MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009632	ATT	2	6	706487	706492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_009632	T	7	7	706507	706513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009632	AT	3	6	706526	706531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009632	A	7	7	706600	706606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009632	A	7	7	706612	706618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009632	ATC	2	6	706637	706642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_009632	ATA	2	6	707097	707102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009632	TTTA	2	8	707118	707125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009632	AT	3	6	707172	707177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3011	NC_009632	A	6	6	707230	707235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009632	ATT	2	6	707251	707256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009632	T	6	6	707316	707321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009632	TTAAT	2	10	707332	707341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_009632	ATTT	2	8	707357	707364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009632	TG	3	6	707405	707410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3018	NC_009632	CTA	2	6	707459	707464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_009632	T	7	7	707516	707522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009632	TA	3	6	707608	707613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009632	ATA	2	6	707642	707647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009632	TAAT	2	8	707740	707747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009632	ATT	2	6	707810	707815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_009632	A	6	6	707816	707821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009632	TGT	2	6	707879	707884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_009632	TAC	2	6	707894	707899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_009632	A	7	7	707935	707941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3029	NC_009632	TAA	3	9	708953	708961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009632	CATTAT	2	12	708975	708986	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3031	NC_009632	AAT	2	6	709011	709016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009632	A	7	7	709021	709027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009632	ATG	2	6	709064	709069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009632	CTTT	2	8	709109	709116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_009632	TCC	2	6	709353	709358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_009632	CCT	2	6	709575	709580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_009632	TA	3	6	709588	709593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009632	AAATA	2	10	709597	709606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009632	ATTTT	2	10	709619	709628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_009632	A	6	6	709646	709651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009632	AT	3	6	709660	709665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009632	AGG	2	6	710291	710296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009632	T	6	6	716245	716250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009632	TAT	2	6	716252	716257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009632	TGT	2	6	716265	716270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009632	GTT	2	6	716284	716289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_009632	ATAAA	2	10	716311	716320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009632	AAT	2	6	716325	716330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009632	AT	3	6	716359	716364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3052	NC_009632	TGA	2	6	718544	718549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3055	NC_009632	TA	3	6	718578	718583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_009632	TTA	2	6	718622	718627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_009632	CCA	2	6	718634	718639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_009632	TGG	2	6	718644	718649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_009632	TA	3	6	718651	718656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009632	GTTTGG	2	12	720041	720052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009632	A	7	7	720093	720099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009632	CCA	2	6	720118	720123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_009632	GAA	2	6	720132	720137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009632	TCA	2	6	720159	720164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_009632	TTTTA	2	10	720170	720179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009632	ATAG	2	8	720190	720197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009632	ATT	2	6	720213	720218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_009632	GGA	2	6	720256	720261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009632	A	6	6	720308	720313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009632	G	6	6	720360	720365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_009632	ATT	2	6	720419	720424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009632	AAAGG	2	10	720491	720500	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_009632	TAG	2	6	720555	720560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_009632	TAGT	2	8	720625	720632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_009632	CG	3	6	720652	720657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_009632	GT	3	6	720676	720681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_009632	AGC	2	6	720813	720818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_009632	TTAA	2	8	720895	720902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_009632	ACC	2	6	720955	720960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3083	NC_009632	AGG	2	6	720995	721000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009632	AT	4	8	721004	721011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_009632	CATCAA	2	12	721099	721110	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_009632	ATATA	2	10	723728	723737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_009632	ATGT	2	8	723742	723749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_009632	TTA	2	6	725281	725286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_009632	TAATTT	2	12	725339	725350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_009632	CCTT	2	8	727100	727107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_009632	TAC	2	6	727133	727138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_009632	TGT	2	6	727164	727169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_009632	AGA	2	6	727179	727184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009632	TTA	2	6	727190	727195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_009632	ATC	2	6	727226	727231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_009632	AAACT	2	10	727253	727262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_009632	TAA	2	6	727301	727306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009632	AAT	2	6	727330	727335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_009632	ACA	2	6	727368	727373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_009632	ATT	2	6	727374	727379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_009632	ATA	2	6	727380	727385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_009632	TAA	2	6	728283	728288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009632	TGA	2	6	730521	730526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009632	ATG	2	6	730544	730549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_009632	TTA	2	6	731015	731020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3119	NC_009632	TTCAC	2	10	732466	732475	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3120	NC_009632	TTAA	2	8	732477	732484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_009632	TTG	2	6	732486	732491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_009632	AAT	2	6	732522	732527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_009632	AT	3	6	732532	732537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_009632	GT	3	6	732541	732546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_009632	TTA	2	6	732634	732639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_009632	A	6	6	732641	732646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_009632	TTG	2	6	732722	732727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_009632	TATC	2	8	732755	732762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3130	NC_009632	TA	4	8	734536	734543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009632	TAA	2	6	734615	734620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_009632	ATA	2	6	734668	734673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_009632	TAA	2	6	734684	734689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_009632	A	7	7	734705	734711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_009632	ACAT	2	8	734742	734749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_009632	AT	3	6	734748	734753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_009632	TTC	2	6	734779	734784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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