MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	TGAAC	2	10	6982	6991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009641	AGGAA	2	10	14349	14358	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009641	GTAGG	2	10	14409	14418	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009641	TCGAT	2	10	23817	23826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009641	ATATT	2	10	24355	24364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009641	TTTTA	2	10	36461	36470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009641	GTGTT	2	10	42091	42100	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009641	AGAAA	2	10	49126	49135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009641	TAAAG	2	10	49167	49176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009641	ATTCA	2	10	49439	49448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009641	GTAAT	2	10	70706	70715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009641	ATTTT	2	10	93461	93470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009641	TTGTA	2	10	109768	109777	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009641	GGGGC	2	10	115371	115380	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009641	CAAAA	2	10	138815	138824	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009641	AAAGC	2	10	139165	139174	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009641	CGTTT	2	10	140384	140393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009641	TATCA	2	10	148960	148969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009641	ATCAT	2	10	157092	157101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009641	CAACT	2	10	169223	169232	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009641	GCTTT	2	10	173735	173744	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009641	TGATT	2	10	174081	174090	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009641	TAACA	2	10	180307	180316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009641	TAATG	2	10	188605	188614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009641	AAAGC	2	10	197995	198004	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009641	AATAT	2	10	199487	199496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009641	TATTT	2	10	205478	205487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009641	AACAT	2	10	213769	213778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009641	GATAA	2	10	217722	217731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009641	ATAAC	2	10	222369	222378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009641	TGAAT	2	10	222480	222489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009641	ATTAA	2	10	222621	222630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009641	AAAGT	2	10	226365	226374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009641	AATTA	2	10	226478	226487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009641	TAAAA	2	10	228078	228087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009641	AAATT	2	10	229394	229403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009641	TAAAA	2	10	243541	243550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009641	GAAAA	2	10	251332	251341	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009641	ATAAA	2	10	251450	251459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009641	TCATA	2	10	259859	259868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009641	ATTTA	2	10	275685	275694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009641	AAATG	2	10	293071	293080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009641	TAAAT	2	10	311517	311526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009641	AAATT	2	10	315210	315219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009641	ATTTT	2	10	317075	317084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009641	TTAAA	2	10	322259	322268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009641	AAATC	2	10	322292	322301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009641	GAAAG	2	10	326297	326306	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009641	AAACT	2	10	331980	331989	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009641	ATTAA	2	10	338086	338095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009641	ATAGA	2	10	366501	366510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009641	TGACA	2	10	366693	366702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009641	GATAA	2	10	378996	379005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009641	ATTAA	2	10	384415	384424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009641	GTAAT	2	10	413802	413811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009641	AGATA	2	10	414787	414796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009641	AGAAT	2	10	415028	415037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009641	TAAGG	2	10	415092	415101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009641	TAAAT	2	10	422537	422546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009641	ACAGT	2	10	425110	425119	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009641	CATAA	2	10	435587	435596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009641	TAAAA	2	10	435811	435820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009641	AATAT	2	10	437956	437965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009641	AAAGT	2	10	449913	449922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009641	AAATT	2	10	453103	453112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009641	TTAAA	2	10	458115	458124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009641	TAAAG	2	10	464253	464262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009641	CTCAC	2	10	466158	466167	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_009641	CAAAG	2	10	466183	466192	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009641	TTGTA	2	10	474184	474193	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009641	ATTAT	2	10	474351	474360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009641	CTTAA	2	10	483891	483900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009641	TGGTG	2	10	501708	501717	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009641	CAACT	2	10	502273	502282	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009641	GGTAA	2	10	502746	502755	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009641	TCGTG	2	10	503565	503574	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009641	GATTG	2	10	505899	505908	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009641	GATTT	2	10	511089	511098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009641	ATATA	2	10	513507	513516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009641	CAAAG	2	10	520055	520064	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009641	TTGAT	2	10	523216	523225	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009641	AGACA	2	10	537177	537186	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009641	AAGTA	2	10	539612	539621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009641	TTAAA	2	10	541736	541745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009641	GATAA	2	10	541775	541784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009641	GGTAA	2	10	547305	547314	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009641	TCGTG	2	10	548124	548133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009641	GATTG	2	10	550430	550439	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009641	ATATA	2	10	557046	557055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009641	AAAAT	2	10	561821	561830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009641	TTTAT	2	10	561930	561939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009641	TTATG	2	10	564936	564945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009641	ATTTA	2	10	565081	565090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009641	TGAAT	2	10	571353	571362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009641	GTATA	2	10	571410	571419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009641	TATAA	2	10	575127	575136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009641	GTTTA	2	10	591293	591302	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009641	TAAAG	2	10	595488	595497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009641	GAAGC	2	10	596843	596852	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009641	ATATT	2	10	601623	601632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009641	TTAAC	2	10	604517	604526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009641	AATTT	2	10	604602	604611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009641	ATAAA	2	10	612789	612798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009641	TTATA	2	10	627166	627175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009641	CACAT	2	10	627562	627571	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009641	ATGAT	2	10	636586	636595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009641	TAATT	2	10	640073	640082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009641	TAAGT	2	10	645059	645068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009641	TATTG	2	10	646519	646528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009641	ATTAT	2	10	647340	647349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009641	TTTAA	2	10	649616	649625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009641	AAATT	2	10	652859	652868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009641	TAAAT	2	10	655452	655461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009641	AAATT	2	10	657456	657465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009641	TAAAA	2	10	664595	664604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009641	ATTAA	2	10	666783	666792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009641	TTATT	2	10	666832	666841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009641	CAATA	2	10	666898	666907	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009641	TTAAT	2	10	669523	669532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009641	ATTTT	2	10	671810	671819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009641	ATATA	2	10	671866	671875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009641	ATAAA	2	10	678502	678511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009641	TTTTA	2	10	680768	680777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009641	AAAGG	2	10	681089	681098	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009641	ATATA	2	10	684459	684468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009641	AAACT	2	10	687982	687991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009641	TTCAC	2	10	693195	693204	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009641	TTTGT	2	10	697103	697112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009641	AATGA	2	10	697176	697185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009641	GGTTG	2	10	704178	704187	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009641	AGTAG	2	10	713886	713895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009641	AAGTT	2	10	714335	714344	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009641	AATTG	2	10	714367	714376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009641	AAACT	2	10	716242	716251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009641	ATTTA	2	10	716633	716642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009641	AAAGT	2	10	718881	718890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009641	AATTT	2	10	721490	721499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009641	CATGA	2	10	723650	723659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009641	ATCAT	2	10	728241	728250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009641	AATTT	2	10	733133	733142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009641	AATTA	2	10	739935	739944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009641	ATTTA	2	10	744116	744125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009641	AAAGT	2	10	744209	744218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009641	TAAAG	2	10	746044	746053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009641	ATTTT	2	10	756596	756605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_009641	TAAAA	2	10	762433	762442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_009641	AAATA	2	10	1331933	1331942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009641	AAATT	2	10	1332124	1332133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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