MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010079	TGAAC	2	10	7002	7011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010079	AGGAA	2	10	14369	14378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010079	GTAGG	2	10	14429	14438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010079	TCGAT	2	10	23837	23846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010079	ATATT	2	10	24375	24384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010079	TTTCA	2	10	34333	34342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010079	TAAAA	2	10	35786	35795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010079	ATGAG	2	10	37660	37669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010079	TTTGT	2	10	44066	44075	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010079	GATTT	2	10	56588	56597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010079	TATAA	2	10	57897	57906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010079	ATGTA	2	10	58654	58663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010079	CTTAT	2	10	74483	74492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010079	AAATG	2	10	78129	78138	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010079	TAGTA	2	10	90926	90935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010079	TTTTA	2	10	91142	91151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010079	TAATA	2	10	96689	96698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010079	GTGTT	2	10	96772	96781	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010079	AGAAA	2	10	103807	103816	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010079	TAAAG	2	10	103848	103857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010079	ATTCA	2	10	104120	104129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010079	GTAAT	2	10	125387	125396	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010079	AATAT	2	10	168292	168301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010079	GGGGC	2	10	169957	169966	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010079	TAATT	2	10	177769	177778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010079	AGAGA	2	10	180795	180804	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010079	AATCC	2	10	181151	181160	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010079	CAAAA	2	10	193402	193411	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010079	AAAGC	2	10	193752	193761	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010079	CGTTT	2	10	194971	194980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010079	TAACT	2	10	199537	199546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010079	TATCA	2	10	203548	203557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010079	ATCAT	2	10	211680	211689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010079	CAACT	2	10	223811	223820	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010079	GCTTT	2	10	228323	228332	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010079	TGAAG	2	10	228525	228534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010079	AAAAT	2	10	228596	228605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010079	TGATT	2	10	228669	228678	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010079	TAACA	2	10	234895	234904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010079	TAATG	2	10	243193	243202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010079	TATTT	2	10	260067	260076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010079	AACAT	2	10	268277	268286	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010079	GATAA	2	10	272230	272239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010079	ATAAC	2	10	276877	276886	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010079	TGAAT	2	10	276988	276997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010079	ATTAA	2	10	277129	277138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010079	AAAGT	2	10	280873	280882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010079	TAAAA	2	10	282586	282595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010079	AAATT	2	10	283902	283911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010079	TAAAA	2	10	298049	298058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010079	GAAAA	2	10	305840	305849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010079	ATAAA	2	10	305958	305967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010079	TCATA	2	10	314367	314376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010079	ATTTA	2	10	330192	330201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010079	AAATG	2	10	347578	347587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010079	TGAAT	2	10	347708	347717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010079	TAAAT	2	10	365006	365015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010079	AAATT	2	10	368699	368708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010079	ATTTT	2	10	370564	370573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010079	ATAGA	2	10	376801	376810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010079	TGACA	2	10	376993	377002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010079	GATAA	2	10	389296	389305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010079	GTAAT	2	10	424102	424111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010079	AGAAT	2	10	425328	425337	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010079	TAAGG	2	10	425392	425401	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010079	TAAAT	2	10	432837	432846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010079	ACAGT	2	10	435410	435419	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010079	CATAA	2	10	445887	445896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010079	TAAAA	2	10	446111	446120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010079	AATAT	2	10	448256	448265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010079	AAAGT	2	10	460213	460222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010079	AAATT	2	10	463402	463411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010079	GTATT	2	10	465383	465392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010079	TTAAA	2	10	468414	468423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010079	TAAAG	2	10	474552	474561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010079	CTCAC	2	10	476457	476466	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_010079	CAAAG	2	10	476482	476491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010079	TTGTA	2	10	484483	484492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010079	ATTAT	2	10	484650	484659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010079	TTTAT	2	10	485078	485087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010079	ATTTT	2	10	489557	489566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010079	CTTAA	2	10	494191	494200	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010079	AATAT	2	10	507923	507932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010079	TGGTG	2	10	512008	512017	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010079	CAACT	2	10	512573	512582	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_010079	GGTAA	2	10	513046	513055	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010079	TCGTG	2	10	513865	513874	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010079	GATTG	2	10	516199	516208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010079	GATTT	2	10	521109	521118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010079	ATATA	2	10	523527	523536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010079	CAAAG	2	10	530075	530084	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010079	AAAAG	2	10	530868	530877	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010079	AAAAG	2	10	531756	531765	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010079	ATGGT	2	10	532509	532518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010079	CATTA	2	10	532959	532968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010079	TTGAT	2	10	533236	533245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010079	CAAGA	2	10	535343	535352	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010079	AGACA	2	10	547197	547206	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010079	AAGTA	2	10	549632	549641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010079	TTAAA	2	10	551756	551765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010079	GATAA	2	10	551795	551804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010079	TACAA	2	10	554952	554961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010079	GTTAT	2	10	555464	555473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010079	GGTAA	2	10	557325	557334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010079	TCGTG	2	10	558144	558153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010079	GATTG	2	10	560450	560459	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010079	ATATA	2	10	567066	567075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010079	AAAAT	2	10	571841	571850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010079	TTTAT	2	10	571950	571959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010079	TTATG	2	10	574956	574965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010079	ATTTA	2	10	575101	575110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010079	TGAAT	2	10	581373	581382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010079	GTATA	2	10	581430	581439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010079	TATAA	2	10	585147	585156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010079	CGTAT	2	10	595356	595365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010079	TACAT	2	10	595415	595424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010079	CCAAT	2	10	595449	595458	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010079	TGAAA	2	10	595505	595514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010079	GTTTA	2	10	601313	601322	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010079	TAAAG	2	10	605508	605517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010079	ATATT	2	10	611644	611653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010079	TTAAC	2	10	614538	614547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010079	AATTT	2	10	614623	614632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010079	ATAAA	2	10	622972	622981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010079	TTATA	2	10	637349	637358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010079	CACAT	2	10	637745	637754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010079	ATGAT	2	10	646769	646778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010079	TAATT	2	10	650256	650265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010079	TAAGT	2	10	655241	655250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010079	TATTG	2	10	656701	656710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010079	AGTTC	2	10	659249	659258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010079	TTTAA	2	10	659798	659807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010079	AAATT	2	10	663042	663051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010079	TAAAT	2	10	665635	665644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010079	AAATT	2	10	667639	667648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010079	TAAAA	2	10	674777	674786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010079	ATTAA	2	10	676965	676974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010079	TTATT	2	10	677014	677023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010079	CAATA	2	10	677080	677089	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010079	TTAAT	2	10	679705	679714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010079	GTCCT	2	10	681088	681097	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010079	AATTC	2	10	681407	681416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010079	TAAAA	2	10	687537	687546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010079	ATGAA	2	10	694539	694548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010079	ATTTT	2	10	695349	695358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010079	ATATA	2	10	695405	695414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010079	ATAAA	2	10	702041	702050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010079	TTTTA	2	10	704307	704316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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