MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED03

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009622	CT	3	6	10506	10511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009622	AT	3	6	12940	12945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009622	CG	3	6	13855	13860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009622	GC	3	6	14025	14030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009622	CT	3	6	14834	14839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009622	CG	3	6	15328	15333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009622	CT	3	6	16253	16258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009622	GC	3	6	16500	16505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009622	TC	3	6	17253	17258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009622	AT	3	6	26376	26381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009622	CG	3	6	26408	26413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009622	AG	3	6	27359	27364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009622	GC	3	6	27619	27624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009622	CA	3	6	30172	30177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009622	TG	3	6	31957	31962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009622	GC	3	6	36001	36006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009622	TC	3	6	36276	36281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009622	CT	4	8	36405	36412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009622	AT	3	6	36428	36433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009622	GT	3	6	37057	37062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009622	AG	3	6	37257	37262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009622	AG	3	6	37600	37605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009622	AG	3	6	38247	38252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009622	CG	3	6	39451	39456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009622	GC	4	8	39814	39821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009622	TC	3	6	40544	40549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009622	GC	3	6	40595	40600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009622	CG	3	6	40663	40668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009622	GC	3	6	40908	40913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009622	GC	3	6	41640	41645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009622	GA	3	6	48588	48593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009622	CG	3	6	50917	50922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009622	GC	3	6	51109	51114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009622	CG	3	6	55864	55869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009622	GC	3	6	55937	55942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009622	GC	3	6	56041	56046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009622	CG	3	6	56140	56145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009622	CG	3	6	56484	56489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009622	TC	3	6	68670	68675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009622	GC	3	6	69657	69662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009622	AG	3	6	73605	73610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009622	GA	3	6	73729	73734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009622	CT	4	8	73743	73750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009622	TC	4	8	73818	73825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009622	TG	3	6	77482	77487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009622	GA	3	6	82259	82264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009622	GC	3	6	82989	82994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009622	GC	3	6	84045	84050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009622	TG	3	6	89442	89447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009622	CG	3	6	91062	91067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009622	CT	3	6	91270	91275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009622	GC	3	6	94844	94849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009622	CG	3	6	95233	95238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009622	CG	3	6	95508	95513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009622	TC	3	6	96691	96696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009622	GC	3	6	101274	101279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009622	CG	3	6	102746	102751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009622	CT	3	6	103793	103798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009622	CT	3	6	104958	104963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009622	GC	3	6	109540	109545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009622	GC	3	6	111803	111808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009622	TC	3	6	112794	112799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009622	TG	4	8	173495	173502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009622	CG	3	6	173551	173556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009622	CT	3	6	173995	174000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009622	GC	3	6	180537	180542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009622	CG	3	6	186750	186755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009622	CT	3	6	186770	186775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009622	GC	3	6	188491	188496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009622	GC	3	6	188717	188722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009622	GC	3	6	188735	188740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009622	GC	3	6	188899	188904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009622	GC	3	6	190236	190241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009622	GA	3	6	190377	190382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009622	AC	3	6	190838	190843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009622	GC	3	6	190899	190904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009622	GC	4	8	198110	198117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009622	CG	3	6	203793	203798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009622	GC	3	6	207503	207508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009622	CT	3	6	215366	215371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009622	TG	3	6	217571	217576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009622	GC	3	6	217713	217718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009622	AG	3	6	217807	217812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009622	CA	3	6	219198	219203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009622	GT	3	6	219242	219247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.