MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. arizonae serovar 62:z4

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010067	CGAAAG	2	12	317	328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010067	AATGGG	2	12	40579	40590	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010067	TTTGTT	2	12	57674	57685	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010067	TTTTTC	2	12	57841	57852	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010067	GATTAA	2	12	59648	59659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010067	AAAGCA	2	12	69613	69624	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010067	AGATGC	2	12	142336	142347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010067	GCTTTT	2	12	160285	160296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010067	TTATAT	2	12	162676	162687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010067	TTATTG	2	12	165560	165571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010067	GTTTTT	2	12	178020	178031	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010067	CCTAAG	2	12	182044	182055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010067	ATAAAT	2	12	205221	205232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010067	CTGTAG	2	12	353113	353124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010067	GTGAAT	2	12	402961	402972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010067	TTTTCT	2	12	422721	422732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010067	ATGAAA	2	12	475207	475218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010067	CAGCCC	2	12	502381	502392	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010067	AAAGGC	2	12	529938	529949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010067	TTTTCT	2	12	533799	533810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010067	TTTAAA	2	12	649957	649968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010067	TTTTCC	2	12	706911	706922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010067	TAGCCA	2	12	770513	770524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010067	GTGATG	2	12	833687	833698	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010067	TTAGAA	2	12	834800	834811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010067	GGCTTT	2	12	835238	835249	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010067	TATATG	2	12	838909	838920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010067	CGAATC	2	12	849486	849497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010067	AAATAA	2	12	900570	900581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010067	TGAATA	2	12	901988	901999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010067	TGAAAA	2	12	912603	912614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010067	GGTAGT	2	12	914772	914783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010067	AATATA	2	12	923274	923285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010067	GCGTAG	2	12	927769	927780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010067	TTGTGT	2	12	982254	982265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010067	TACCTG	2	12	1011657	1011668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010067	ACGTTG	2	12	1069226	1069237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010067	AAGCGC	2	12	1099278	1099289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010067	TAACAT	2	12	1105382	1105393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010067	AGCCAA	2	12	1110177	1110188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010067	TCTGTA	2	12	1197976	1197987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010067	TGCCAT	2	12	1203919	1203930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010067	CGCAGA	2	12	1204636	1204647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010067	TGCTTT	2	12	1229931	1229942	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010067	GAATGT	2	12	1260345	1260356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010067	TCCTCA	2	12	1280628	1280639	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010067	TAATTA	2	12	1332840	1332851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010067	TGGGCG	2	12	1360420	1360431	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010067	TCTAAT	2	12	1423235	1423246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010067	CAGATT	2	12	1439350	1439361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010067	ATTAGG	2	12	1463769	1463780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010067	GTAGAT	2	12	1505469	1505480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010067	GTAACC	2	12	1523159	1523170	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010067	AAGACT	2	12	1551336	1551347	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010067	GCGAGC	2	12	1564886	1564897	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010067	AGGCTA	2	12	1599963	1599974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010067	GCGCTT	2	12	1636552	1636563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010067	AAGAAA	2	12	1649379	1649390	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010067	ATATTA	2	12	1666809	1666820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010067	TAGTTT	2	12	1673576	1673587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010067	ATTCTT	2	12	1708947	1708958	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010067	AAGAGG	2	12	1829024	1829035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010067	CTTTAT	2	12	1841997	1842008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010067	ATTTAC	2	12	1845155	1845166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010067	TAAACG	2	12	1850489	1850500	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010067	TAAAAA	2	12	1924261	1924272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010067	GACAAT	2	12	1974263	1974274	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010067	TGACGC	2	12	1977541	1977552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010067	ACGATG	2	12	1987766	1987777	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010067	TTTTCA	2	12	2029273	2029284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010067	CTTGTG	2	12	2032147	2032158	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010067	AGGCGC	2	12	2073280	2073291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010067	CGGGAT	2	12	2073296	2073307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010067	ATGATA	2	12	2078268	2078279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010067	GTTAAT	2	12	2126478	2126489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010067	CAACTA	2	12	2146211	2146222	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010067	TTTCAT	2	12	2163931	2163942	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010067	