MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009632	GATAA	2	10	419298	419307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009632	T	6	6	419321	419326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009632	TCC	2	6	420695	420700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_009632	A	6	6	420823	420828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009632	ATT	2	6	420861	420866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009632	T	6	6	420955	420960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_009632	AGG	2	6	420990	420995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009632	CCT	2	6	424646	424651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_009632	TAA	2	6	424707	424712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_009632	AGT	2	6	424713	424718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_009632	ATTAA	2	10	424720	424729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009632	TG	3	6	424732	424737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009632	CAA	2	6	424797	424802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009632	AAT	2	6	424828	424833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009632	CAA	2	6	424911	424916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_009632	TAATAT	2	12	424934	424945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009632	TTA	3	9	424947	424955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_009632	ATGA	2	8	424982	424989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009632	TGA	2	6	425569	425574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009632	TTTA	2	8	425596	425603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_009632	GTT	2	6	425621	425626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009632	TAT	2	6	425632	425637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009632	ATT	2	6	425664	425669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009632	GGA	2	6	425691	425696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009632	ATC	2	6	425706	425711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_009632	TAT	2	6	425727	425732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009632	ATA	2	6	425784	425789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009632	T	7	7	429607	429613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009632	TTG	2	6	429641	429646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_009632	TGGT	2	8	429666	429673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009632	TGC	2	6	429789	429794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_009632	CCA	2	6	430434	430439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_009632	ATG	2	6	430442	430447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_009632	ACG	2	6	430456	430461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_009632	GAC	2	6	430470	430475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_009632	CTCA	2	8	430772	430779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_009632	AGT	2	6	430782	430787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009632	AAT	2	6	430841	430846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009632	CAT	2	6	431301	431306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_009632	GTT	2	6	431383	431388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009632	CATA	2	8	431398	431405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_009632	T	7	7	431420	431426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009632	ATA	2	6	433941	433946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_009632	ATC	2	6	433976	433981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_009632	GAT	2	6	434014	434019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009632	TATCA	2	10	434040	434049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_009632	AGA	2	6	434059	434064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009632	TA	3	6	434111	434116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009632	ATTT	2	8	434137	434144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009632	TGA	2	6	434157	434162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009632	TAAT	2	8	435454	435461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009632	TATT	2	8	435475	435482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_009632	T	6	6	435481	435486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009632	ATC	2	6	435558	435563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_009632	TAA	2	6	435596	435601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009632	A	6	6	435600	435605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009632	TGA	2	6	435607	435612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009632	GATA	2	8	435652	435659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009632	GAT	2	6	435740	435745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009632	CAAA	2	8	435803	435810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_009632	CAT	2	6	435814	435819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009632	TAA	2	6	435929	435934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009632	TA	3	6	435940	435945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009632	ATTA	2	8	437174	437181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009632	TAT	2	6	438004	438009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_009632	TGC	2	6	438018	438023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_009632	CCT	2	6	444330	444335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_009632	A	6	6	444341	444346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_009632	GAAT	2	8	444372	444379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009632	ACC	2	6	444414	444419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_009632	AGTA	2	8	444508	444515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009632	ATT	2	6	444891	444896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009632	T	6	6	444895	444900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009632	AT	3	6	444948	444953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_009632	TGT	2	6	444959	444964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_009632	TA	3	6	445840	445845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_009632	AT	3	6	445868	445873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009632	GAT	2	6	445898	445903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009632	GAA	2	6	445921	445926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_009632	ACA	2	6	445928	445933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_009632	TAA	2	6	445938	445943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_009632	ATT	2	6	445945	445950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_009632	TA	3	6	445957	445962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_009632	TTAA	2	8	448220	448227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009632	TA	3	6	448232	448237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009632	AGA	2	6	448241	448246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009632	ACC	2	6	448488	448493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_009632	AGT	2	6	448592	448597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009632	ATT	3	9	448602	448610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009632	ATT	2	6	448659	448664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_009632	AGG	2	6	448708	448713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_009632	A	6	6	449570	449575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009632	AGG	2	6	449583	449588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009632	CA	3	6	449589	449594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_009632	AT	3	6	449847	449852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009632	T	7	7	449885	449891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009632	A	6	6	449926	449931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_009632	GAT	2	6	449933	449938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009632	ATA	2	6	449990	449995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009632	A	7	7	450011	450017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_009632	TAAA	2	8	450031	450038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_009632	CTT	2	6	450049	450054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_009632	TCA	2	6	451120	451125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_009632	TG	3	6	451152	451157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009632	T	6	6	451170	451175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009632	AT	3	6	451241	451246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009632	ATG	2	6	451251	451256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009632	CGT	2	6	451266	451271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_009632	TAA	2	6	451325	451330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009632	CCA	2	6	451360	451365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_009632	TAA	2	6	451394	451399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009632	CT	3	6	451581	451586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_009632	TCT	2	6	451735	451740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_009632	TTGC	2	8	451817	451824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_009632	TTA	2	6	451888	451893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_009632	TAT	2	6	451959	451964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_009632	AGG	2	6	451998	452003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009632	TA	3	6	452641	452646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009632	CTTT	2	8	452697	452704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_009632	CTT	2	6	452825	452830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_009632	ATA	2	6	452839	452844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_009632	CAT	2	6	452902	452907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_009632	GTT	2	6	452946	452951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_009632	ACGA	2	8	453401	453408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_009632	TAA	2	6	453443	453448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_009632	TA	3	6	453485	453490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_009632	AG	4	8	453527	453534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_009632	ATTA	2	8	454157	454164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_009632	AT	3	6	454215	454220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009632	CTT	2	6	454530	454535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_009632	TAA	2	6	454558	454563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_009632	AAT	2	6	454593	454598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_009632	A	6	6	454618	454623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_009632	AATGTA	2	12	454625	454636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_009632	TAC	2	6	454702	454707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_009632	TAC	2	6	454766	454771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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