MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 10339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010102	AACC	2	8	4720198	4720205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_010102	TCC	2	6	4721760	4721765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_010102	TC	3	6	4723931	4723936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_010102	AAG	2	6	4727291	4727296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_010102	AAAAT	2	10	4727567	4727576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_010102	ATT	2	6	4727578	4727583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_010102	G	8	8	4727610	4727617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_010102	TTA	2	6	4727618	4727623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_010102	AAT	2	6	4727637	4727642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_010102	GTT	2	6	4727737	4727742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_010102	GGC	2	6	4728404	4728409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_010102	CAT	2	6	4728449	4728454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_010102	GAT	2	6	4729519	4729524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_010102	CGG	2	6	4729580	4729585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_010102	CAT	2	6	4731074	4731079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_010102	AAT	2	6	4731609	4731614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_010102	ATA	2	6	4731666	4731671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_010102	ATAA	2	8	4731682	4731689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_010102	ATTT	2	8	4732225	4732232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_010102	ACC	2	6	4732248	4732253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_010102	TAT	2	6	4732358	4732363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_010102	TGT	2	6	4733624	4733629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_010102	GGC	2	6	4733635	4733640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_010102	AAGCG	2	10	4733702	4733711	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10025	NC_010102	GGC	2	6	4737118	4737123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_010102	ACA	2	6	4738699	4738704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_010102	GTG	2	6	4738705	4738710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_010102	TCG	2	6	4738724	4738729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_010102	GCC	2	6	4738811	4738816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10030	NC_010102	TTA	2	6	4738908	4738913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_010102	GAT	2	6	4738975	4738980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_010102	CGA	2	6	4738983	4738988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_010102	A	7	7	4739038	4739044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_010102	GCC	2	6	4741258	4741263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_010102	CCG	2	6	4741348	4741353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_010102	ATG	2	6	4741384	4741389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10038	NC_010102	GAT	2	6	4742522	4742527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_010102	TTC	2	6	4745862	4745867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_010102	A	6	6	4745880	4745885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_010102	CTG	2	6	4747597	4747602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_010102	ATT	2	6	4747624	4747629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_010102	T	7	7	4747864	4747870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_010102	CA	3	6	4747888	4747893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_010102	CAA	2	6	4747946	4747951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_010102	AGG	2	6	4748022	4748027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_010102	GTTC	2	8	4748054	4748061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_010102	TTG	2	6	4748091	4748096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_010102	TAG	2	6	4748145	4748150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_010102	ACGA	2	8	4748258	4748265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_010102	GATGT	2	10	4748830	4748839	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_010102	TTA	2	6	4748875	4748880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_010102	TAT	2	6	4748883	4748888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_010102	GAT	2	6	4749163	4749168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_010102	CGAG	2	8	4749175	4749182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_010102	TTA	2	6	4749238	4749243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_010102	AGG	2	6	4749257	4749262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_010102	GTT	2	6	4749841	4749846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_010102	GAA	2	6	4749885	4749890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_010102	CG	3	6	4749931	4749936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_010102	TA	3	6	4749941	4749946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_010102	ATT	2	6	4749968	4749973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_010102	AAT	2	6	4750028	4750033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_010102	T	7	7	4750052	4750058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_010102	TCTG	2	8	4750088	4750095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_010102	ATTT	2	8	4750109	4750116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_010102	TAA	2	6	4750122	4750127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_010102	ATTT	2	8	4750132	4750139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_010102	GCC	2	6	4750272	4750277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10073	NC_010102	TATG	2	8	4754497	4754504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_010102	TGTA	2	8	4754534	4754541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_010102	AT	3	6	4754657	4754662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_010102	GAG	2	6	4754680	4754685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_010102	C	6	6	4756127	4756132	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10078	NC_010102	G	6	6	4756144	4756149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_010102	ATG	2	6	4757458	4757463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10081	NC_010102	GC	3	6	4757851	4757856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_010102	TGG	2	6	4757857	4757862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_010102	CAT	2	6	4757906	4757911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10085	NC_010102	TCG	2	6	4758011	4758016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_010102	TA	3	6	4758045	4758050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_010102	TA	3	6	4758143	