MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009632	A	6	6	236459	236464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009632	GAG	2	6	236477	236482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009632	CA	3	6	236484	236489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_009632	ATT	2	6	237171	237176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009632	ATCA	2	8	237198	237205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_009632	CAT	2	6	237221	237226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_009632	TTC	2	6	237228	237233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009632	TAC	2	6	237249	237254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_009632	AT	3	6	237296	237301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009632	AT	3	6	237316	237321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009632	GGAT	2	8	237325	237332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009632	AGA	2	6	237922	237927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009632	A	6	6	237941	237946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009632	TG	3	6	237959	237964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009632	T	6	6	237990	237995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009632	GTT	2	6	238061	238066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009632	A	7	7	238093	238099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009632	ATT	2	6	238101	238106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009632	TAA	2	6	238201	238206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009632	AT	3	6	238214	238219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009632	AGG	2	6	242854	242859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009632	CAT	2	6	243945	243950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_009632	AGG	2	6	243957	243962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009632	ATT	2	6	245012	245017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009632	AT	3	6	245018	245023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009632	AAG	2	6	245046	245051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009632	TGG	2	6	246074	246079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009632	TGAA	2	8	246086	246093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009632	TTGT	2	8	246145	246152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009632	AAG	2	6	246154	246159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009632	TA	3	6	246168	246173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009632	TA	3	6	246230	246235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009632	ATA	2	6	246260	246265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009632	A	7	7	246265	246271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009632	TGT	2	6	246275	246280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009632	AATAT	2	10	246320	246329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009632	TGA	2	6	246372	246377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009632	TCC	2	6	246892	246897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_009632	ACA	2	6	246931	246936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009632	TATT	2	8	246977	246984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009632	TAA	2	6	247044	247049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009632	AT	3	6	247082	247087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009632	AT	3	6	248606	248611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009632	CT	3	6	248757	248762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_009632	GAAA	2	8	248775	248782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009632	AAT	2	6	252164	252169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009632	TGT	2	6	252245	252250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009632	TTTG	2	8	252265	252272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009632	TATTT	2	10	252311	252320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009632	TA	3	6	252329	252334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009632	AT	3	6	252407	252412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009632	CAA	2	6	252450	252455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009632	T	6	6	252459	252464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009632	AT	3	6	252473	252478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009632	TGT	2	6	252526	252531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009632	ACAT	2	8	252591	252598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_009632	TGA	2	6	252600	252605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009632	A	7	7	252627	252633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009632	CAA	2	6	252637	252642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009632	AAAG	2	8	255762	255769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009632	CTT	2	6	255802	255807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009632	GTA	2	6	255838	255843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009632	ATC	2	6	255943	255948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009632	TTA	2	6	255956	255961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009632	ATATGA	2	12	255974	255985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009632	GAT	2	6	257859	257864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009632	A	7	7	258369	258375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009632	AT	3	6	258450	258455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009632	GGA	2	6	258511	258516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009632	A	6	6	258520	258525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009632	ACA	2	6	260558	260563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009632	ATG	2	6	260579	260584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009632	ATT	2	6	260631	260636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009632	AACAT	2	10	260654	260663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1075	NC_009632	AT	3	6	260670	260675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009632	AAT	3	9	260731	260739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009632	AC	4	8	260786	260793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_009632	ATT	2	6	260858	260863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009632	ACC	2	6	260945	260950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_009632	T	6	6	260966	260971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009632	CA	3	6	260989	260994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_009632	TAA	2	6	261002	261007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009632	TTCA	2	8	261045	261052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_009632	ATC	2	6	262280	262285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_009632	CT	3	6	262286	262291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_009632	TCC	2	6	264573	264578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_009632	GATAA	2	10	264591	264600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_009632	ATTA	2	8	264639	264646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009632	T	6	6	264710	264715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009632	ATT	2	6	264740	264745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009632	TCC	2	6	265970	265975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_009632	ATA	2	6	265981	265986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009632	ACA	2	6	266020	266025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009632	ATAAC	2	10	269238	269247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_009632	ATA	2	6	269285	269290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009632	TGAAT	2	10	269349	269358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009632	TA	3	6	269373	269378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009632	ATTAA	2	10	269490	269499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009632	TAT	2	6	269508	269513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009632	GGAATA	2	12	270835	270846	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009632	A	6	6	270859	270864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009632	TA	3	6	270900	270905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009632	TAA	2	6	270933	270938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009632	TCA	2	6	270954	270959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_009632	CTG	2	6	272519	272524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_009632	TTCAT	2	10	272551	272560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_009632	CT	3	6	272566	272571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_009632	CAA	2	6	272593	272598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009632	TGT	2	6	272634	272639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009632	ATT	2	6	272652	272657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009632	AATT	2	8	272665	272672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009632	GTA	2	6	272673	272678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009632	AAAT	2	8	272693	272700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009632	AT	3	6	272745	272750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009632	TGT	2	6	273157	273162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009632	GAC	2	6	273168	273173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_009632	AAAT	2	8	273175	273182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009632	ATC	2	6	273194	273199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009632	A	6	6	273218	273223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009632	AAAGT	2	10	273234	273243	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009632	CTC	2	6	274615	274620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_009632	ATT	2	6	274640	274645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009632	CTA	2	6	274646	274651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009632	AATT	2	8	274667	274674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009632	ATAA	2	8	274688	274695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009632	T	6	6	274730	274735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009632	CGA	2	6	274781	274786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009632	GC	3	6	274789	274794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_009632	ATTT	2	8	274795	274802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009632	A	6	6	274812	274817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009632	TTG	2	6	274820	274825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009632	A	6	6	274835	274840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009632	ATA	2	6	274850	274855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009632	AAT	2	6	274872	274877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009632	TAAAA	2	10	274947	274956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009632	AAAT	2	8	274961	274968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_009632	AAAT	2	8	275019	275026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_009632	AGC	2	6	275114	275119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_009632	A	6	6	276183	276188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_009632	A	6	6	279412	279417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_009632	AT	3	6	279432	279437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_009632	A	6	6	279479	279484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_009632	TAA	2	6	319475	319480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_009632	ATTTA	2	10	320592	320601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_009632	AT	3	6	320649	320654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_009632	A	7	7	320678	320684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_009632	A	6	6	320698	320703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_009632	TA	3	6	320705	320710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_009632	TAC	2	6	365222	365227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_009632	ACA	2	6	365276	365281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_009632	GAT	2	6	365324	365329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_009632	TA	3	6	365386	365391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_009632	AGG	2	6	366368	366373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_009632	GAAAG	2	10	366614	366623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_009632	CAA	2	6	367085	367090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_009632	TTC	2	6	382742	382747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_009632	AGT	2	6	382778	382783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_009632	GGT	2	6	385615	385620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_009632	GTAAAT	2	12	398040	398051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_009632	TTGA	2	8	398091	398098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_009632	T	6	6	401599	401604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_009632	AT	3	6	419284	419289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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