MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009641	AAAAT	2	10	1421580	1421589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_009641	CCT	2	6	1424939	1424944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_009641	CTTT	2	8	1424962	1424969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_009641	TAT	2	6	1425030	1425035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_009641	T	6	6	1425062	1425067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_009641	ATA	2	6	1425087	1425092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_009641	A	6	6	1425122	1425127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009641	CAAAA	2	10	1425130	1425139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6009	NC_009641	AAT	2	6	1425172	1425177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009641	GAT	2	6	1425204	1425209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_009641	ATTC	2	8	1425578	1425585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_009641	TAT	2	6	1425620	1425625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_009641	CAGT	2	8	1425651	1425658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_009641	TCTA	2	8	1425671	1425678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_009641	AATG	2	8	1425751	1425758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_009641	TAT	2	6	1425759	1425764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009641	TAG	2	6	1427613	1427618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009641	T	7	7	1427666	1427672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_009641	AAT	2	6	1427684	1427689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_009641	AT	4	8	1427694	1427701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_009641	TAA	2	6	1427723	1427728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_009641	TA	3	6	1428378	1428383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009641	GATT	2	8	1429267	1429274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_009641	AAT	2	6	1431155	1431160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_009641	ATG	2	6	1431176	1431181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_009641	AAT	2	6	1431263	1431268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_009641	TCC	2	6	1432309	1432314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_009641	AAC	2	6	1432322	1432327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_009641	ATT	2	6	1432369	1432374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_009641	A	6	6	1432407	1432412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_009641	A	6	6	1432450	1432455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_009641	TAAAAT	2	12	1432470	1432481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_009641	A	7	7	1432544	1432550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_009641	CAG	2	6	1432551	1432556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_009641	CTG	2	6	1432587	1432592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_009641	TGA	2	6	1432678	1432683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009641	TTG	2	6	1432729	1432734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_009641	TAC	2	6	1432814	1432819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_009641	ATT	2	6	1433167	1433172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_009641	T	6	6	1433176	1433181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009641	A	6	6	1433200	1433205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_009641	A	8	8	1433236	1433243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_009641	TAT	3	9	1434204	1434212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_009641	TG	3	6	1434217	1434222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_009641	ATA	2	6	1434267	1434272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_009641	TTC	2	6	1434281	1434286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_009641	A	7	7	1434304	1434310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_009641	ATA	2	6	1435926	1435931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_009641	ATT	2	6	1435983	1435988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_009641	TTGT	2	8	1436041	1436048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009641	A	6	6	1436096	1436101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_009641	GCTA	2	8	1436102	1436109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_009641	TTCA	2	8	1436120	1436127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_009641	ACT	2	6	1436132	1436137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_009641	TATTT	2	10	1436254	1436263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_009641	T	6	6	1436261	1436266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_009641	ATTT	2	8	1436336	1436343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_009641	ATTTT	2	10	1436378	1436387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_009641	CAC	2	6	1436405	1436410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_009641	A	6	6	1436458	1436463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009641	TAA	2	6	1436521	1436526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_009641	TGA	2	6	1436532	1436537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009641	ATCA	2	8	1436543	1436550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_009641	TTG	2	6	1436633	1436638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_009641	ATT	2	6	1436669	1436674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_009641	AAT	2	6	1436679	1436684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_009641	TA	3	6	1436700	1436705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_009641	T	7	7	1436739	1436745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_009641	ATT	2	6	1436746	1436751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_009641	AGG	2	6	1436772	1436777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_009641	ATT	2	6	1438026	1438031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_009641	ATT	2	6	1440668	1440673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_009641	TAA	2	6	1441409	1441414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009641	TA	3	6	1441505	1441510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_009641	A	6	6	1445138	1445143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_009641	GAA	2	6	1445145	1445150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_009641	TTAG	2	8	1445161	1445168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_009641	TATT	2	8	1445173	1445180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_009641	TTAG	2	8	1445206	1445213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_009641	CAT	2	6	1445235	1445240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_009641	ATAC	2	8	1445241	1445248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_009641	CAT	2	6	1445264	1445269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_009641	TCG	2	6	1445685	1445690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_009641	ATTAT	2	10	1445703	1445712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_009641	AT	3	6	1445717	1445722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009641	A	7	7	1445752	1445758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_009641	TAA	2	6	1445802	1445807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_009641	CTT	2	6	1445826	1445831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_009641	GTTA	2	8	1445840	1445847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_009641	ATTC	2	8	1446096	1446103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6091	NC_009641	A	6	6	1446126	1446131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_009641	AAT	2	6	1446170	1446175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_009641	TAT	2	6	1446191	1446196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_009641	TTA	2	6	1446204	1446209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_009641	CAATA	2	10	1446218	1446227	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6096	NC_009641	A	6	6	1446230	1446235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_009641	GAC	2	6	1446625	1446630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_009641	AGT	2	6	1446644	1446649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_009641	T	7	7	1446668	1446674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_009641	TAA	2	6	1446690	1446695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_009641	TAAA	2	8	1446989	1446996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_009641	GA	3	6	1447651	1447656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_009641	A	6	6	1448819	1448824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_009641	TTTAG	2	10	1449475	1449484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_009641	TATT	2	8	1449488	1449495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_009641	ATTT	2	8	1449525	1449532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_009641	T	7	7	1449576	1449582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_009641	GTA	2	6	1449616	1449621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_009641	CAG	2	6	1449728	1449733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_009641	CTG	2	6	1449764	1449769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_009641	T	7	7	1449770	1449776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_009641	TAT	2	6	1449803	1449808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_009641	T	7	7	1451167	1451173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_009641	AAT	2	6	1451183	1451188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_009641	A	6	6	1451211	1451216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_009641	TAA	2	6	1451217	1451222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_009641	TGT	2	6	1451240	1451245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_009641	AAACA	2	10	1451255	1451264	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6121	NC_009641	TGT	2	6	1451269	1451274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_009641	AAAAT	2	10	1451294	1451303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_009641	TGA	2	6	1451332	1451337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_009641	TAAA	2	8	1454089	1454096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_009641	A	6	6	1454099	1454104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_009641	CTATT	2	10	1454143	1454152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6127	NC_009641	AAT	2	6	1454239	1454244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_009641	A	7	7	1454477	1454483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_009641	TATCTT	2	12	1455306	1455317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6130	NC_009641	TAT	2	6	1455321	1455326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_009641	TTGATT	2	12	1455369	1455380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_009641	ATA	2	6	1455441	1455446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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