MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 1365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010102	AGAC	2	8	240	247	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010102	CTGT	2	8	8753	8760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010102	TTAT	2	8	23355	23362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010102	TGCT	2	8	30631	30638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010102	GTTA	2	8	33440	33447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010102	GGTC	2	8	33588	33595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010102	TAAA	2	8	33629	33636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010102	CTTA	2	8	35033	35040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010102	AACG	2	8	40303	40310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010102	TGAC	2	8	40387	40394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010102	TACC	2	8	42666	42673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010102	AGTA	2	8	46282	46289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010102	ATCA	2	8	46322	46329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010102	GAAA	2	8	46442	46449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010102	AGGG	2	8	46475	46482	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010102	CATA	2	8	47234	47241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010102	TCAG	2	8	47245	47252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010102	CCTG	2	8	53375	53382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010102	TACT	2	8	57827	57834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010102	TTTC	2	8	57835	57842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010102	TAAT	2	8	62833	62840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010102	AGTG	2	8	70015	70022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010102	ATTT	2	8	82394	82401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010102	TTTC	2	8	82681	82688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010102	CCCA	2	8	89340	89347	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_010102	TTTC	2	8	89793	89800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010102	ATCA	2	8	100110	100117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010102	AATG	2	8	103589	103596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010102	TTTA	2	8	110563	110570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010102	TAAA	2	8	110787	110794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010102	TCCA	2	8	115416	115423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010102	CAGG	2	8	115470	115477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010102	TTTG	2	8	127913	127920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010102	ACGA	2	8	128003	128010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010102	TTTG	2	8	128224	128231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010102	ATTT	2	8	128291	128298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010102	AGCG	2	8	129885	129892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010102	CAAA	2	8	133487	133494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010102	CTTT	2	8	133569	133576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010102	GCCG	2	8	156127	156134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010102	CTGG	2	8	159203	159210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010102	ATTT	2	8	168952	168959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010102	TCAA	2	8	169308	169315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010102	TAGA	2	8	170320	170327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010102	CGGC	2	8	174925	174932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010102	TGCC	2	8	179582	179589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010102	GAAT	2	8	193827	193834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010102	AAGT	2	8	195278	195285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010102	AATA	2	8	201456	201463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010102	CTGT	2	8	213072	213079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010102	TTTA	2	8	213130	213137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010102	CATT	2	8	214135	214142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010102	ATTA	2	8	214189	214196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010102	TTAA	2	8	214235	214242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010102	AACG	2	8	217235	217242	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010102	ACGC	2	8	217836	217843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010102	AAAT	2	8	231181	231188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010102	TTAT	2	8	231403	231410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010102	ATAA	2	8	251033	251040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010102	TCAG	2	8	254811	254818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010102	GAAA	2	8	257171	257178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010102	TTAG	2	8	263254	263261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010102	GCAG	2	8	275050	275057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010102	AATG	2	8	286313	286320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010102	ATCA	2	8	289053	289060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010102	GTAG	2	8	291512	291519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010102	CTGA	2	8	292409	292416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010102	GTAC	2	8	292493	292500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010102	CGTC	2	8	292936	292943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010102	AAAG	2	8	293059	293066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010102	AGTC	2	8	293722	293729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010102	GCTG	2	8	293740	293747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010102	CCCA	2	8	295338	295345	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_010102	CAAA	2	8	295865	295872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010102	TTTA	2	8	295883	295890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010102	CCGA	2	8	305309	305316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010102	ACAA	2	8	311501	311508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010102	TTGC	2	8	311556	311563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010102	CATT	2	8	317619	317626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010102	TAAT	2	8	317652	317659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010102	AACG	2	8	317747	317754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010102	CGGG	2	8	321484	321491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010102	TGCC	2	8	335372	335379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010102	GATT	2	8	344759	344766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010102	AAAT	2	8	356738	356745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010102	TAAG	2	8	359708	359715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010102	TCTG	2	8	367931	367938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010102	TGGC	2	8	370247	370254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010102	TAAC	2	8	384582	384589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010102	GGGC	2	8	384607	384614	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010102	GTTC	2	8	386876	386883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010102	AAAT	2	8	392105	392112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010102	CTTT	2	8	392118	392125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010102	TTAT	2	8	392126	392133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010102	CCAG	2	8	394485	394492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010102	AGCG	2	8	408887	408894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010102	AAGT	2	8	408914	408921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010102	ATTT	3	12	409029	409040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010102	TTAT	2	8	409230	409237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010102	CGGG	2	8	415499	415506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010102	ATTT	2	8	418654	418661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010102	TCCT	2	8	420280	420287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010102	TTTA	2	8	420342	420349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010102	GGTT	2	8	420422	420429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010102	GTAG	2	8	421410	421417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010102	CAGG	2	8	421544	421551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010102	CTGT	2	8	422228	422235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010102	AGAC	2	8	424489	424496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010102	AAGG	2	8	428247	428254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010102	AATA	2	8	431043	431050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010102	AACA	2	8	431101	431108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010102	GCTT	2	8	441494	441501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010102	TTAT	2	8	449221	449228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010102	CAAT	2	8	449243	449250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010102	TTGT	2	8	449348	449355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010102	GAAG	2	8	457066	457073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010102	TATT	2	8	466707	466714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010102	TTTC	2	8	466804	466811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010102	GGCG	2	8	480630	480637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010102	GCGG	2	8	483248	483255	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010102	TTCT	2	8	483524	483531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010102	GCAG	2	8	483560	483567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010102	TTTG	2	8	483631	483638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010102	CCAA	2	8	486533	486540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010102	TTAA	2	8	486543	486550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010102	AAAG	2	8	486553	486560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010102	GGGA	2	8	489198	489205	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010102	CCAG	2	8	502585	502592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010102	TTAT	2	8	502681	502688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010102	ATCT	2	8	509000	509007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010102	TTAA	2	8	509855	509862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010102	GCAA	2	8	509911	509918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010102	TGTT	2	8	513993	514000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010102	GTTT	2	8	516909	516916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010102	TTTG	2	8	528336	528343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010102	ACTT	2	8	531318	531325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010102	CAGG	2	8	531444	531451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010102	ACTC	2	8	532097	532104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010102	ATAG	2	8	532158	532165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010102	ATGG	2	8	541169	541176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010102	TAAA	2	8	541976	541983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010102	TTCA	2	8	543996	544003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010102	CTTT	2	8	544077	544084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010102	ATTT	2	8	544144	544151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010102	TGAC	2	8	553724	553731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010102	CTTT	2	8	559309	559316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010102	AGAA	2	8	559337	559344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010102	CGTG	2	8	589082	589089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010102	TGTA	2	8	603920	603927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010102	TAAT	2	8	604114	604121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010102	TTAA	2	8	604136	604143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010102	CGAT	2	8	736020	736027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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448	NC_010102	AAAT	2	8	1632391	1632398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_010102	TTAT	2	8	1791053	1791060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_010102	ATTT	2	8	1791509	1791516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010102	CTGT	2	8	1792812	1792819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_010102	CTAT	2	8	1793214	1793221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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