MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED03

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009622	GGCG	2	8	1312	1319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009622	CAGG	2	8	5604	5611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009622	TGAG	2	8	6124	6131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009622	TCGG	2	8	13806	13813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009622	ATGA	2	8	13831	13838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009622	CTTC	2	8	14994	15001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009622	AGTG	2	8	15318	15325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009622	CGGG	2	8	15341	15348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009622	GTCC	2	8	16178	16185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009622	GGCC	2	8	25425	25432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009622	GGCG	2	8	25685	25692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009622	GTCG	2	8	26018	26025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009622	GCCG	2	8	26156	26163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009622	GCCG	2	8	26258	26265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009622	GTCT	2	8	26819	26826	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009622	GCAA	2	8	30189	30196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009622	TCGC	2	8	31511	31518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009622	CCCG	2	8	32136	32143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009622	AGTA	2	8	32186	32193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009622	GCTT	2	8	33823	33830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009622	GCAC	2	8	36386	36393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009622	GGAA	2	8	37015	37022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009622	GTCT	2	8	37095	37102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009622	GTCG	2	8	37391	37398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009622	CGAC	2	8	38123	38130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009622	TCAA	2	8	38202	38209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009622	CCCT	2	8	38575	38582	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009622	GCAA	2	8	38704	38711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009622	AAAG	2	8	40895	40902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009622	TGCA	2	8	41928	41935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009622	TTCA	2	8	42058	42065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009622	TCAA	2	8	43474	43481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009622	TTTG	2	8	50266	50273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009622	CCAG	2	8	50659	50666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009622	CGGC	2	8	50737	50744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009622	GAGC	2	8	50756	50763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009622	CCAC	2	8	51009	51016	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009622	CCAG	2	8	51147	51154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009622	CGAT	2	8	52423	52430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009622	CCGA	2	8	55817	55824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009622	GCTG	2	8	56192	56199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009622	TGAA	2	8	56574	56581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009622	AGGG	2	8	73555	73562	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009622	CACC	2	8	73639	73646	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_009622	TCAA	2	8	76897	76904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009622	ACCA	2	8	78713	78720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009622	GCAG	2	8	78877	78884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009622	TTTG	2	8	81341	81348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009622	GACA	2	8	81458	81465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009622	AGCG	2	8	81993	82000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009622	GGCT	2	8	82133	82140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009622	ATCG	2	8	82226	82233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009622	GCGG	2	8	82318	82325	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009622	AAGG	2	8	82735	82742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009622	CCCA	2	8	88312	88319	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_009622	CTAT	2	8	88558	88565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009622	GGTC	2	8	88568	88575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009622	TCTG	2	8	88647	88654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009622	AGCG	2	8	88728	88735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009622	CTGA	2	8	88924	88931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009622	GGTC	2	8	89122	89129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009622	TTGT	2	8	90471	90478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009622	GGCC	2	8	90900	90907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009622	GACG	2	8	91025	91032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009622	CCCG	2	8	95377	95384	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_009622	GGCT	2	8	96658	96665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009622	GCGA	2	8	96720	96727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009622	CGAG	2	8	96854	96861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009622	CTTC	2	8	98370	98377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009622	CGAC	2	8	99144	99151	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009622	CCCG	2	8	102736	102743	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009622	GGAT	2	8	102936	102943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009622	CCAG	2	8	102949	102956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009622	TTCT	2	8	102972	102979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009622	CGTC	2	8	103160	103167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009622	AGCG	2	8	103274	103281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009622	GCTG	2	8	103705	103712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009622	TTCC	2	8	103742	103749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009622	CTTT	2	8	104980	104987	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009622	TGCG	2	8	106000	106007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009622	CCGA	2	8	106012	106019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009622	CGCC	2	8	109313	109320	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_009622	GCAC	2	8	109911	109918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009622	GCGT	2	8	110007	110014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009622	TTCA	2	8	110504	110511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009622	GGAT	2	8	111369	111376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009622	TCGC	2	8	111679	111686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009622	GCCG	2	8	112380	112387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009622	TTCC	2	8	112813	112820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009622	GAAG	2	8	112831	112838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009622	TGGA	2	8	115069	115076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009622	CCAG	2	8	115083	115090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009622	CTTC	2	8	116247	116254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009622	CCAT	2	8	116398	116405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009622	TCGG	2	8	116506	116513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009622	CTTC	2	8	116661	116668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009622	ACGA	2	8	176249	176256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009622	CGGG	2	8	176355	176362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009622	ATCA	2	8	181926	181933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009622	AAAG	2	8	184499	184506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009622	GATC	2	8	187230	187237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009622	GGCC	2	8	188228	188235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009622	GTCG	2	8	188288	188295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009622	CAGC	2	8	188351	188358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009622	GTTC	2	8	188402	188409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009622	CAGG	2	8	188451	188458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009622	GCCG	2	8	188552	188559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009622	CGCA	2	8	188847	188854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009622	CCTG	2	8	189650	189657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009622	CGGC	2	8	189725	189732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009622	GGCC	2	8	189754	189761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009622	CGGC	2	8	190779	190786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009622	CGGC	2	8	190962	190969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009622	GCTG	2	8	190971	190978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009622	CGGC	2	8	191257	191264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009622	CTAC	2	8	192804	192811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009622	CGTC	2	8	197986	197993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009622	TGAG	2	8	202766	202773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009622	AACC	2	8	206865	206872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009622	CAAT	2	8	206910	206917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009622	CTAA	2	8	207250	207257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009622	CCCT	2	8	207478	207485	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_009622	AGGG	2	8	216428	216435	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.