MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19503

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010000	ACG	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010000	ACT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010000	CTA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010000	TGA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010000	ATA	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010000	GAA	2	6	8722	8727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010000	TCA	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010000	TAA	2	6	10705	10710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010000	TTA	2	6	10796	10801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010000	AAC	2	6	12380	12385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010000	TAT	2	6	12463	12468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010000	ATT	2	6	13720	13725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010000	GCT	2	6	15726	15731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010000	TAA	2	6	15789	15794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010000	ATA	2	6	15810	15815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010000	CAA	2	6	15858	15863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010000	AAT	2	6	15912	15917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010000	TGA	2	6	16159	16164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010000	CAT	3	9	16172	16180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010000	TAG	2	6	17389	17394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010000	TAT	2	6	17425	17430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010000	ACT	2	6	17547	17552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010000	AGC	2	6	17585	17590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010000	TGA	2	6	17601	17606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010000	AAT	2	6	17792	17797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010000	AAT	2	6	17808	17813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010000	TAA	2	6	17892	17897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010000	ATC	2	6	17939	17944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010000	GCA	2	6	18125	18130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010000	GCT	2	6	18172	18177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010000	TCA	2	6	18211	18216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010000	TTA	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010000	TAA	2	6	18432	18437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010000	GAA	2	6	18507	18512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010000	GGC	2	6	19509	19514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010000	TGC	2	6	19550	19555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010000	TGC	2	6	19838	19843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010000	ACC	2	6	19924	19929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010000	TGA	2	6	20094	20099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010000	TTA	2	6	20126	20131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010000	CAG	2	6	20258	20263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010000	AAC	2	6	20317	20322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010000	TAG	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010000	TGG	2	6	20518	20523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010000	CTA	2	6	20537	20542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010000	ATT	2	6	20557	20562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010000	ACA	2	6	20663	20668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010000	CTC	2	6	20772	20777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010000	AAC	2	6	20920	20925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010000	GTG	2	6	21186	21191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010000	TGG	2	6	21230	21235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010000	GGT	2	6	21285	21290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010000	ATC	2	6	21351	21356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010000	GGC	2	6	21367	21372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010000	TGA	2	6	21377	21382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010000	ACA	2	6	21455	21460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010000	TTA	2	6	21473	21478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010000	TTA	2	6	21481	21486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010000	TTA	2	6	21551	21556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010000	ACA	2	6	21583	21588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010000	AAT	2	6	22539	22544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010000	ATC	2	6	22875	22880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010000	ATT	2	6	22974	22979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010000	TGT	2	6	23035	23040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010000	AAT	2	6	23066	23071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010000	ATT	2	6	23155	23160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010000	TGG	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010000	TAA	2	6	40807	40812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010000	AAG	2	6	40819	40824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010000	AAC	2	6	40864	40869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010000	TTA	2	6	43160	43165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010000	TCA	2	6	43180	43185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010000	TTC	2	6	43208	43213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.