MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurovum sp. NBC37-1 chromosome

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009663	GAGGT	2	10	35082	35091	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009663	CAAAT	2	10	35517	35526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009663	TCAAT	2	10	37142	37151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009663	TCGTG	2	10	38516	38525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009663	TTAGT	2	10	41009	41018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009663	CCGTA	2	10	41209	41218	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009663	AGATG	2	10	43360	43369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009663	ATCTC	2	10	43509	43518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009663	GTTCA	2	10	44492	44501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009663	AGAGA	2	10	45147	45156	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009663	GCTTT	2	10	45600	45609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009663	TGCCT	2	10	45650	45659	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009663	GATAA	2	10	59523	59532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009663	TTGCT	2	10	63224	63233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009663	CACAC	2	10	136616	136625	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009663	ATTCA	2	10	136739	136748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009663	TAATA	2	10	139997	140006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009663	TAAAA	2	10	145502	145511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009663	ATGCT	2	10	163975	163984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009663	ATTGG	2	10	175065	175074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009663	TTTGC	2	10	192400	192409	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009663	CAATT	2	10	196464	196473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009663	TAATA	2	10	222265	222274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009663	GCCTA	2	10	223092	223101	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009663	CTAAA	2	10	223149	223158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009663	TTTCA	2	10	232251	232260	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009663	TCAAA	2	10	234187	234196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009663	GGAAA	2	10	240848	240857	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009663	TAAAA	2	10	269713	269722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009663	TAATT	2	10	272804	272813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009663	AGAAC	2	10	284842	284851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009663	TCGCT	2	10	296496	296505	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009663	ATTTT	2	10	315533	315542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009663	AGTTG	2	10	340399	340408	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009663	GTTTA	2	10	348225	348234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009663	CGATG	2	10	348394	348403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009663	TAAAA	2	10	353614	353623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009663	ACATA	2	10	377154	377163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009663	AATAA	2	10	377176	377185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009663	TAAAA	2	10	377961	377970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009663	CTAGG	2	10	386169	386178	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009663	TAATA	2	10	393634	393643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009663	AAAAT	2	10	409088	409097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009663	AAATA	2	10	413201	413210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009663	ATATA	2	10	417181	417190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009663	CAAAA	2	10	450839	450848	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009663	TCGCT	2	10	463622	463631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009663	TTGTA	2	10	493453	493462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009663	CTAGG	2	10	521188	521197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009663	TGCTT	2	10	534246	534255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009663	ATAGA	2	10	536645	536654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009663	TCGTG	2	10	557566	557575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009663	TTAGT	2	10	559967	559976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009663	CCGTA	2	10	560167	560176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009663	ATTTT	2	10	579447	579456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009663	TTAAA	2	10	587015	587024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009663	CTTAT	2	10	588511	588520	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009663	TTTAT	2	10	590099	590108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009663	CTTTA	2	10	594511	594520	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009663	GAATA	2	10	594600	594609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009663	TGTTT	2	10	599194	599203	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009663	TCCCC	2	10	602646	602655	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
63	NC_009663	CAATA	2	10	610223	610232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009663	TTTAC	2	10	624815	624824	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009663	AATAA	2	10	638973	638982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009663	GTTTT	2	10	649687	649696	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009663	TATTT	2	10	658918	658927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009663	GATGG	2	10	659856	659865	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009663	TATAA	2	10	665001	665010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009663	ATTTT	2	10	665399	665408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009663	TATTT	2	10	682686	682695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009663	AATTG	2	10	691358	691367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009663	TAACA	2	10	696076	696085	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009663	AATAT	2	10	702066	702075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009663	TATAT	2	10	708426	708435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009663	TATAT	2	10	709307	709316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009663	GATCT	2	10	718275	718284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009663	TATAG	2	10	729208	729217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009663	GTATA	2	10	771659	771668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009663	ACACT	2	10	775905	775914	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009663	ATATA	2	10	777804	777813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009663	TTATA	2	10	777844	777853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009663	ATTTT	2	10	793047	793056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009663	TTCTA	2	10	797167	797176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009663	AAAAC	2	10	807708	807717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009663	CACTG	2	10	809394	809403	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009663	TGCAG	2	10	813493	813502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009663	TTGTT	2	10	822543	822552	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009663	TCGCT	2	10	823348	823357	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009663	GAGTT	2	10	828483	828492	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009663	TCTGC	2	10	854606	854615	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009663	TGTTT	2	10	857102	857111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009663	CTAGG	2	10	876209	876218	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009663	TATAA	2	10	876428	876437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009663	TACCA	2	10	887368	887377	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009663	CTAGG	2	10	913320	913329	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009663	TTTAA	2	10	930807	930816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009663	GCCTA	2	10	942329	942338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009663	ATAAA	2	10	951133	951142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009663	TCTTT	2	10	952048	952057	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009663	AAGAA	3	15	954804	954818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009663	GAAAT	2	10	966866	966875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009663	CACTA	2	10	966890	966899	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009663	TATAA	2	10	