MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3

Total Repeats: 642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009782	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009782	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009782	TCGAT	2	10	23821	23830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009782	ATATT	2	10	24358	24367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009782	TTTCA	2	10	34314	34323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009782	TAAAA	2	10	35767	35776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009782	AGATA	2	10	35925	35934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009782	TAAAA	2	10	38332	38341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009782	AAGTA	2	10	39759	39768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009782	ATGAG	2	10	43525	43534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009782	TTTAA	2	10	49611	49620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009782	AAAAT	2	10	49703	49712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009782	GAATT	2	10	50906	50915	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009782	ATATA	2	10	54458	54467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009782	ATAAA	2	10	63302	63311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009782	CTAGT	2	10	70044	70053	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009782	TAATA	2	10	72839	72848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009782	TATAA	2	10	72968	72977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009782	ATTTT	2	10	77012	77021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009782	GTGAG	2	10	81378	81387	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009782	TTTTA	2	10	89389	89398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009782	GTGTT	2	10	95199	95208	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009782	ATTCA	2	10	97791	97800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009782	GTAAT	2	10	119888	119897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009782	AGATG	2	10	126460	126469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009782	ATTTT	2	10	142012	142021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009782	CAAAA	2	10	186715	186724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009782	TAAAG	2	10	187064	187073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009782	TATCA	2	10	197092	197101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009782	ATCAT	2	10	205224	205233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009782	CAACT	2	10	217355	217364	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009782	GCTTT	2	10	221867	221876	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009782	TGATT	2	10	222213	222222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009782	GAAAA	2	10	232861	232870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009782	CTAAG	2	10	233026	233035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009782	TAACA	2	10	233232	233241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009782	AATAT	2	10	252427	252436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009782	TATTT	2	10	258418	258427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009782	AACAT	2	10	266761	266770	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009782	GATAA	2	10	270698	270707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009782	ATAAC	2	10	275345	275354	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009782	TGAAT	2	10	275456	275465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009782	ATTAA	2	10	275597	275606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009782	AAAGT	2	10	279341	279350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009782	TAAAA	2	10	281054	281063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009782	AAATT	2	10	282370	282379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009782	TAAAA	2	10	296515	296524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009782	GAAAA	2	10	304305	304314	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009782	ATAAA	2	10	304423	304432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009782	TCATA	2	10	312885	312894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009782	ATTTA	2	10	326809	326818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009782	TAAAT	2	10	358111	358120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009782	ATTTT	2	10	363668	363677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009782	ATAGA	2	10	369912	369921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009782	TGACA	2	10	370104	370113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009782	GATAA	2	10	382408	382417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009782	ATTAA	2	10	387830	387839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009782	TATCA	2	10	397149	397158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009782	AGAAT	2	10	418517	418526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009782	ATTGT	2	10	419800	419809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009782	TAAAT	2	10	426039	426048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009782	AGATA	2	10	426142	426151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009782	ACAGT	2	10	430133	430142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009782	AGTAT	2	10	439694	439703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009782	CCTTT	2	10	455599	455608	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009782	CATAA	2	10	466419	466428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009782	TAAAA	2	10	466643	466652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009782	AATAT	2	10	468788	468797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009782	AAAGT	2	10	479584	479593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009782	AAATT	2	10	482762	482771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009782	TAAAG	2	10	493763	493772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009782	CTCAC	2	10	495668	495677	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009782	CAAAG	2	10	495693	495702	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009782	CTTAA	2	10	513319	513328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009782	TGGTG	2	10	531138	531147	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009782	CAACT	2	10	531709	531718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009782	GGTAA	2	10	532183	532192	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009782	TCGTG	2	10	533002	533011	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009782	GATTG	2	10	535336	535345	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009782	GATTT	2	10	540267	540276	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009782	ATATA	2	10	542685	542694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009782	CAAAG	2	10	549233	549242	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009782	TTGAT	2	10	552394	552403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009782	AGACA	2	10	566418	566427	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009782	AAGTA	2	10	568853	568862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009782	TTAAA	2	10	570976	570985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009782	GATAA	2	10	571015	571024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009782	GGTAA	2	10	576544	576553	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009782	TCGTG	2	10	577363	577372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009782	GATTG	2	10	579668	579677	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009782	ATATA	2	10	586282	586291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009782	AAAAT	2	10	591057	591066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009782	TTTAT	2	10	591166	591175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009782	TTATG	2	10	594172	594181	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009782	ATTTA	2	10	594317	594326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009782	ACAAT	2	10	596122	596131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009782	TGAAT	2	10	600589	600598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009782	GTATA	2	10	600646	600655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009782	TATAA	2	10	604363	604372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009782	GTTTA	2	10	620533	620542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009782	TAAAG	2	10	624727	624736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009782	GAAGC	2	10	626083	626092	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009782	ATATT	2	10	630864	630873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009782	TTAAC	2	10	633776	633785	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009782	AATTT	2	10	633861	633870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009782	ATAAA	2	10	642185	642194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009782	TTATA	2	10	656563	656572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009782	CACAT	2	10	656959	656968	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009782	ATGAT	2	10	665982	665991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009782	TGACA	2	10	666442	666451	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009782	TAATT	2	10	669469	669478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009782	TAAAT	2	10	678870	678879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009782	AAATT	2	10	680874	680883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009782	TAAAA	2	10	687769	687778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009782	ATTAA	2	10	689957	689966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009782	TTATT	2	10	690006	690015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009782	CAATA	2	10	690072	690081	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009782	TTAAT	2	10	692698	692707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009782	AAATA	2	10	694963	694972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009782	ATTTT	2	10	694985	694994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009782	ATAAA	2	10	701677	701686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009782	TTTTA	2	10	705463	705472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009782	AAAGG	2	10	705784	705793	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009782	ATATA	2	10	709021	709030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009782	AAACT	2	10	712546	712555	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009782	TTCAC	2	10	717759	717768	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009782	TTTGT	2	10	721665	721674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009782	AATGA	2	10	721738	721747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009782	GGTTG	2	10	728740	728749	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009782	AGTAG	2	10	738449	738458	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009782	AAGTT	2	10	738896	738905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009782	AATTG	2	10	738928	738937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009782	AAACT	2	10	740803	740812	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009782	ATTTA	2	10	741194	741203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009782	AAAGT	2	10	743442	743451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009782	AATTT	2	10	746051	746060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009782	CATGA	2	10	748211	748220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009782	ACGAA	2	10	749064	749073	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009782	ATCAT	2	10	752595	752604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009782	AATTT	2	10	757487	757496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009782	AATTA	2	10	764289	764298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009782	ATTTA	2	10	768470	768479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009782	AAAGT	2	10	768563	768572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009782	TAAAG	2	10	770398	770407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009782	ATTTT	2	10	780950	780959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009782	TAACA	2	10	783101	783110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009782	TAAGT	2	10	783973	783982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009782	TAAAA	2	10	786788	786797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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