MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009641	T	6	6	1171835	1171840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_009641	TAG	2	6	1171862	1171867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_009641	TAAT	2	8	1171873	1171880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_009641	AT	3	6	1171912	1171917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_009641	AT	3	6	1171946	1171951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_009641	TAT	2	6	1172080	1172085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_009641	AAT	2	6	1172122	1172127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_009641	ATAA	2	8	1172134	1172141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_009641	AT	3	6	1172142	1172147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_009641	T	6	6	1172712	1172717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_009641	TG	3	6	1172720	1172725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_009641	T	6	6	1172763	1172768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_009641	TGA	2	6	1172786	1172791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_009641	AGAT	2	8	1172798	1172805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009641	TAT	2	6	1172822	1172827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009641	TTAA	2	8	1172841	1172848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_009641	TAA	2	6	1172888	1172893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_009641	ATA	2	6	1172901	1172906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009641	GGA	2	6	1172911	1172916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009641	TAAT	2	8	1173451	1173458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009641	ATGTT	2	10	1173462	1173471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_009641	A	6	6	1173486	1173491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_009641	TA	3	6	1173537	1173542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_009641	AGTA	2	8	1173546	1173553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_009641	A	6	6	1173947	1173952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_009641	AATG	2	8	1174014	1174021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_009641	ATT	2	6	1174092	1174097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009641	T	6	6	1174113	1174118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009641	GTA	2	6	1174192	1174197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_009641	T	6	6	1174229	1174234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_009641	AG	3	6	1174256	1174261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_009641	TGGGG	2	10	1174353	1174362	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009641	AG	3	6	1174425	1174430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_009641	CAA	2	6	1174449	1174454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_009641	T	6	6	1174658	1174663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_009641	ATA	2	6	1174704	1174709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_009641	AT	3	6	1174951	1174956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_009641	TGA	3	9	1175070	1175078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_009641	AAT	2	6	1175182	1175187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_009641	AAG	2	6	1175266	1175271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_009641	AT	4	8	1175276	1175283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_009641	ATG	2	6	1175286	1175291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_009641	AAG	2	6	1175292	1175297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_009641	CAT	2	6	1175313	1175318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_009641	TTG	2	6	1175319	1175324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_009641	TAA	2	6	1175326	1175331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_009641	TAAT	2	8	1175340	1175347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_009641	CATG	2	8	1175359	1175366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_009641	TA	4	8	1175368	1175375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_009641	CAC	2	6	1175408	1175413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_009641	CTT	2	6	1175435	1175440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_009641	AT	3	6	1175448	1175453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_009641	AAT	2	6	1175467	1175472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_009641	TA	4	8	1175512	1175519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_009641	CCT	2	6	1175796	1175801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_009641	AAT	2	6	1175961	1175966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_009641	AT	3	6	1175974	1175979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009641	TA	3	6	1176025	1176030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_009641	ACA	2	6	1176040	1176045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_009641	TTAAA	2	10	1176137	1176146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_009641	TTAA	2	8	1176158	1176165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_009641	CAT	2	6	1176197	1176202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_009641	TATT	2	8	1176234	1176241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_009641	AAT	2	6	1176254	1176259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_009641	T	6	6	1177241	1177246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_009641	AAT	2	6	1177265	1177270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_009641	TGA	3	9	1177367	1177375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_009641	ATT	2	6	1177379	1177384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_009641	TTTA	2	8	1177405	1177412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_009641	TTTG	2	8	1177527	1177534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_009641	AATT	2	8	1177590	1177597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_009641	TAAA	2	8	1177604	1177611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_009641	TA	3	6	1177619	1177624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_009641	TAA	2	6	1177640	1177645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_009641	ATTA	2	8	1177667	1177674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_009641	TTAG	2	8	1177799	1177806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_009641	TTA	3	9	1177922	1177930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_009641	AT	3	6	1177940	1177945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_009641	GAAAT	2	10	1177952	1177961	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_009641	ACTG	2	8	1177971	1177978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_009641	TAA	2	6	1177982	1177987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_009641	TAA	2	6	1178249	1178254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_009641	ATA	2	6	1178289	1178294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_009641	ATATT	2	10	1178317	1178326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_009641	GTA	2	6	1178328	1178333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_009641	AT	3	6	1178674	1178679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_009641	TAT	2	6	1178693	1178698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_009641	TTA	2	6	1179584	1179589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_009641	ATT	3	9	1179595	1179603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_009641	TTG	2	6	1180351	1180356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_009641	TAAA	2	8	1181211	1181218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_009641	TAAA	2	8	1181233	1181240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_009641	TAG	2	6	1181251	1181256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009641	TAA	2	6	1181308	1181313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009641	TA	3	6	1181327	1181332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_009641	ATT	2	6	1181352	1181357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_009641	CTA	2	6	1181453	1181458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_009641	TAA	2	6	1181473	1181478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_009641	ATT	2	6	1181491	1181496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009641	TAG	2	6	1181519	1181524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_009641	TAAAA	2	10	1181565	1181574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_009641	TAT	2	6	1183592	1183597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_009641	AAT	2	6	1183616	1183621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_009641	ATTTAT	2	12	1183654	1183665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_009641	TAT	2	6	1185285	1185290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009641	A	6	6	1185291	1185296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_009641	ACTAA	2	10	1185337	1185346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5122	NC_009641	ATT	3	9	1185356	1185364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_009641	AAT	2	6	1185377	1185382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_009641	AGTA	2	8	1185401	1185408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_009641	ATTAT	2	10	1185724	1185733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_009641	TAAAA	2	10	1185855	1185864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_009641	ATTA	2	8	1185871	1185878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_009641	TGC	2	6	1185906	1185911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_009641	TA	3	6	1185913	1185918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_009641	TAAA	2	8	1185924	1185931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_009641	TTA	2	6	1186077	1186082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_009641	TTC	2	6	1187085	1187090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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