MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	ATAA	2	8	1652	1659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009785	AAAT	2	8	3571	3578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009785	ATTC	2	8	6203	6210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009785	GAAA	2	8	12322	12329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009785	TAAA	2	8	19105	19112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009785	TAAA	2	8	21530	21537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009785	CTTT	2	8	21621	21628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009785	GATA	2	8	21716	21723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009785	TTTG	2	8	22449	22456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009785	TAAA	2	8	23694	23701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009785	CAAT	2	8	26606	26613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009785	CAGT	2	8	30885	30892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009785	AAGG	2	8	34167	34174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009785	GAAA	2	8	40303	40310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009785	CAAA	2	8	44353	44360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009785	ATTA	2	8	45296	45303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009785	AAAT	2	8	49871	49878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009785	ATCC	2	8	52392	52399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009785	TATT	2	8	54523	54530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009785	AAAT	2	8	57495	57502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009785	AAGA	2	8	59784	59791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009785	AGAA	2	8	60278	60285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009785	TTAG	2	8	76036	76043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009785	TTAT	2	8	76205	76212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009785	AATG	2	8	78396	78403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009785	GTTC	2	8	79144	79151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009785	AGTT	2	8	80246	80253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009785	CGTT	2	8	80651	80658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009785	GCTC	2	8	80694	80701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009785	TAAT	2	8	80811	80818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009785	ATCA	2	8	80821	80828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009785	GAAA	2	8	80992	80999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009785	AAGT	2	8	81048	81055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009785	TAAT	2	8	81096	81103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009785	GATA	2	8	81133	81140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009785	TCAG	2	8	85128	85135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009785	TTTG	2	8	87556	87563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009785	CAGC	2	8	87646	87653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009785	CAAA	2	8	91025	91032	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009785	ATCT	2	8	93600	93607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009785	CTTT	2	8	98170	98177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009785	TTAT	2	8	98269	98276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009785	AATG	2	8	98277	98284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009785	TGTC	2	8	98343	98350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009785	TTCA	2	8	98374	98381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009785	AAAT	2	8	98423	98430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009785	AGCT	2	8	101660	101667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009785	CTGA	2	8	111477	111484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009785	GGAA	2	8	116789	116796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009785	CTCG	2	8	122553	122560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009785	TGAG	2	8	122563	122570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009785	AGCT	2	8	124184	124191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009785	AGGA	2	8	125896	125903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009785	AAGG	2	8	127309	127316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009785	CATT	2	8	135961	135968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009785	AAGA	2	8	139170	139177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009785	CTTT	2	8	143283	143290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009785	TATT	2	8	143398	143405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009785	ACTA	2	8	143406	143413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009785	TGAA	2	8	143527	143534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009785	GTGA	2	8	148906	148913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009785	TAAT	2	8	149024	149031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009785	AAAG	2	8	158040	158047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009785	AAAC	2	8	158056	158063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009785	ACAA	2	8	159555	159562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009785	CTAT	2	8	160495	160502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009785	TAAG	2	8	161778	161785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009785	TGCT	2	8	162944	162951	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009785	ACTG	2	8	167642	167649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009785	AGAA	2	8	167720	167727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009785	AAAT	2	8	168522	168529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009785	AAAT	2	8	171012	171019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009785	TAAA	2	8	171087	171094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009785	ATTC	2	8	173259	173266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009785	ATTC	2	8	178935	178942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009785	TCGG	2	8	179996	180003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009785	AGAA	2	8	180999	181006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009785	TAAA	2	8	182850	182857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009785	GATA	2	8	182878	182885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009785	ATTT	2	8	183743	183750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009785	TTGC	2	8	184330	184337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009785	CTTT	2	8	191026	191033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009785	TAAA	2	8	193075	193082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009785	TTTA	2	8	200411	200418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009785	CCAT	2	8	200997	201004	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009785	GCTT	2	8	202073	202080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009785	TGTT	2	8	202201	202208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009785	AAAT	2	8	209741	209748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009785	TGAA	2	8	218277	218284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009785	TTGA	2	8	230331	230338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009785	AGAA	2	8	231160	231167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009785	GGTT	2	8	235128	235135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009785	TTGA	2	8	235691	235698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009785	CAAG	2	8	235777	235784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009785	TGAG	2	8	235794	235801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009785	AAAG	2	8	235865	235872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009785	TGGT	2	8	235915	235922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009785	ATGG	2	8	235982	235989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009785	GAAA	2	8	236178	236185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009785	GGAG	2	8	236391	236398	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009785	ACTT	2	8	236560	236567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009785	ATCA	2	8	243054	243061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009785	TATT	2	8	246117	246124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009785	ATAG	2	8	246175	246182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009785	AGAA	2	8	252849	252856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009785	TAGT	2	8	254219	254226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009785	TGTT	2	8	254262	254269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009785	AAAT	2	8	256123	256130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009785	CAAA	2	8	262525	262532	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009785	TTTC	2	8	266308	266315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009785	AAAG	2	8	267803	267810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009785	TTTA	2	8	270401	270408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009785	TTTC	2	8	281207	281214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009785	CATA	2	8	283191	283198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009785	AATG	2	8	286967	286974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009785	ATAA	2	8	286983	286990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009785	CTCA	2	8	290342	290349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009785	AGTC	2	8	292213	292220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009785	CTAT	2	8	294297	294304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009785	ATAA	2	8	302787	302794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009785	AGAA	2	8	309062	309069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009785	TGCA	2	8	311908	311915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009785	TTCA	2	8	312070	312077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009785	ATTT	2	8	312106	312113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009785	TCAT	2	8	314721	314728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009785	GAAT	2	8	314739	314746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009785	AATA	2	8	314809	314816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009785	TAAA	2	8	317213	317220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009785	CTTT	2	8	318923	318930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009785	ACAA	2	8	324348	324355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009785	TTGA	2	8	326973	326980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009785	AGAA	2	8	328869	328876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009785	TCAA	2	8	329388	329395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009785	TGAT	2	8	332815	332822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009785	TTTA	2	8	332870	332877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009785	TAAA	2	8	335684	335691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009785	TTAT	2	8	338168	338175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009785	TTAT	2	8	347488	347495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009785	GATA	2	8	349859	349866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009785	GAGG	2	8	349975	349982	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009785	TTCT	2	8	350691	350698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009785	TAAA	2	8	350761	350768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009785	GAAA	2	8	350824	350831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009785	ATTG	2	8	352878	352885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009785	TTCT	2	8	353017	353024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009785	ATCA	2	8	365218	365225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009785	TGGT	2	8	367379	367386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009785	TGAA	2	8	367971	367978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009785	GTAA	2	8	368642	368649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009785	TATT	2	8	375590	375597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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