MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia proteamaculans 568 chromosome

Total Repeats: 488

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009832	TTGCT	2	10	109	118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009832	AGGTG	2	10	11306	11315	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009832	TTCTC	2	10	27447	27456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009832	TTCTT	2	10	30567	30576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009832	AACAT	2	10	57775	57784	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009832	AATTT	2	10	68561	68570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009832	CCAGG	2	10	74766	74775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009832	TCCTT	2	10	85162	85171	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009832	GAAAG	2	10	92654	92663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009832	AGGAG	2	10	103132	103141	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009832	TCCGT	2	10	120106	120115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009832	TCTCG	2	10	139085	139094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009832	GACAG	2	10	147993	148002	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009832	GCATA	2	10	148142	148151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009832	ATCAC	2	10	148438	148447	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009832	ACGCC	2	10	181874	181883	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009832	TTTCG	2	10	224906	224915	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009832	CAATG	2	10	230721	230730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009832	TAATT	2	10	246432	246441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009832	AAATG	2	10	246483	246492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009832	GCATG	2	10	263321	263330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009832	GTGAG	2	10	273191	273200	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009832	CAGAG	2	10	292788	292797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009832	CATTG	2	10	299033	299042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009832	AGGCT	2	10	301992	302001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009832	GGTTT	2	10	309594	309603	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009832	CAACG	2	10	313343	313352	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009832	CCGGG	2	10	321947	321956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009832	AGGCT	2	10	339968	339977	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009832	TTTGC	2	10	341700	341709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009832	AAATC	2	10	352532	352541	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009832	TTTTA	2	10	366838	366847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009832	CCCGG	2	10	411096	411105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009832	CGGGG	2	10	411502	411511	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009832	CGGGG	2	10	411542	411551	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009832	TACGA	2	10	412976	412985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009832	AGATC	2	10	417659	417668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009832	CGTCT	2	10	419219	419228	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009832	TTTGG	2	10	420485	420494	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009832	TAGTT	2	10	424228	424237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009832	TAAAA	2	10	426552	426561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009832	GTAAT	2	10	430125	430134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009832	TTGCT	2	10	431041	431050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009832	GGCAG	2	10	444485	444494	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009832	AAATA	2	10	446605	446614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009832	GTCTG	2	10	476475	476484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009832	TCCAT	2	10	503003	503012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009832	GTCGA	2	10	544190	544199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009832	TTTGA	2	10	558913	558922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009832	ATCCC	2	10	560415	560424	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009832	AAAAT	2	10	564174	564183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009832	TTAAA	2	10	584172	584181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009832	CAAAA	2	10	595429	595438	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009832	CAACC	2	10	598763	598772	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_009832	AACAA	2	10	604140	604149	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009832	TTGAA	2	10	614306	614315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009832	ATTGA	2	10	652235	652244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009832	CCAAC	2	10	653218	653227	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009832	GGATA	2	10	663612	663621	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009832	GGGAA	2	10	666364	666373	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009832	TTTTC	2	10	685716	685725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009832	AAGGT	2	10	711251	711260	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009832	AGGGT	2	10	711465	711474	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009832	GCGCG	2	10	716525	716534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009832	AACAG	2	10	718174	718183	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009832	AACCG	2	10	718335	718344	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009832	CAAAA	2	10	721949	721958	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009832	GATAG	2	10	732076	732085	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009832	CAGGG	2	10	758333	758342	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009832	TACAA	2	10	767081	767090	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009832	GGTAT	2	10	768768	768777	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009832	GTTTT	2	10	774612	774621	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009832	CTAAG	2	10	786490	786499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009832	ATGAA	2	10	786678	786687	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009832	AAGCT	2	10	814068	814077	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009832	TAAAT	2	10	830799	830808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009832	AGTGG	2	10	831299	831308	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009832	TAATT	2	10	889548	889557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009832	GCCGG	2	10	903607	903616	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009832	TTACC	2	10	912099	912108	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009832	GTTTG	2	10	936345	936354	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009832	