MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 10339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010102	AAG	2	6	586755	586760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010102	ACA	2	6	588367	588372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010102	T	6	6	588384	588389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010102	CGTG	2	8	589082	589089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_010102	GCAAA	2	10	594169	594178	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_010102	GAA	2	6	594193	594198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010102	A	6	6	594234	594239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010102	CGC	2	6	594341	594346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_010102	A	7	7	597820	597826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010102	AAG	2	6	598611	598616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010102	TCT	2	6	599886	599891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010102	GAA	2	6	601786	601791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010102	GCC	2	6	601814	601819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_010102	ACG	2	6	603805	603810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010102	AGA	3	9	603831	603839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010102	TGTA	2	8	603920	603927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010102	T	6	6	603963	603968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010102	TGT	2	6	603970	603975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010102	GA	3	6	603995	604000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010102	TCA	2	6	604008	604013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_010102	CGG	3	9	604081	604089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010102	G	6	6	604088	604093	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010102	TAAT	2	8	604114	604121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010102	TTAA	2	8	604136	604143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010102	TTA	2	6	604144	604149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010102	TAA	2	6	604181	604186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010102	ATT	2	6	604228	604233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010102	TAA	2	6	604236	604241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010102	AT	3	6	604351	604356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010102	CAT	2	6	604417	604422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010102	AT	3	6	604468	604473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010102	TAT	2	6	604493	604498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010102	AGTA	2	8	604502	604509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010102	A	6	6	605640	605645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010102	A	6	6	605661	605666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010102	T	7	7	605680	605686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010102	A	6	6	606096	606101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010102	GCA	3	9	607369	607377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010102	ACC	2	6	607422	607427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_010102	TTG	2	6	618074	618079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010102	AAT	2	6	618134	618139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010102	GAT	2	6	618245	618250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010102	TG	3	6	618308	618313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010102	TGA	2	6	621387	621392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010102	CCG	2	6	621402	621407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_010102	CGG	2	6	621414	621419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010102	TGA	2	6	621427	621432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010102	CAG	2	6	621816	621821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010102	AAC	2	6	621850	621855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010102	GCA	2	6	621997	622002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_010102	TA	3	6	622115	622120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010102	ATA	2	6	622308	622313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010102	CTGTA	2	10	624179	624188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_010102	GCCT	2	8	625225	625232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_010102	T	6	6	625232	625237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010102	A	6	6	625259	625264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010102	CCCT	2	8	627097	627104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_010102	T	6	6	627119	627124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010102	AGGG	2	8	627159	627166	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010102	AAT	2	6	628494	628499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010102	TGAT	2	8	628532	628539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010102	AC	3	6	630986	630991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_010102	T	6	6	641940	641945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010102	ATTAA	2	10	641977	641986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010102	GTC	2	6	642820	642825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010102	ACC	2	6	643268	643273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_010102	T	6	6	643343	643348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010102	TTG	2	6	643356	643361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010102	ATG	2	6	643389	643394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010102	ATC	2	6	645456	645461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010102	T	6	6	645465	645470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010102	T	6	6	645579	645584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010102	GGCCT	2	10	650007	650016	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1074	NC_010102	TA	3	6	650026	650031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010102	TTC	2	6	650040	650045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_010102	CAT	2	6	650052	650057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010102	ATT	3	9	651258	651266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010102	AGG	2	6	651295	651300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010102	CGT	2	6	651345	651350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010102	AAT	2	6	651436	651441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010102	AGC	2	6	655816	655821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_010102	GTT	2	6	655825	655830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010102	GAAC	2	8	655832	655839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_010102	TAAA	2	8	655855	655862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010102	GTT	2	6	658429	658434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010102	TGAGC	2	10	659429	659438	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_010102	TGCG	2	8	659445	659452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_010102	GGC	2	6	662085	662090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010102	TA	4	8	664542	664549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010102	TAG	2	6	664590	664595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010102	GAT	2	6	664766	664771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010102	GCC	2	6	665372	665377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_010102	AG	3	6	669381	669386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010102	GGC	2	6	675115	675120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010102	TGAAGG	2	12	678570	678581	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010102	AATG	2	8	678596	678603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010102	CGG	2	6	678652	678657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010102	ACT	2	6	678703	678708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_010102	ATT	2	6	678738	678743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010102	A	8	8	678844	678851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010102	TAA	2	6	678911	678916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010102	ATG	2	6	678926	678931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010102	TCA	2	6	678993	678998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_010102	AT	3	6	679030	679035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010102	A	6	6	679075	679080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010102	T	6	6	680442	680447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010102	ACG	2	6	680472	680477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010102	AC	3	6	681611	681616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_010102	AAGC	2	8	681624	681631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_010102	ATT	3	9	683377	683385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010102	AGTT	2	8	683399	683406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_010102	TTA	2	6	683420	683425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010102	CTG	2	6	685789	685794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_010102	ATT	2	6	685868	685873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010102	TA	3	6	685892	685897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_010102	ACT	2	6	686104	686109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_010102	CAA	2	6	691020	691025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010102	TGA	2	6	692149	692154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010102	TCT	2	6	692788	692793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_010102	ACG	2	6	693444	693449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010102	AGG	2	6	693467	693472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010102	GGCGC	2	10	698448	698457	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_010102	GCTTG	2	10	698464	698473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_010102	TTA	2	6	699139	699144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010102	ATT	2	6	699150	699155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010102	AGT	2	6	699231	699236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010102	AAC	2	6	699283	699288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010102	GA	3	6	699296	699301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010102	T	6	6	699342	699347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010102	TGC	2	6	699383	699388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010102	TTA	2	6	699436	699441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010102	ATT	2	6	699467	699472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010102	ATT	2	6	699478	699483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010102	ATTT	2	8	699492	699499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_010102	TTA	2	6	699506	699511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_010102	AAC	2	6	699691	699696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_010102	TGG	3	9	699841	699849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_010102	GT	3	6	867143	867148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_010102	AATT	2	8	867161	867168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_010102	ATGA	2	8	869234	869241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_010102	TAA	2	6	875817	875822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_010102	TGT	2	6	875851	875856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_010102	TTA	2	6	878188	878193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1418	NC_010102	AAAT	2	8	878288	878295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_010102	ACT	2	6	878308	878313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_010102	ATT	2	6	878456	878461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_010102	TATTT	2	10	883397	883406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_010102	CAT	2	6	886636	886641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_010102	AT	3	6	887924	887929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_010102	T	7	7	887964	887970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_010102	T	7	7	889037	889043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_010102	AAC	2	6	895236	895241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_010102	CG	3	6	899974	899979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1445	NC_010102	TAT	2	6	899980	899985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_010102	TTG	2	6	903208	903213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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