MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 1959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009641	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009641	ATTA	2	8	3324	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009641	AATT	2	8	3580	3587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009641	ATTA	2	8	3799	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009641	TTCT	2	8	3889	3896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009641	TCAT	2	8	3900	3907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009641	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009641	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009641	TAAA	2	8	14544	14551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009641	TGCT	2	8	23803	23810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009641	ATCT	2	8	24137	24144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009641	GCCT	2	8	24265	24272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009641	ATTT	2	8	24597	24604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009641	TTGA	2	8	30880	30887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009641	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009641	TTCA	2	8	34239	34246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009641	ATAA	2	8	34445	34452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009641	ATAA	2	8	34455	34462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009641	ATCA	2	8	34580	34587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009641	CATA	2	8	37150	37157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009641	ATTA	2	8	38007	38014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009641	TCCT	2	8	38151	38158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009641	TAAT	2	8	42293	42300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009641	TGAC	2	8	42328	42335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009641	ATTT	2	8	44020	44027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009641	CATT	2	8	47476	47483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009641	TAGT	2	8	47530	47537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009641	GATT	2	8	47541	47548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009641	TTGA	2	8	49063	49070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009641	AATA	2	8	50245	50252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009641	AGCT	2	8	54073	54080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009641	TAAT	2	8	54218	54225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009641	AGAA	2	8	54237	54244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009641	TTGT	2	8	55356	55363	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009641	AATC	2	8	56254	56261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009641	AATC	2	8	57076	57083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009641	AATC	2	8	57910	57917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009641	ATAA	2	8	61156	61163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009641	TTAT	2	8	63947	63954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009641	ATAA	2	8	64245	64252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009641	CAAT	2	8	66117	66124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009641	AGGG	2	8	69172	69179	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009641	AAAG	2	8	70754	70761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009641	ATAA	2	8	71295	71302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009641	TATT	2	8	71333	71340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009641	AGTA	2	8	73275	73282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009641	TTGT	2	8	73418	73425	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009641	AAAT	2	8	75067	75074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009641	ATTG	2	8	76313	76320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009641	GTTA	2	8	76435	76442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009641	TAAA	2	8	91080	91087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009641	TAAA	2	8	91118	91125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009641	TAAA	2	8	91575	91582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009641	GAAA	2	8	92408	92415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009641	ATAA	2	8	93226	93233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009641	TAAA	2	8	93473	93480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009641	AAAT	2	8	99385	99392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009641	ATTA	2	8	99419	99426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009641	ATTA	2	8	100258	100265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009641	TAAA	2	8	100282	100289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009641	GAGC	2	8	101196	101203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009641	TGAA	2	8	101259	101266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009641	ATAG	2	8	102171	102178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009641	TAAA	2	8	104448	104455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009641	CTTT	2	8	108881	108888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009641	TGGT	2	8	109334	109341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009641	CTTT	2	8	110157	110164	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009641	ATTT	2	8	110244	110251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009641	AAGA	2	8	111830	111837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009641	ACTT	2	8	113415	113422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009641	AAAT	2	8	115225	115232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009641	AAAT	2	8	115443	115450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009641	CCAA	2	8	115545	115552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009641	GTAA	2	8	115624	115631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009641	GAAA	2	8	115719	115726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009641	GTTA	2	8	115775	115782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009641	AAGG	2	8	116134	116141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009641	ATTT	2	8	116378	116385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009641	TATT	2	8	119222	119229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009641	ATAA	2	8	119349	119356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009641	TAAT	2	8	119384	119391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009641	TAAA	2	8	133509	133516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009641	AATA	2	8	138733	138740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009641	ATTA	2	8	138965	138972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009641	GTTT	2	8	139013	139020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009641	TAAC	2	8	139113	139120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009641	TGTA	2	8	140501	140508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009641	TTTA	2	8	140626	140633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009641	GAGT	2	8	142377	142384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009641	TCAT	2	8	147127	147134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009641	TTTG	2	8	147210	147217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009641	ATTT	2	8	148576	148583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009641	ATTT	2	8	148588	148595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009641	ATGT	2	8	148819	148826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009641	TTAA	2	8	148940	148947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009641	AGTA	2	8	148982	148989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009641	AAGT	2	8	156987	156994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009641	ATCA	2	8	157126	157133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009641	TAAA	2	8	157851	157858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009641	ATGT	2	8	162388	162395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009641	TTAA	2	8	163868	163875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009641	AATA	2	8	163918	163925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009641	AATA	2	8	163948	163955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009641	TATT	2	8	168706	168713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009641	CTTA	2	8	168794	168801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009641	TAAT	2	8	168820	168827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009641	TTTG	2	8	168910	168917	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009641	AAAG	2	8	169091	169098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009641	AGTT	2	8	173590	173597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009641	GTTA	2	8	177099	177106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009641	ATGT	2	8	177222	177229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009641	ATAA	2	8	180147	180154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009641	TAGT	2	8	180285	180292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009641	ATTT	2	8	180333	180340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009641	TGAA	2	8	188456	188463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009641	ATCA	2	8	190366	190373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009641	GGAT	2	8	190493	190500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009641	TGGT	2	8	197560	197567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009641	CTGG	2	8	197614	197621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009641	AGCA	2	8	197858	197865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009641	ATTT	2	8	197947	197954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009641	TTGT	2	8	199312	199319	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009641	TATT	2	8	200144	200151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009641	GAAA	2	8	201942	201949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009641	TTTG	2	8	205432	205439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009641	ACAT	2	8	205758	205765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009641	AAAG	2	8	208929	208936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009641	GAAG	2	8	209039	209046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009641	TTCA	2	8	214176	214183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009641	ATTA	2	8	217770	217777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009641	AATT	2	8	225796	225803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009641	AAAT	2	8	225824	225831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009641	AAAT	2	8	226306	226313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009641	ATTT	2	8	226399	226406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009641	AATT	2	8	227798	227805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009641	ATAA	2	8	227819	227826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009641	ATTT	2	8	227926	227933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009641	AAAT	2	8	228092	228099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009641	AAAT	2	8	228150	228157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009641	ATGT	2	8	228276	228283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009641	AGGT	2	8	231306	231313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009641	ATAA	2	8	231424	231431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009641	TTAA	2	8	232420	232427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009641	ATGT	2	8	232523	232530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009641	AGGG	2	8	235813	235820	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009641	GTAA	2	8	238237	238244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009641	TCAA	2	8	243500	243507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009641	CATA	2	8	243738	243745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009641	ATTA	2	8	244978	244985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009641	ATAA	2	8	244996	245003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009641	GTAA	2	8	256147	256154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009641	AAAT	2	8	258635	258642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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