CGCCT	2	10	936366	936375	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_009832	TTATC	2	10	938738	938747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009832	GCACA	2	10	942787	942796	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009832	CACTG	2	10	967891	967900	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009832	ATGGT	2	10	973165	973174	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009832	GTTTT	2	10	977558	977567	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009832	CATTG	2	10	983914	983923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009832	AGGCT	2	10	986873	986882	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009832	TGAAT	2	10	988851	988860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009832	AATCA	2	10	1040540	1040549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009832	CCTTG	2	10	1045076	1045085	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_009832	CCTTG	2	10	1045580	1045589	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009832	GCGGA	2	10	1048519	1048528	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009832	TGTGT	2	10	1050860	1050869	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009832	CCCGT	2	10	1062161	1062170	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_009832	TCAGG	2	10	1067367	1067376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009832	GCAGG	2	10	1074001	1074010	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009832	AAATA	2	10	1074429	1074438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009832	CCCAG	2	10	1075692	1075701	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_009832	GGTGC	2	10	1077785	1077794	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009832	GTGAT	2	10	1078592	1078601	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009832	AATCC	2	10	1105099	1105108	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009832	ATAAA	2	10	1114209	1114218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009832	ATTTA	2	10	1121838	1121847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009832	TGTAT	2	10	1149073	1149082	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009832	TGCGG	2	10	1162355	1162364	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009832	AGGAA	2	10	1162407	1162416	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009832	GCCTG	2	10	1179724	1179733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009832	AATTT	2	10	1199548	1199557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009832	CTTTT	2	10	1204226	1204235	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009832	GGTAA	2	10	1209739	1209748	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009832	AGTAA	2	10	1222312	1222321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009832	TTTTG	2	10	1228333	1228342	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009832	GAATA	2	10	1233162	1233171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009832	GCTTC	2	10	1246996	1247005	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_009832	ATGGT	2	10	1253958	1253967	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009832	TACAA	2	10	1266733	1266742	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009832	TTCAT	2	10	1270086	1270095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009832	GGAAG	2	10	1273730	1273739	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009832	TTATA	2	10	1282989	1282998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009832	GAGCA	2	10	1287065	1287074	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009832	CTTTT	2	10	1290576	1290585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009832	AGTTG	2	10	1290879	1290888	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009832	GCGCG	2	10	1295248	1295257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_009832	GCTGT	2	10	1300501	1300510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009832	CGCAG	2	10	1305645	1305654	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009832	CCGCG	2	10	1305661	1305670	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_009832	CTGTA	2	10	1307144	1307153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009832	GCATA	2	10	1325338	1325347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009832	TCGCG	2	10	1352360	1352369	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009832	GGGTA	2	10	1388345	1388354	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009832	TAAGC	2	10	1398873	1398882	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009832	ATTGC	2	10	1402701	1402710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009832	CTGCG	2	10	1404274	1404283	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009832	GCCGT	2	10	1418392	1418401	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009832	ATGTG	2	10	1424062	1424071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009832	ACGTT	2	10	1425683	1425692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009832	GTTAT	2	10	1426613	1426622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009832	TAAAG	2	10	1432563	1432572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009832	CGGGG	2	10	1446969	1446978	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009832	GTTAG	2	10	1461089	1461098	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009832	GAAAC	2	10	1465355	1465364	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009832	TATAT	2	10	1479147	1479156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009832	ACTTC	2	10	1479422	1479431	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_009832	CCGCC	2	10	3013775	3013784	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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281	NC_009832	GGCAT	2	10	3070036	3070045	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_009832	CTGGC	2	10	3081232	3081241	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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403	NC_009832	GTTAT	2	10	4613412	4613421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_009832	CAATT	2	10	5333413	5333422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
480	NC_009832	CTTTT	2	10	5339913	5339922	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
481	NC_009832	AAATC	2	10	5360778	5360787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
482	NC_009832	TACGA	2	10	5370499	5370508	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
483	NC_009832	AGATC	2	10	5375182	5375191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
484	NC_009832	CCGGG	2	10	5414430	5414439	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
485	NC_009832	TGGCT	2	10	5416751	5416760	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
486	NC_009832	CTAGC	2	10	5426334	5426343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
487	NC_009832	TCGGT	2	10	5427040	5427049	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
488	NC_009832	CAATG	2	10	5429295	5429304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.