MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 12334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009632	GAA	2	6	1075978	1075983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_009632	T	6	6	1076039	1076044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_009632	TA	3	6	1076055	1076060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_009632	A	6	6	1076155	1076160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_009632	CCT	2	6	1077398	1077403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_009632	ACGT	2	8	1077410	1077417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_009632	A	6	6	1077431	1077436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009632	TAA	2	6	1077437	1077442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_009632	TAA	2	6	1077490	1077495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_009632	TAG	2	6	1078283	1078288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_009632	T	6	6	1078292	1078297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_009632	AT	3	6	1078354	1078359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_009632	GTA	2	6	1078371	1078376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_009632	TAA	2	6	1078379	1078384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009632	T	6	6	1078410	1078415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009632	TTTATA	2	12	1078435	1078446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_009632	TTA	2	6	1078466	1078471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_009632	AATT	2	8	1078482	1078489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_009632	TAT	2	6	1079924	1079929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_009632	A	6	6	1079963	1079968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_009632	CAT	2	6	1079999	1080004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_009632	TTAC	2	8	1080012	1080019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_009632	GGT	2	6	1080031	1080036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_009632	AGG	2	6	1081086	1081091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_009632	AAC	2	6	1081092	1081097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_009632	AAC	2	6	1081466	1081471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_009632	CCT	2	6	1082085	1082090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_009632	AAC	2	6	1082100	1082105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_009632	TTG	2	6	1082822	1082827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_009632	TA	3	6	1082869	1082874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_009632	TTA	2	6	1082880	1082885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_009632	TA	3	6	1084768	1084773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_009632	AGG	2	6	1090593	1090598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009632	TAT	2	6	1091352	1091357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009632	AATT	2	8	1091366	1091373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_009632	AAG	2	6	1091646	1091651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_009632	T	6	6	1091658	1091663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_009632	AAG	2	6	1091724	1091729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_009632	ATTAA	2	10	1091871	1091880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_009632	TGTT	2	8	1094528	1094535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_009632	AGT	2	6	1094572	1094577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_009632	GTA	2	6	1096816	1096821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_009632	GT	3	6	1096899	1096904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_009632	A	7	7	1097253	1097259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009632	TAAA	2	8	1097265	1097272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_009632	C	6	6	1097281	1097286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4547	NC_009632	T	6	6	1097306	1097311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_009632	TGA	2	6	1102602	1102607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_009632	AGG	2	6	1104045	1104050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_009632	CAG	2	6	1104749	1104754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_009632	AAAT	2	8	1104769	1104776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_009632	AAT	2	6	1104785	1104790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009632	T	6	6	1105276	1105281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_009632	AGG	2	6	1105859	1105864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_009632	AAGG	2	8	1114778	1114785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_009632	GTGG	2	8	1118748	1118755	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_009632	AGG	2	6	1119060	1119065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_009632	GTAAGT	2	12	1119123	1119134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_009632	TAT	2	6	1121134	1121139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_009632	T	7	7	1121213	1121219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_009632	ACC	2	6	1121342	1121347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_009632	GTT	2	6	1121366	1121371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_009632	T	6	6	1121370	1121375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_009632	TTATA	2	10	1121379	1121388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_009632	GTT	2	6	1121427	1121432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_009632	T	8	8	1121437	1121444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_009632	A	7	7	1121450	1121456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009632	ATT	2	6	1121463	1121468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_009632	TAAAGT	2	12	1121500	1121511	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_009632	AAC	2	6	1123953	1123958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_009632	T	6	6	1125372	1125377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_009632	TAA	2	6	1126979	1126984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_009632	ATTA	2	8	1126985	1126992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_009632	CAA	2	6	1126999	1127004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_009632	AGA	2	6	1127024	1127029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_009632	TCAT	2	8	1127086	1127093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_009632	TA	4	8	1127094	1127101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_009632	A	6	6	1127109	1127114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_009632	TA	3	6	1127125	1127130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_009632	AACGGA	2	12	1127145	1127156	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4581	NC_009632	CGC	2	6	1127173	1127178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_009632	ATT	2	6	1127347	1127352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_009632	A	7	7	1127388	1127394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_009632	TTA	2	6	1128039	1128044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_009632	TAA	2	6	1128096	1128101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_009632	TTA	2	6	1128119	1128124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_009632	AAT	2	6	1128142	1128147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009632	TTA	2	6	1128201	1128206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009632	AAAG	2	8	1128213	1128220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009632	TC	3	6	1129524	1129529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_009632	TA	4	8	1129539	1129546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_009632	TTAT	2	8	1129555	1129562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_009632	TA	3	6	1129589	1129594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009632	TAT	2	6	1129634	1129639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_009632	AGG	2	6	1129704	1129709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_009632	TAT	2	6	1130590	1130595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_009632	TTA	2	6	1130623	1130628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_009632	TTA	2	6	1130653	1130658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_009632	TGG	2	6	1130709	1130714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009632	G	6	6	1130728	1130733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_009632	CAT	2	6	1130889	1130894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_009632	ATG	2	6	1130914	1130919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_009632	GTC	2	6	1130985	1130990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_009632	TTTA	2	8	1131018	1131025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_009632	TTA	2	6	1131037	1131042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_009632	GTA	2	6	1131146	1131151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_009632	AT	3	6	1131193	1131198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_009632	A	6	6	1131248	1131253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_009632	CAT	2	6	1131258	1131263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_009632	ATG	2	6	1131283	1131288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_009632	GTC	2	6	1131354	1131359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_009632	AAT	2	6	1131384	1131389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_009632	AAAT	2	8	1131440	1131447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_009632	TAT	2	6	1131458	1131463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_009632	AGA	2	6	1131526	1131531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_009632	TATAT	2	10	1131548	1131557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_009632	CAG	2	6	1131583	1131588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_009632	AGG	2	6	1131614	1131619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_009632	AGTA	2	8	1131642	1131649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_009632	TTA	3	9	1131659	1131667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_009632	AAAAGC	2	12	1131743	1131754	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4622	NC_009632	CTA	2	6	1131760	1131765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_009632	TAT	2	6	1131792	1131797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_009632	TTA	2	6	1131803	1131808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_009632	A	6	6	1131815	1131820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_009632	AAC	2	6	1131833	1131838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_009632	CAAT	2	8	1134803	1134810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_009632	CAT	2	6	1135169	1135174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_009632	AAATT	2	10	1135181	1135190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_009632	AGA	2	6	1135198	1135203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_009632	AAATT	2	10	1135209	1135218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_009632	TAA	2	6	1135254	1135259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_009632	ATA	2	6	1135283	1135288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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