MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 12636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009641	ACA	2	6	1038562	1038567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_009641	TTA	2	6	1038568	1038573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_009641	GAA	2	6	1038612	1038617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_009641	GAT	2	6	1038636	1038641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_009641	GTAT	2	8	1044571	1044578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_009641	T	6	6	1047379	1047384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_009641	T	6	6	1047391	1047396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009641	TTTTCT	2	12	1047536	1047547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4509	NC_009641	CTC	2	6	1049802	1049807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_009641	TCC	2	6	1050391	1050396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_009641	TAA	2	6	1050397	1050402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_009641	A	7	7	1050401	1050407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_009641	CCAT	2	8	1050415	1050422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_009641	AT	4	8	1050443	1050450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009641	GT	3	6	1050552	1050557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009641	ATTT	2	8	1050561	1050568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_009641	AATT	2	8	1050569	1050576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_009641	GTA	2	6	1050682	1050687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_009641	TAA	2	6	1050727	1050732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_009641	ATCA	2	8	1050763	1050770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_009641	AAC	2	6	1050780	1050785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_009641	GAA	2	6	1050789	1050794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_009641	GAA	2	6	1050831	1050836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_009641	AAC	2	6	1050875	1050880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_009641	AATT	2	8	1050902	1050909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_009641	TTGTT	2	10	1050928	1050937	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_009641	TCT	2	6	1050947	1050952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_009641	T	6	6	1050954	1050959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009641	CTT	2	6	1050960	1050965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_009641	T	6	6	1050964	1050969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_009641	CTT	2	6	1050990	1050995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_009641	CTG	2	6	1051005	1051010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_009641	T	6	6	1051012	1051017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009641	TCC	2	6	1051046	1051051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_009641	ATT	2	6	1051063	1051068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_009641	TA	4	8	1051069	1051076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_009641	TATT	2	8	1051125	1051132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_009641	ACA	3	9	1051146	1051154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_009641	AT	3	6	1051163	1051168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_009641	CTAT	2	8	1052506	1052513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_009641	AT	3	6	1052545	1052550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_009641	ACTT	2	8	1052556	1052563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_009641	T	7	7	1052596	1052602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_009641	TGAT	2	8	1052614	1052621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009641	AAATA	2	10	1052671	1052680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_009641	AT	3	6	1052755	1052760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_009641	AT	3	6	1052786	1052791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_009641	GAT	2	6	1052838	1052843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_009641	TA	3	6	1052870	1052875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_009641	AAG	2	6	1054118	1054123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_009641	ATA	2	6	1054128	1054133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_009641	GAATT	2	10	1054730	1054739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009641	TAA	2	6	1054788	1054793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_009641	TAAA	2	8	1056845	1056852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_009641	GTAA	2	8	1056868	1056875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_009641	T	6	6	1056895	1056900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_009641	TGT	2	6	1056926	1056931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_009641	CTAA	2	8	1056934	1056941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_009641	AAC	2	6	1056945	1056950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_009641	TAAT	2	8	1056979	1056986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_009641	GTTA	2	8	1056987	1056994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_009641	ATTTA	2	10	1057009	1057018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_009641	ATG	2	6	1057031	1057036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_009641	TGT	2	6	1057450	1057455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_009641	A	7	7	1057460	1057466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_009641	TAA	2	6	1059937	1059942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_009641	TGA	2	6	1059968	1059973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009641	A	6	6	1060838	1060843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_009641	ACT	2	6	1060874	1060879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_009641	TCA	2	6	1060927	1060932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_009641	TA	3	6	1060933	1060938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_009641	CTA	2	6	1060948	1060953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_009641	GTG	2	6	1060961	1060966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_009641	ACTTC	2	10	1060979	1060988	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4575	NC_009641	TAG	2	6	1060994	1060999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4577	NC_009641	TTC	2	6	1062828	1062833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_009641	A	6	6	1062902	1062907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_009641	TCC	2	6	1062933	1062938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_009641	TGTT	2	8	1062945	1062952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_009641	TA	3	6	1062989	1062994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_009641	ATTC	2	8	1063002	1063009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_009641	ATC	2	6	1063012	1063017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_009641	TAA	2	6	1063032	1063037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_009641	TAA	2	6	1063047	1063052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_009641	TCA	2	6	1063059	1063064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_009641	A	6	6	1063078	1063083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009641	ATG	2	6	1063126	1063131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009641	ATA	2	6	1063136	1063141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009641	TATT	2	8	1063197	1063204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_009641	AAAT	2	8	1063206	1063213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_009641	AAGA	2	8	1063236	1063243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_009641	AT	3	6	1063310	1063315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009641	TGT	2	6	1063321	1063326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_009641	CCTT	2	8	1063964	1063971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_009641	GTT	2	6	1064007	1064012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_009641	ACT	2	6	1064059	1064064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_009641	A	6	6	1064118	1064123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009641	ATTT	2	8	1064162	1064169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_009641	ATC	2	6	1064170	1064175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_009641	ATTAT	2	10	1064188	1064197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_009641	TGTAA	2	10	1064240	1064249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_009641	ATTTA	2	10	1064287	1064296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_009641	ATA	2	6	1064952	1064957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_009641	AAC	2	6	1064970	1064975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_009641	TAT	2	6	1064988	1064993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_009641	T	7	7	1065001	1065007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_009641	ATTT	2	8	1065045	1065052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_009641	AAATG	2	10	1067259	1067268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_009641	AGG	2	6	1067287	1067292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_009641	T	6	6	1070058	1070063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_009641	CATG	2	8	1070117	1070124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_009641	TTCG	2	8	1070447	1070454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_009641	TAA	2	6	1070498	1070503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_009641	T	6	6	1070570	1070575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_009641	TAG	2	6	1074924	1074929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4619	NC_009641	TGA	2	6	1076012	1076017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_009641	TTA	2	6	1076048	1076053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_009641	TTAA	2	8	1076091	1076098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_009641	ATC	2	6	1076155	1076160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_009641	TAT	2	6	1076179	1076184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_009641	GTA	2	6	1076247	1076252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_009641	TTA	2	6	1076256	1076261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_009641	AAAG	2	8	1076273	1076280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_009641	GTT	2	6	1076747	1076752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_009641	ATT	2	6	1076754	1076759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_009641	CAAC	2	8	1076765	1076772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_009641	CTT	2	6	1078159	1078164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_009641	ATA	2	6	1078174	1078179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_009641	TAA	2	6	1078183	1078188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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