MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010334	TAGC	2	8	1404777	1404784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_010334	AG	3	6	1404821	1404826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_010334	CGC	2	6	1404843	1404848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_010334	GTGG	2	8	1406312	1406319	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_010334	A	7	7	1406326	1406332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_010334	GCAAA	2	10	1406347	1406356	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4507	NC_010334	ATT	2	6	1406379	1406384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_010334	CTTT	2	8	1406439	1406446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_010334	T	6	6	1406444	1406449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_010334	ATA	2	6	1406452	1406457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_010334	AAC	2	6	1407254	1407259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_010334	TAT	2	6	1408514	1408519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_010334	AT	3	6	1408594	1408599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_010334	AGTG	2	8	1408608	1408615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_010334	AAAAT	2	10	1408704	1408713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_010334	C	6	6	1409609	1409614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4517	NC_010334	TC	3	6	1409675	1409680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_010334	TGA	2	6	1409709	1409714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_010334	T	6	6	1409725	1409730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_010334	ATA	2	6	1409773	1409778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_010334	ACTCT	2	10	1409782	1409791	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4522	NC_010334	TA	3	6	1409825	1409830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_010334	ATT	2	6	1410894	1410899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_010334	CT	3	6	1411070	1411075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_010334	AGC	2	6	1411090	1411095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_010334	AAT	2	6	1411141	1411146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_010334	GTT	2	6	1411292	1411297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_010334	GTG	2	6	1411330	1411335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_010334	TGC	2	6	1411366	1411371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_010334	TAA	2	6	1411414	1411419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_010334	TTG	2	6	1411426	1411431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_010334	CTG	2	6	1411461	1411466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_010334	AAT	2	6	1411537	1411542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_010334	ATTT	2	8	1411570	1411577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_010334	TTA	2	6	1414765	1414770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_010334	TAA	2	6	1414789	1414794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_010334	GTC	2	6	1414919	1414924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_010334	TGT	2	6	1414988	1414993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_010334	TAAC	2	8	1415000	1415007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_010334	TAA	2	6	1415105	1415110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_010334	GCA	2	6	1415140	1415145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_010334	TAC	2	6	1415174	1415179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_010334	GC	3	6	1415498	1415503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_010334	GC	3	6	1415516	1415521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_010334	TGT	2	6	1415532	1415537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_010334	AGG	2	6	1415563	1415568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_010334	TATT	2	8	1415582	1415589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_010334	GTGG	2	8	1415610	1415617	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_010334	GCT	2	6	1416529	1416534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_010334	ATT	2	6	1418287	1418292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_010334	GTC	2	6	1418295	1418300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_010334	ATC	2	6	1418416	1418421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_010334	GTTA	2	8	1420322	1420329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_010334	AAG	2	6	1420335	1420340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_010334	T	6	6	1420352	1420357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_010334	TAA	2	6	1420426	1420431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_010334	TAG	2	6	1420436	1420441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_010334	GGC	2	6	1422221	1422226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_010334	A	7	7	1422269	1422275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_010334	T	6	6	1422295	1422300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_010334	AAG	2	6	1422764	1422769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_010334	TTAAA	2	10	1423692	1423701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_010334	A	6	6	1423699	1423704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_010334	TTG	2	6	1424533	1424538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_010334	TTA	2	6	1424539	1424544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_010334	TAAA	2	8	1424576	1424583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_010334	AGTA	2	8	1426457	1426464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_010334	ATT	2	6	1427611	1427616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_010334	AGA	2	6	1427617	1427622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_010334	T	8	8	1427646	1427653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_010334	ATT	2	6	1428802	1428807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_010334	T	6	6	1430811	1430816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_010334	TAA	2	6	1431422	1431427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_010334	A	7	7	1431450	1431456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_010334	T	7	7	1431471	1431477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4585	NC_010334	TTG	2	6	1431599	1431604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_010334	ATCGC	2	10	1431633	1431642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4587	NC_010334	TAG	2	6	1431712	1431717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_010334	GAT	2	6	1431742	1431747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4595	NC_010334	AACTT	2	10	1433000	1433009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4596	NC_010334	A	6	6	1433457	1433462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_010334	T	7	7	1433486	1433492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_010334	T	6	6	1433550	1433555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_010334	TG	3	6	1433573	1433578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_010334	AT	4	8	1433615	1433622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_010334	A	6	6	1433634	1433639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_010334	TCGGC	2	10	1435621	1435630	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4603	NC_010334	GTC	2	6	1435775	1435780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4605	NC_010334	ATC	2	6	1435851	1435856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_010334	TA	3	6	1436521	1436526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_010334	TAA	2	6	1437380	1437385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_010334	A	6	6	1437384	1437389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_010334	TC	3	6	1437412	1437417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_010334	TAAA	2	8	1438097	1438104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_010334	GAT	2	6	1438110	1438115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_010334	T	6	6	1438183	1438188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_010334	TGAG	2	8	1438225	1438232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_010334	TTTG	2	8	1438382	1438389	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_010334	A	6	6	1439463	1439468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_010334	GTTTTT	2	12	1439485	1439496	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4618	NC_010334	GAG	2	6	1439746	1439751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_010334	TCTT	2	8	1439757	1439764	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_010334	TGAA	2	8	1439882	1439889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_010334	TTTTG	2	10	1439901	1439910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_010334	TTA	2	6	1439954	1439959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_010334	CTG	2	6	1439988	1439993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_010334	GCA	2	6	1440000	1440005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4626	NC_010334	ATTT	2	8	1440083	1440090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_010334	GTG	2	6	1440095	1440100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_010334	GT	3	6	1440131	1440136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_010334	GTCC	2	8	1440210	1440217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_010334	ATTT	2	8	1440286	1440293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_010334	GTG	2	6	1440298	1440303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4899	NC_010334	T	6	6	1518580	1518585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4900	NC_010334	TTTG	2	8	1518596	1518603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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