MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009621	GTT	2	6	233015	233020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009621	GTT	2	6	233056	233061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009621	GAT	2	6	234931	234936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009621	GGA	2	6	234948	234953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009621	TCC	2	6	236362	236367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_009621	GCG	2	6	236382	236387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009621	CCG	2	6	236388	236393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_009621	GGGGC	2	10	238236	238245	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
509	NC_009621	GCT	2	6	238258	238263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009621	GTG	2	6	238302	238307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009621	CGC	2	6	238317	238322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_009621	CAGG	2	8	238415	238422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_009621	ACGCG	2	10	238426	238435	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
514	NC_009621	AG	3	6	238494	238499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009621	CGCAG	2	10	241886	241895	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
516	NC_009621	ACA	2	6	242478	242483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009621	CCT	3	9	242944	242952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_009621	GTC	2	6	242959	242964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009621	CGG	2	6	242990	242995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009621	CGC	2	6	243904	243909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_009621	CGC	2	6	244887	244892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_009621	TTC	2	6	244949	244954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009621	GC	4	8	244977	244984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_009621	GGA	2	6	245002	245007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009621	GT	3	6	245938	245943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009621	TCC	2	6	247188	247193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_009621	TATT	2	8	247302	247309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009621	AGC	2	6	247376	247381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009621	GCC	2	6	247389	247394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_009621	GTG	2	6	247405	247410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009621	GCT	2	6	247421	247426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_009621	GAT	2	6	248929	248934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009621	GCG	2	6	249059	249064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009621	GT	3	6	249069	249074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009621	TTG	2	6	251315	251320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009621	GCG	2	6	251340	251345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_009621	CTG	2	6	251445	251450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009621	TC	3	6	251456	251461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_009621	TCG	2	6	251512	251517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009621	GAA	2	6	251542	251547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009621	CGTC	2	8	251572	251579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_009621	TGA	2	6	251606	251611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009621	GT	3	6	251663	251668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009621	AGC	2	6	251769	251774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009621	GAT	2	6	251900	251905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009621	GC	3	6	251910	251915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_009621	CTT	2	6	253874	253879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009621	GGTC	2	8	253952	253959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_009621	CCT	2	6	253965	253970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009621	AGC	2	6	253987	253992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009621	CGA	2	6	254012	254017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009621	CCA	2	6	254059	254064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_009621	GCG	2	6	254065	254070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009621	GAT	2	6	254079	254084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009621	GAC	2	6	254175	254180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009621	CCG	2	6	254191	254196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_009621	GAC	2	6	254208	254213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_009621	ATG	2	6	254278	254283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009621	GCA	2	6	254297	254302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_009621	CGC	2	6	254357	254362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_009621	CGC	2	6	254364	254369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_009621	GC	3	6	254378	254383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_009621	CGC	2	6	254394	254399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_009621	AGA	2	6	254459	254464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009621	GACG	2	8	254537	254544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_009621	GAG	2	6	254610	254615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009621	CAG	2	6	254661	254666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009621	GCG	2	6	254671	254676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009621	CAGGG	2	10	254767	254776	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
570	NC_009621	CAA	3	9	254781	254789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_009621	GGT	2	6	254833	254838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009621	CGC	2	6	254872	254877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_009621	GAA	2	6	254880	254885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009621	GGC	2	6	254896	254901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009621	GCC	2	6	254927	254932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_009621	ACG	2	6	254988	254993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_009621	CAC	2	6	255085	255090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_009621	CCCG	2	8	255115	255122	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
579	NC_009621	TTG	2	6	255794	255799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009621	CAA	2	6	255817	255822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009621	GCC	2	6	255827	255832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_009621	TCT	2	6	255852	255857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009621	A	6	6	255901	255906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009621	TTG	2	6	256902	256907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009621	TCG	2	6	256971	256976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009621	CGC	2	6	257002	257007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_009621	GC	3	6	257056	257061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_009621	ACC	2	6	257105	257110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_009621	GCC	2	6	257302	257307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_009621	ATG	2	6	257310	257315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009621	CG	3	6	258997	259002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_009621	CGT	2	6	259044	259049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009621	CCG	2	6	259113	259118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_009621	CTC	2	6	259149	259154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_009621	AGG	2	6	259161	259166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009621	TC	3	6	260145	260150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_009621	CGGCC	2	10	260206	260215	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
598	NC_009621	TTG	2	6	260216	260221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009621	ATG	2	6	260228	260233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009621	TGG	2	6	260275	260280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009621	GGC	2	6	260420	260425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_009621	TCG	2	6	260434	260439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009621	ACG	2	6	260462	260467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_009621	CG	3	6	260466	260471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_009621	AACA	2	8	260477	260484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_009621	TCCAC	2	10	260486	260495	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
607	NC_009621	A	7	7	261486	261492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009621	TTC	2	6	261544	261549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009621	GAC	2	6	261569	261574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009621	AATA	2	8	261586	261593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009621	A	6	6	261651	261656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009621	CCG	2	6	261679	261684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_009621	ATC	2	6	261719	261724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_009621	TACATT	2	12	261756	261767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_009621	CGGA	2	8	262423	262430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_009621	GGC	2	6	262540	262545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_009621	CG	3	6	262611	262616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_009621	A	6	6	262661	262666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009621	ACG	2	6	262973	262978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009621	CGG	2	6	263750	263755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009621	GGT	2	6	263821	263826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009621	GCA	2	6	263866	263871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009621	AAGGA	2	10	263912	263921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009621	CCAA	2	8	264287	264294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_009621	CAAA	2	8	265690	265697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_009621	ACCC	2	8	265740	265747	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
627	NC_009621	GCC	2	6	267841	267846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_009621	CCG	2	6	267879	267884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_009621	GCGG	2	8	267905	267912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
630	NC_009621	TCC	2	6	267924	267929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_009621	AC	3	6	267933	267938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_009621	CAC	2	6	268271	268276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_009621	GTCGA	2	10	268285	268294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
634	NC_009621	GCA	2	6	268313	268318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_009621	GCC	2	6	268328	268333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_009621	A	6	6	268334	268339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009621	CGT	2	6	268364	268369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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769	NC_009621	TCC	2	6	312412	312417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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771	NC_009621	TTTC	2	8	312447	312454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
772	NC_009621	AAG	2	6	312475	312480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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