4758148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_010102	T	6	6	4758164	4758169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_010102	ATT	2	6	4758965	4758970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_010102	TAA	2	6	4758987	4758992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_010102	TAT	2	6	4759012	4759017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_010102	ATA	2	6	4759021	4759026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_010102	TA	3	6	4759025	4759030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_010102	G	6	6	4759070	4759075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_010102	TGG	2	6	4759103	4759108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10097	NC_010102	TCT	2	6	4759128	4759133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_010102	T	7	7	4759139	4759145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_010102	TAA	2	6	4759151	4759156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_010102	TGG	2	6	4759185	4759190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10103	NC_010102	TGG	2	6	4759396	4759401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_010102	AT	3	6	4759418	4759423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_010102	TTG	2	6	4759446	4759451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10109	NC_010102	AC	3	6	4761438	4761443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_010102	ATG	2	6	4761517	4761522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_010102	GTTGA	2	10	4761548	4761557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_010102	GGA	2	6	4761634	4761639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_010102	A	6	6	4761871	4761876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_010102	AAG	2	6	4762553	4762558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_010102	TGA	2	6	4762654	4762659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10118	NC_010102	CATT	2	8	4763744	4763751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_010102	A	6	6	4763877	4763882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_010102	A	6	6	4763887	4763892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_010102	T	6	6	4763965	4763970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_010102	GGA	2	6	4763988	4763993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_010102	TCAG	2	8	4764924	4764931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10124	NC_010102	CAT	2	6	4764936	4764941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10127	NC_010102	CGG	2	6	4768442	4768447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_010102	GCC	2	6	4768474	4768479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_010102	CCA	2	6	4768493	4768498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10130	NC_010102	GTC	2	6	4768588	4768593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10138	NC_010102	GTT	2	6	4774249	4774254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10260	NC_010102	ATT	2	6	4829260	4829265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_010102	TCG	2	6	4830605	4830610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10262	NC_010102	CT	3	6	4831509	4831514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10263	NC_010102	CT	4	8	4831543	4831550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10264	NC_010102	TTGT	2	8	4831551	4831558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_010102	CCG	2	6	4831663	4831668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10266	NC_010102	TTA	2	6	4833990	4833995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_010102	CTG	2	6	4834658	4834663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10268	NC_010102	AGCGCC	2	12	4835774	4835785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10269	NC_010102	TGTA	2	8	4837207	4837214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10270	NC_010102	TGT	2	6	4837219	4837224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10271	NC_010102	TGT	2	6	4837285	4837290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10272	NC_010102	AAGCG	2	10	4837300	4837309	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10273	NC_010102	CAG	2	6	4837337	4837342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10274	NC_010102	AAGCGC	2	12	4838672	4838683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10275	NC_010102	CAGC	2	8	4840449	4840456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10276	NC_010102	A	6	6	4840479	4840484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10278	NC_010102	GTTAT	2	10	4842525	4842534	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10279	NC_010102	CGG	2	6	4842561	4842566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10280	NC_010102	CGC	2	6	4842944	4842949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10282	NC_010102	A	8	8	4843556	4843563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10283	NC_010102	CAA	2	6	4845097	4845102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10286	NC_010102	T	8	8	4845162	4845169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10287	NC_010102	T	7	7	4845182	4845188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10288	NC_010102	ATT	2	6	4845206	4845211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10289	NC_010102	ATTTT	2	10	4845233	4845242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10290	NC_010102	TAA	2	6	4845251	4845256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10291	NC_010102	CTG	2	6	4847921	4847926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10293	NC_010102	CCA	2	6	4851046	4851051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10294	NC_010102	GTAAAA	2	12	4853611	4853622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10295	NC_010102	CCTG	2	8	4854362	4854369	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10296	NC_010102	TTG	2	6	4854943	4854948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10297	NC_010102	ATAAA	2	10	4854984	4854993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10298	NC_010102	ATATT	2	10	4854994	4855003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10299	NC_010102	CTT	2	6	4855018	4855023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10300	NC_010102	TCTGT	2	10	4855024	4855033	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10301	NC_010102	GGC	2	6	4855043	4855048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10302	NC_010102	TAA	2	6	4855135	4855140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10303	NC_010102	AAG	2	6	4855151	4855156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10310	NC_010102	ACG	2	6	4855261	4855266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10337	NC_010102	GGC	2	6	4858830	4858835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10338	NC_010102	ACA	2	6	4858863	4858868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10339	NC_010102	CTG	2	6	4858879	4858884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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