971005	971014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009663	ATTCA	2	10	971018	971027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009663	CGCTG	2	10	971522	971531	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009663	AGAGG	2	10	993680	993689	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009663	GATCT	2	10	1013979	1013988	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009663	GTATT	2	10	1025203	1025212	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009663	GGAAG	2	10	1029006	1029015	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009663	TAAGT	2	10	1032535	1032544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009663	CAAAA	2	10	1032643	1032652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009663	ATAAA	2	10	1035912	1035921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009663	TTTCC	2	10	1044935	1044944	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009663	TTTGA	2	10	1046038	1046047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009663	TTATC	2	10	1047765	1047774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009663	CGATG	2	10	1051435	1051444	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009663	TGGCA	2	10	1061588	1061597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009663	ATTGA	2	10	1080340	1080349	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009663	TTCTC	2	10	1097282	1097291	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009663	TAAGA	2	10	1109540	1109549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009663	TAAAA	2	10	1114207	1114216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009663	TACGA	2	10	1114396	1114405	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009663	TAAAA	2	10	1114847	1114856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009663	ATATA	2	10	1115404	1115413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009663	TAAAA	2	10	1119276	1119285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009663	TAAAA	2	10	1119404	1119413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009663	TAAAA	2	10	1119530	1119539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009663	AAACC	2	10	1119674	1119683	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_009663	TACGA	2	10	1119772	1119781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009663	TAAAA	2	10	1120557	1120566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009663	ATTAT	2	10	1154999	1155008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009663	TTATA	2	10	1165563	1165572	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009663	AAATT	2	10	1165627	1165636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009663	TATTT	2	10	1165646	1165655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009663	AAAAT	2	10	1176466	1176475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009663	ACCTA	2	10	1187043	1187052	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_009663	AGTAA	2	10	1187336	1187345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009663	TACTC	2	10	1187632	1187641	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009663	GCCTA	2	10	1201180	1201189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009663	TTTTA	2	10	1201349	1201358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009663	GTTTG	2	10	1204521	1204530	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009663	CATGC	2	10	1215356	1215365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009663	AAAAG	2	10	1230250	1230259	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009663	GATCT	2	10	1230264	1230273	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009663	CATTA	2	10	1232932	1232941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009663	TTCTA	2	10	1232979	1232988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009663	CTCTG	2	10	1239155	1239164	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_009663	TTCTT	2	10	1252057	1252066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_009663	ATGCA	2	10	1252113	1252122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_009663	GGAAT	2	10	1263716	1263725	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009663	AGCGA	2	10	1272354	1272363	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_009663	AGCGA	2	10	1273445	1273454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_009663	TAATT	2	10	1279030	1279039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009663	TATAA	2	10	1285294	1285303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009663	TTTAC	2	10	1294275	1294284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_009663	TTTTC	2	10	1294287	1294296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_009663	ATCTT	2	10	1312984	1312993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_009663	AGCCA	2	10	1337417	1337426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_009663	TATCA	2	10	1339625	1339634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_009663	AATAA	2	10	1347695	1347704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009663	TCTGT	2	10	1349394	1349403	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_009663	AATAA	2	10	1356616	1356625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009663	AATTA	2	10	1380253	1380262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009663	TAATT	2	10	1380279	1380288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_009663	GCTTA	2	10	1400727	1400736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_009663	AGATT	2	10	1404193	1404202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009663	AATAA	2	10	1411929	1411938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009663	TTATG	2	10	1413956	1413965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009663	CTCTT	2	10	1429749	1429758	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_009663	GATAT	2	10	1455145	1455154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_009663	TTACA	2	10	1505039	1505048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_009663	CAATA	2	10	1505598	1505607	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_009663	TGTGA	2	10	1505638	1505647	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009663	ATTTT	2	10	1518547	1518556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009663	TTTTA	2	10	1527025	1527034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009663	AAATT	2	10	1546103	1546112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009663	TGATA	2	10	1549905	1549914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009663	ATTGA	2	10	1549929	1549938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009663	TGATA	2	10	1552207	1552216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009663	GCCTA	2	10	1554460	1554469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_009663	ATTTA	2	10	1571538	1571547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009663	ATCCT	2	10	1587656	1587665	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
194	NC_009663	ACTTC	2	10	1605118	1605127	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
195	NC_009663	TACAA	2	10	1617473	1617482	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_009663	TTTAT	2	10	1646673	1646682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_009663	TTAAC	2	10	1713998	1714007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_009663	TAAAA	2	10	1822048	1822057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_009663	CTTTA	2	10	1977377	1977386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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250	NC_009663	CTAGG	2	10	2209528	2209537	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_009663	ACTTT	2	10	2415225	2415234	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_009663	TGTCG	2	10	2463149	2463158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_009663	AGCGA	2	10	2463171	2463180	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
281	NC_009663	GAAGC	2	10	2487281	2487290	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_009663	GCAGG	2	10	2487348	2487357	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
283	NC_009663	AGATC	2	10	2514413	2514422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
284	NC_009663	GAAGC	2	10	2515002	2515011	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_009663	TTTTA	2	10	2520454	2520463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009663	CTTTA	2	10	2520504	2520513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_009663	TTTTA	2	10	2556131	2556140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009663	AATTT	2	10	2556146	2556155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009663	TACAA	2	10	2557072	2557081	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_009663	AGTAT	2	10	2557277	2557286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009663	AGTAA	2	10	2561596	2561605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.