MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010079	TAA	3	9	1138140	1138148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010079	TGA	2	6	1138182	1138187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010079	TGTT	2	8	1138225	1138232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010079	TGT	2	6	1138235	1138240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_010079	AAC	2	6	1138244	1138249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_010079	TAT	2	6	1138261	1138266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010079	TTGTA	2	10	1138295	1138304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010079	GTTA	2	8	1138314	1138321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_010079	A	7	7	1138340	1138346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010079	TAAA	2	8	1138387	1138394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_010079	TAAAA	2	10	1138398	1138407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010079	A	6	6	1138404	1138409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010079	GAT	2	6	1138432	1138437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010079	TCC	2	6	1139498	1139503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_010079	TGT	2	6	1139521	1139526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010079	GAT	2	6	1139534	1139539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010079	AAT	2	6	1139598	1139603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010079	AAAT	2	8	1139616	1139623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_010079	ATT	3	9	1139640	1139648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_010079	AGG	2	6	1139685	1139690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_010079	ACA	2	6	1143318	1143323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_010079	TGA	2	6	1143334	1143339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010079	GAA	2	6	1143342	1143347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010079	CGT	2	6	1143349	1143354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_010079	TAA	2	6	1143355	1143360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_010079	ATT	2	6	1143421	1143426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_010079	AT	3	6	1143456	1143461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010079	CAAG	2	8	1143468	1143475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_010079	ACA	2	6	1143498	1143503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_010079	TGA	2	6	1143518	1143523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_010079	A	6	6	1143566	1143571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010079	TAAA	2	8	1143572	1143579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_010079	TTG	2	6	1143584	1143589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_010079	CAT	2	6	1143611	1143616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_010079	TAC	2	6	1143629	1143634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_010079	ATT	2	6	1143653	1143658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_010079	GTA	2	6	1143695	1143700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010079	GAA	2	6	1143726	1143731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_010079	ATA	2	6	1143740	1143745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010079	ATA	2	6	1143773	1143778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010079	AGA	2	6	1143795	1143800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_010079	AATA	2	8	1143850	1143857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010079	ACT	3	9	1143895	1143903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010079	CAA	2	6	1143949	1143954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_010079	TAAT	2	8	1143983	1143990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_010079	AAT	2	6	1144020	1144025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_010079	ACG	2	6	1144060	1144065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_010079	TTG	3	9	1144073	1144081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_010079	AAT	2	6	1144089	1144094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_010079	ATC	2	6	1144610	1144615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_010079	ATTA	2	8	1144745	1144752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_010079	TTA	2	6	1144783	1144788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010079	ATTTTT	2	12	1144798	1144809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_010079	GAG	2	6	1144821	1144826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010079	ATAATT	2	12	1145595	1145606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010079	TA	3	6	1145680	1145685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010079	AAT	2	6	1145686	1145691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010079	AAT	2	6	1145704	1145709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_010079	ATT	2	6	1145730	1145735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_010079	GGT	2	6	1145833	1145838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010079	T	6	6	1145865	1145870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_010079	T	7	7	1145886	1145892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010079	ACA	2	6	1145899	1145904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6066	NC_010079	ATA	2	6	1150584	1150589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_010079	ATT	2	6	1150730	1150735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_010079	G	6	6	1158727	1158732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6096	NC_010079	AAATT	2	10	1162028	1162037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_010079	ATTAA	2	10	1162195	1162204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_010079	T	7	7	1164136	1164142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010079	AGG	2	6	1164164	1164169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010079	TGTT	2	8	1164182	1164189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_010079	GAAT	2	8	1164224	1164231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_010079	AT	3	6	1164566	1164571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_010079	A	6	6	1165234	1165239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_010079	TACT	2	8	1165735	1165742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6129	NC_010079	AT	4	8	1166046	1166053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_010079	T	6	6	1166053	1166058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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