MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009641	CAG	3	9	267743	267751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_009641	GCA	2	6	267802	267807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009641	CAA	2	6	267823	267828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009641	TTA	2	6	267876	267881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009641	ATC	2	6	267905	267910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009641	AC	3	6	267911	267916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_009641	T	6	6	268722	268727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009641	CTC	2	6	271496	271501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_009641	T	6	6	271569	271574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009641	GCC	2	6	271595	271600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_009641	T	7	7	271602	271608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009641	T	6	6	271782	271787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009641	TAT	2	6	271801	271806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009641	TCG	2	6	271827	271832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_009641	TCA	2	6	271923	271928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009641	TATT	2	8	271965	271972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009641	AGA	2	6	271985	271990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009641	TTA	2	6	273131	273136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009641	TAA	2	6	273182	273187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009641	TAA	2	6	273192	273197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009641	TAA	2	6	273211	273216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009641	A	6	6	273222	273227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009641	TAA	2	6	273270	273275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009641	T	7	7	273282	273288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009641	GAA	2	6	273292	273297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009641	ATTT	2	8	273299	273306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009641	A	6	6	274016	274021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009641	ATTTA	2	10	275685	275694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009641	TTAA	2	8	275732	275739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009641	AT	3	6	275742	275747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009641	AT	3	6	275759	275764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009641	A	8	8	275771	275778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009641	A	6	6	275791	275796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009641	TA	3	6	275798	275803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009641	TAA	2	6	275811	275816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009641	TA	3	6	275819	275824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009641	A	6	6	275850	275855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009641	AGG	2	6	275894	275899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009641	T	7	7	276253	276259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009641	AAC	2	6	276265	276270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_009641	TAATTA	2	12	279780	279791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009641	A	6	6	279831	279836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009641	TGA	2	6	279902	279907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009641	TTG	2	6	279923	279928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009641	AGG	2	6	279986	279991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009641	AGG	2	6	285809	285814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009641	TCA	2	6	289983	289988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_009641	A	6	6	290077	290082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009641	TA	4	8	290815	290822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009641	ATT	2	6	290852	290857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009641	ATG	2	6	290867	290872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009641	TTTA	2	8	291572	291579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009641	A	6	6	291589	291594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009641	TA	3	6	291596	291601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009641	T	6	6	291613	291618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009641	TAAA	2	8	291637	291644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009641	AAT	2	6	291656	291661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009641	GAA	2	6	291911	291916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009641	GTT	2	6	291937	291942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009641	TTTA	2	8	291951	291958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009641	GAA	2	6	293060	293065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009641	AAATG	2	10	293071	293080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009641	TAG	2	6	293104	293109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009641	TA	3	6	293136	293141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009641	TA	3	6	293150	293155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009641	GAT	2	6	293156	293161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009641	GGA	2	6	293162	293167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009641	A	6	6	294107	294112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009641	TCA	2	6	294133	294138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_009641	AAT	3	9	294139	294147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009641	ATT	2	6	295008	295013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009641	ATG	2	6	295023	295028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009641	ATT	2	6	295066	295071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009641	TGT	2	6	295098	295103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009641	TAT	2	6	295112	295117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009641	TTG	2	6	295125	295130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_009641	TTAT	2	8	295132	295139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009641	ATT	2	6	295161	295166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009641	TTTA	2	8	295198	295205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009641	A	6	6	295215	295220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009641	TA	3	6	295222	295227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009641	T	6	6	295239	295244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009641	TAAA	2	8	295263	295270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1086	NC_009641	TAT	2	6	295306	295311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1090	NC_009641	GTT	2	6	295459	295464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009641	TTTA	2	8	295473	295480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009641	AGA	2	6	299137	299142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009641	ATT	2	6	299157	299162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009641	CAT	2	6	299201	299206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_009641	A	6	6	299332	299337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009641	TA	3	6	299349	299354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009641	T	6	6	299366	299371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009641	TAAA	2	8	299405	299412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009641	TA	3	6	299413	299418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009641	TAT	2	6	299478	299483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009641	AAG	2	6	299541	299546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009641	TAAT	2	8	299559	299566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009641	GT	3	6	299667	299672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009641	CTTT	2	8	300085	300092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_009641	AAT	2	6	300136	300141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009641	TA	4	8	300175	300182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009641	ATA	4	12	300206	300217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009641	TAAA	2	8	300667	300674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009641	CT	3	6	300678	300683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_009641	AG	3	6	300717	300722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009641	A	7	7	300777	300783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009641	AAT	2	6	301729	301734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009641	AATT	2	8	301742	301749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009641	T	6	6	301783	301788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009641	ATTT	2	8	301797	301804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009641	AAT	2	6	301808	301813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009641	AGAC	2	8	301818	301825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_009641	A	6	6	301856	301861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009641	TCCT	2	8	303221	303228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_009641	ATA	2	6	303243	303248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009641	A	6	6	303253	303258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009641	TAT	2	6	303312	303317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009641	A	6	6	303323	303328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009641	AAT	2	6	303335	303340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009641	TAT	2	6	303351	303356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_009641	TGAG	2	8	303454	303461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_009641	TTA	2	6	303607	303612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_009641	ATA	2	6	303704	303709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009641	TAAA	2	8	303739	303746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009641	ATA	2	6	304773	304778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009641	AATT	2	8	304782	304789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009641	GTAT	2	8	304847	304854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_009641	ACG	2	6	304873	304878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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