1555106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_010334	TTG	2	6	1555128	1555133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_010334	ATT	2	6	1555140	1555145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010334	ATAACA	2	12	1558615	1558626	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5041	NC_010334	CTC	2	6	1560517	1560522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_010334	TGT	2	6	1560648	1560653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_010334	C	6	6	1560661	1560666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5044	NC_010334	TGA	2	6	1560732	1560737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_010334	TA	3	6	1560856	1560861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_010334	GTT	2	6	1560869	1560874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_010334	CTTG	2	8	1560880	1560887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_010334	A	6	6	1563227	1563232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_010334	T	6	6	1563261	1563266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_010334	TAT	2	6	1564027	1564032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_010334	TGCT	2	8	1564041	1564048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_010334	TTGT	2	8	1564133	1564140	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_010334	T	7	7	1564165	1564171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010334	TAT	2	6	1565010	1565015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_010334	TTTA	2	8	1566546	1566553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010334	AAT	2	6	1566606	1566611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_010334	AGT	2	6	1566646	1566651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010334	TAG	2	6	1566686	1566691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010334	AGC	2	6	1566735	1566740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_010334	TG	3	6	1566796	1566801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_010334	T	6	6	1566860	1566865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_010334	TC	4	8	1566909	1566916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_010334	TG	3	6	1567084	1567089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_010334	TTA	2	6	1567284	1567289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_010334	T	7	7	1567703	1567709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_010334	GTAT	2	8	1568543	1568550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010334	TTG	2	6	1568577	1568582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_010334	TCAATA	2	12	1568589	1568600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5069	NC_010334	ATT	2	6	1569635	1569640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010334	TGA	2	6	1569707	1569712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010334	CAC	2	6	1569745	1569750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_010334	G	15	15	1569787	1569801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_010334	GAA	2	6	1569856	1569861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_010334	AGAC	2	8	1569878	1569885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_010334	TAG	3	9	1569918	1569926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_010334	CAAAA	2	10	1570160	1570169	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_010334	A	6	6	1570166	1570171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_010334	AGA	2	6	1570559	1570564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_010334	AAG	2	6	1570623	1570628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_010334	ATG	3	9	1570630	1570638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_010334	CAC	2	6	1570662	1570667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_010334	TGT	2	6	1570726	1570731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_010334	ACG	2	6	1570786	1570791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_010334	AAC	2	6	1570847	1570852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_010334	AGC	2	6	1570912	1570917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_010334	TAA	2	6	1570939	1570944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_010334	A	6	6	1570961	1570966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010334	TAC	2	6	1571109	1571114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_010334	A	6	6	1571239	1571244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010334	CTA	2	6	1571271	1571276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_010334	TAT	2	6	1571307	1571312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_010334	TTA	2	6	1572309	1572314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_010334	AACTA	2	10	1572363	1572372	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_010334	ACA	2	6	1572373	1572378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_010334	TG	3	6	1572426	1572431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010334	ATT	2	6	1572435	1572440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_010334	TAA	2	6	1572451	1572456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010334	GTT	2	6	1572459	1572464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_010334	ATT	2	6	1572473	1572478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_010334	TAT	2	6	1572494	1572499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010334	TAC	2	6	1572514	1572519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_010334	AGT	2	6	1572523	1572528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_010334	TGC	2	6	1572532	1572537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_010334	ATT	2	6	1572555	1572560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_010334	TGA	2	6	1572583	1572588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010334	AAT	2	6	1572589	1572594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_010334	GT	3	6	1572598	1572603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_010334	ATG	2	6	1572622	1572627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_010334	AGA	2	6	1572674	1572679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010334	AGG	2	6	1572706	1572711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_010334	CTG	2	6	1572720	1572725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_010334	AAG	2	6	1572727	1572732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_010334	TATT	2	8	1572907	1572914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_010334	AG	3	6	1572930	1572935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_010334	ATA	2	6	1572952	1572957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010334	GATG	2	8	1573031	1573038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010334	TCA	2	6	1573087	1573092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_010334	T	6	6	1573107	1573112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010334	GAAAT	2	10	1573184	1573193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010334	GTTGA	2	10	1573204	1573213	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010334	TA	3	6	1573219	1573224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_010334	TG	3	6	1573829	1573834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_010334	GT	3	6	1573986	1573991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_010334	ATT	2	6	1575607	1575612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_010334	AGA	2	6	1575665	1575670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010334	TA	3	6	1576020	1576025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010334	T	6	6	1576056	1576061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_010334	TTA	2	6	1576084	1576089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_010334	TTTA	2	8	1577863	1577870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_010334	T	6	6	1581156	1581161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_010334	T	6	6	1582372	1582377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_010334	TA	3	6	1582393	1582398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_010334	ACG	2	6	1582439	1582444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5139	NC_010334	TGG	3	9	1582889	1582897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5146	NC_010334	ATTTT	2	10	1583175	1583184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_010334	T	7	7	1583209	1583215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_010334	AAG	2	6	1583217	1583222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_010334	A	6	6	1583250	1583255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_010334	TGG	2	6	1583316	1583321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_010334	TGTGG	2	10	1583802	1583811	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5175	NC_010334	TCT	2	6	1586652	1586657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5202	NC_010334	ATG	2	6	1596394	1596399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_010334	ATA	2	6	1614798	1614803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_010334	CAAT	2	8	1614933	1614940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5250	NC_010334	AC	3	6	1615262	1615267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5251	NC_010334	ATA	2	6	1615314	1615319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_010334	G	6	6	1615372	1615377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_010334	A	6	6	1615414	1615419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_010334	TGA	2	6	1615681	1615686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_010334	TAA	2	6	1615708	1615713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_010334	TA	3	6	1615733	1615738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_010334	GACA	2	8	1615759	1615766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5262	NC_010334	A	6	6	1615789	1615794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_010334	ATT	2	6	1615807	1615812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_010334	T	6	6	1615811	1615816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_010334	ACCAA	2	10	1615844	1615853	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5295	NC_010334	GCC	2	6	1619725	1619730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5362	NC_010334	ATTT	2	8	1631659	1631666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5364	NC_010334	TTG	2	6	1631715	1631720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5380	NC_010334	GTTAA	2	10	1633332	1633341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_010334	GCT	2	6	1633345	1633350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5383	NC_010334	TTG	2	6	1633502	1633507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5387	NC_010334	GAAT	2	8	1634415	1634422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_010334	ATTTT	2	10	1634452	1634461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_010334	AAGT	2	8	1634524	1634531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_010334	AGC	2	6	1635113	1635118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5392	NC_010334	AGGGC	2	10	1635731	1635740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5393	NC_010334	T	7	7	1635772	1635778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_010334	GAG	2	6	1637573	1637578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5396	NC_010334	A	6	6	1637718	1637723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_010334	T	6	6	1637739	1637744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_010334	CTG	2	6	1638916	1638921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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