AGATTG	2	12	2183177	2183188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010067	TAAAAA	2	12	2187166	2187177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010067	ATTTGC	2	12	2278840	2278851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010067	GCAATA	2	12	2283813	2283824	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010067	ATACCA	2	12	2311673	2311684	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010067	CGCCTG	2	12	2374696	2374707	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010067	TATCAC	2	12	2428374	2428385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010067	ATCGAT	2	12	2464502	2464513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010067	TAACAA	2	12	2470091	2470102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010067	ATAAAA	2	12	2504005	2504016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010067	GTCATA	2	12	2504494	2504505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010067	TGAATA	2	12	2560059	2560070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010067	TGGCGC	2	12	2700758	2700769	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010067	ATAACC	2	12	2810919	2810930	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010067	GTGGAT	2	12	2857081	2857092	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010067	AATGAC	2	12	2861665	2861676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010067	ACCACA	2	12	2870585	2870596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010067	GACAAT	2	12	2908134	2908145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010067	ATGGTG	2	12	2925360	2925371	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010067	GCGCTT	2	12	2935979	2935990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010067	TAATCA	2	12	2992342	2992353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010067	ATATCA	2	12	2997881	2997892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010067	TGGACA	2	12	3001242	3001253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010067	CGAAAA	2	12	3015727	3015738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010067	ATCCTT	2	12	3018898	3018909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010067	AAGCGC	2	12	3105778	3105789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010067	GGAAAA	2	12	3108666	3108677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010067	AGAATG	2	12	3125534	3125545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010067	TATCTC	2	12	3159334	3159345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010067	TAAAAA	2	12	3176566	3176577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010067	GTCTTA	2	12	3184476	3184487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010067	ATGGGG	2	12	3199074	3199085	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010067	TAATTA	2	12	3227872	3227883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010067	TCAATA	2	12	3265219	3265230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010067	TGAAAA	2	12	3314206	3314217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010067	CTTACA	2	12	3316732	3316743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010067	AAAGAC	2	12	3316836	3316847	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010067	GAAACA	2	12	3318167	3318178	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010067	TAAATT	2	12	3350872	3350883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010067	GTAATG	2	12	3384253	3384264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010067	TGGTTA	2	12	3389932	3389943	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010067	TAAGCG	2	12	3403557	3403568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010067	TCAAAA	2	12	3408487	3408498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010067	CAATAA	2	12	3435724	3435735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010067	TAATTT	2	12	3435821	3435832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010067	TAACGC	2	12	3479313	3479324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010067	AGCGCC	2	12	3509696	3509707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010067	GCTTAC	2	12	3538143	3538154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010067	GCATGG	2	12	3558987	3558998	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010067	CGATGC	2	12	3559316	3559327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010067	CAGGCG	2	12	3652077	3652088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010067	GCGCGA	2	12	3714342	3714353	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010067	GATAGC	2	12	3748317	3748328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010067	CTACCG	2	12	3773481	3773492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010067	GAAATG	2	12	3777139	3777150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010067	AGCGCT	2	12	3832935	3832946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010067	TGAAAG	2	12	3979935	3979946	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010067	ATTTTA	2	12	3986641	3986652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010067	GAATGA	2	12	4024640	4024651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010067	AAGCGC	2	12	4053820	4053831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010067	AATAAC	2	12	4201972	4201983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_010067	TTTTTC	2	12	4284583	4284594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_010067	TGGCGC	2	12	4286972	4286983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010067	TACTTA	2	12	4292980	4292991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_010067	TGGTCG	2	12	4316748	4316759	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_010067	ATCATT	2	12	4331118	4331129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_010067	TACAAC	2	12	4336763	4336774	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010067	TCCCGT	2	12	4355855	4355866	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010067	AAATAT	2	12	4424950	4424961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010067	AAAAGG	2	12	4436312	4436323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010067	TTTTCA	2	12	4436593	4436604	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_010067	AAAAAT	2	12	4459931	4459942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010067	CTACAA	2	12	4465368	4465379	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010067	TTTTTA	2	12	4468651	4468662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010067	GCCGTT	2	12	4520072	4520083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010067	GATCGC	2	12	4574105	4574116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010067	ACCAGA	2	12	4588221	4588232	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.