MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 chromosome

Total Repeats: 697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009665	TGAAT	2	10	8571	8580	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009665	CTGGG	2	10	35512	35521	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009665	GGTCA	2	10	41843	41852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009665	ATTGA	2	10	41976	41985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009665	AGTCG	2	10	45382	45391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009665	AGGCT	2	10	45709	45718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009665	ATCCC	2	10	47412	47421	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_009665	TCCGC	2	10	47598	47607	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_009665	CTAGC	2	10	47696	47705	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009665	GATAG	2	10	54326	54335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009665	AAAGG	2	10	55878	55887	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009665	CTTTA	2	10	65212	65221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009665	TTTCA	2	10	80273	80282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009665	TGGGT	2	10	109102	109111	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009665	CCATG	2	10	112293	112302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009665	ACGGG	2	10	113350	113359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009665	TTATT	2	10	115266	115275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009665	GGTTG	2	10	120942	120951	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009665	AAAAC	2	10	121023	121032	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009665	AGTGA	2	10	134604	134613	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009665	AGGTT	2	10	135761	135770	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009665	TTCAA	2	10	146025	146034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009665	GAAGT	2	10	146084	146093	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009665	CGCGA	2	10	150549	150558	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009665	CACTC	2	10	159554	159563	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009665	ATCTA	2	10	159687	159696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009665	CATTT	2	10	159776	159785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009665	TGTGA	2	10	159789	159798	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009665	TCACT	2	10	160744	160753	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009665	ATTGG	2	10	171802	171811	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009665	ATTTG	2	10	175309	175318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009665	ATTTT	2	10	175349	175358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009665	TTTGT	2	10	193859	193868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009665	CTTAT	2	10	206010	206019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009665	AGTCG	2	10	221784	221793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009665	AGGCT	2	10	222111	222120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009665	ATCCC	2	10	223762	223771	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_009665	AGTCG	2	10	273088	273097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009665	AGGCT	2	10	273415	273424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009665	ATCCC	2	10	275061	275070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_009665	TCCGC	2	10	275247	275256	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_009665	TAATT	2	10	276516	276525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009665	ATTCA	2	10	294495	294504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009665	TGGCT	2	10	304236	304245	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009665	AAGTT	2	10	310917	310926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009665	CTTAT	2	10	310960	310969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009665	ATAAG	2	10	319060	319069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009665	AGTGG	2	10	324607	324616	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009665	TTTAA	2	10	343332	343341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009665	GTATT	2	10	343668	343677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009665	TTTAA	2	10	364423	364432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009665	GCTTT	2	10	399979	399988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009665	GCGGT	2	10	402476	402485	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009665	TTCAA	2	10	413093	413102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009665	GAAGT	2	10	413152	413161	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009665	CAATC	2	10	423607	423616	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009665	GATAG	2	10	437039	437048	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009665	ATCCC	2	10	439655	439664	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009665	GTTAT	2	10	455749	455758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009665	TAGAA	2	10	460966	460975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009665	AAAGC	2	10	461082	461091	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009665	AGTCG	2	10	465009	465018	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009665	AGGCT	2	10	465336	465345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009665	ATCCC	2	10	467039	467048	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_009665	ATCCC	2	10	467306	467315	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_009665	GAAAA	2	10	478488	478497	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009665	ATTCG	2	10	479220	479229	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009665	TCGGA	2	10	484847	484856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009665	CTAGG	2	10	484916	484925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009665	ACGAT	2	10	496677	496686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009665	AAAGC	2	10	502100	502109	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009665	AGATA	2	10	502453	502462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009665	AGGAT	2	10	507078	507087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009665	ACTTA	2	10	556179	556188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009665	TGATT	2	10	591206	591215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009665	AGCTT	2	10	591636	591645	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009665	AATCA	2	10	608830	608839	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009665	GACGT	2	10	630529	630538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009665	TTCTT	2	10	653068	653077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009665	ATGGG	2	10	655505	655514	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009665	TTAAA	2	10	658536	658545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009665	GTGCT	2	10	659938	659947	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009665	TAATT	2	10	660033	660042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009665	ATATT	3	15	661668	661682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009665	ATTTT	2	10	661697	661706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009665	TATTT	2	10	668802	668811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009665	GTCGA	2	10	691321	691330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009665	ATAAA	2	10	693269	693278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009665	AATAT	2	10	696639	696648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009665	TGAAG	2	10	696787	696796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009665	GGAAC	2	10	700724	700733	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009665	GAAGT	2	10	700873	700882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009665	ATTGT	2	10	701327	701336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009665	ACTTT	2	10	701338	701347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009665	ATTCA	2	10	702380	702389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009665	TTTAT	2	10	707926	707935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009665	GATCA	2	10	710376	710385	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009665	ATATT	2	10	710845	710854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009665	TAAAC	2	10	714669	714678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009665	ATATA	2	10	717662	717671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009665	CTAAT	2	10	717815	717824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009665	CCTAT	2	10	719107	719116	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009665	TTTGT	2	10	741318	741327	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009665	ATAGA	2	10	747145	747154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009665	ACTGA	2	10	750342	750351	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009665	TTGTT	2	10	756415	756424	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009665	TTATT	2	10	768701	768710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009665	GTTTT	2	10	786250	786259	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009665	GAAAG	2	10	787734	787743	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009665	TCCAT	2	10	787933	787942	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009665	ATCCT	2	10	792569	792578	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009665	TAAAA	2	10	792962	792971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009665	TGTAA	2	10	796421	796430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009665	GTTTG	2	10	822884	822893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009665	TTTTA	2	10	823660	823669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009665	TTCAA	2	10	823935	823944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009665	ATCAC	2	10	825103	825112	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009665	ATGAA	2	10	827835	827844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009665	TGTGT	2	10	852606	852615	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009665	GTGCT	2	10	859200	859209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009665	CCATT	2	10	862434	862443	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009665	TTTAA	2	10	866092	866101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009665	GAAAA	2	10	867064	867073	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009665	GTTGC	2	10	867430	867439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009665	ATTTT	2	10	876893	876902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009665	ATTTT	2	10	914851	914860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009665	AAATC	2	10	944601	944610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009665	TTGAA	2	10	959786	959795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009665	AGTCG	2	10	963181	963190	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009665	AGGCT	2	10	963508	963517	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009665	ATCCC	2	10	965211	965220	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_009665	CCGTC	2	10	966548	966557	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_009665	GAAAG	2	10	967732	967741	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009665	TCCAT	2	10	967931	967940	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_009665	TAGGA	2	10	973910	973919	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009665	TGTTA	2	10	981147	981156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009665	GAATC	2	10	986172	986181	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009665	TAACT	2	10	986273	986282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009665	CGCGA	2	10	986335	986344	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009665	AGAGG	2	10	986364	986373	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009665	CATGA	2	10	993502	993511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009665	TTTAT	2	10	1018181	1018190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009665	ATTCA	2	10	1021634	1021643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009665	TAAAG	2	10	1022180	1022189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009665	CAGCG	2	10	1022254	1022263	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009665	GCGAG	2	10	1024490	1024499	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_009665	ATTTT	2	10	3098436	3098445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009665	GAGCT	2	10	3105861	3105870	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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