MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009620	CGGG	2	8	4983	4990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009620	CCGC	2	8	19202	19209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009620	GGCC	2	8	24190	24197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009620	TCAT	2	8	27095	27102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009620	CAGT	2	8	27164	27171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009620	CCAG	2	8	30784	30791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009620	GGCT	2	8	30804	30811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009620	GCTG	2	8	42784	42791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009620	CTGC	2	8	42880	42887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009620	CAGC	2	8	46587	46594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009620	GGCC	2	8	46948	46955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009620	TTCG	2	8	48069	48076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009620	TCGC	2	8	48298	48305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009620	CTGC	2	8	58019	58026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009620	AAGA	2	8	65970	65977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009620	TTCG	2	8	66331	66338	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009620	CGGC	2	8	66551	66558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009620	TAAG	2	8	66724	66731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009620	CGTC	2	8	66738	66745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009620	GGCA	2	8	66985	66992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009620	TCCG	2	8	67057	67064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009620	GCCC	2	8	69311	69318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009620	GGCC	2	8	73727	73734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009620	CCCG	2	8	73789	73796	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009620	CTAT	2	8	85832	85839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009620	AGGA	2	8	85945	85952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009620	AGGC	2	8	86528	86535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009620	ACGA	2	8	91518	91525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009620	CATC	2	8	100175	100182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009620	TAAT	2	8	104226	104233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009620	AATT	2	8	104243	104250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009620	CCGG	2	8	107423	107430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009620	ATTC	2	8	113454	113461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009620	GGGT	2	8	113566	113573	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009620	GATC	2	8	116460	116467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009620	GCTT	2	8	122169	122176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009620	TTTG	2	8	123923	123930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009620	GCGA	2	8	130323	130330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009620	GCGG	2	8	132192	132199	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009620	GCCG	2	8	140724	140731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009620	CGTT	2	8	141579	141586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009620	TGCT	2	8	148560	148567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009620	AGCG	2	8	152933	152940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009620	GCGG	2	8	155026	155033	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009620	CAGC	2	8	162701	162708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009620	CTGG	2	8	163002	163009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009620	GCGG	2	8	164024	164031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009620	CCGC	2	8	164082	164089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_009620	ACGC	2	8	165083	165090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009620	ACTC	2	8	171171	171178	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009620	TGCT	2	8	171304	171311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009620	AGCG	2	8	171337	171344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009620	ACAT	2	8	173785	173792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009620	GATC	2	8	185881	185888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009620	AAGA	2	8	187942	187949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009620	GGGA	2	8	187952	187959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009620	GACC	2	8	193221	193228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009620	ACGG	2	8	193245	193252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009620	CATT	2	8	194282	194289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009620	CCTA	2	8	201165	201172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009620	AAAC	2	8	201254	201261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009620	GCAA	2	8	211501	211508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009620	GCGG	2	8	215915	215922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009620	AGCC	2	8	216942	216949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009620	AGAA	2	8	218623	218630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009620	GTCG	2	8	227379	227386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009620	CCCG	2	8	227529	227536	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_009620	TGTT	2	8	228791	228798	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009620	TAGT	2	8	230097	230104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009620	CGCC	2	8	233075	233082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_009620	ACGC	2	8	233107	233114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009620	GACA	2	8	247511	247518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009620	GGCT	2	8	255088	255095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009620	ATCG	2	8	256088	256095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009620	GCCG	2	8	256516	256523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009620	CGGC	2	8	256595	256602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009620	GACG	2	8	256804	256811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009620	TTGA	2	8	258873	258880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009620	CGGA	2	8	259102	259109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009620	CATG	2	8	261929	261936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009620	AAGG	2	8	266589	266596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009620	CGCT	2	8	268461	268468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009620	AACC	2	8	270426	270433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009620	GCCA	2	8	277915	277922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009620	CCCG	2	8	287594	287601	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_009620	TGGC	2	8	291489	291496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009620	CGAG	2	8	295290	295297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009620	ATCA	2	8	299037	299044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009620	CGGC	2	8	305931	305938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009620	AGCG	2	8	318652	318659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009620	TCGG	2	8	327399	327406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009620	TATG	2	8	327515	327522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009620	TCCT	2	8	328628	328635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009620	GAGG	2	8	328664	328671	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009620	ATCT	2	8	328692	328699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009620	GCCC	2	8	334761	334768	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_009620	GCCC	2	8	344346	344353	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009620	GATG	2	8	353410	353417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009620	CGGA	2	8	353973	353980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009620	GGCG	2	8	354807	354814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009620	GCTC	2	8	358506	358513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009620	ACGG	2	8	358538	358545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009620	GCTC	2	8	370245	370252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009620	GGGC	2	8	370281	370288	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009620	TAAA	2	8	371538	371545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009620	TTCG	2	8	380846	380853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009620	CTGG	2	8	381041	381048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009620	GCGG	2	8	382066	382073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009620	CCGC	2	8	382124	382131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009620	GACA	2	8	382204	382211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009620	CCCG	2	8	382303	382310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_009620	CGGG	2	8	382338	382345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009620	GAGG	2	8	382350	382357	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009620	GCGG	2	8	387029	387036	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009620	GACC	2	8	389822	389829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009620	CGGA	2	8	399779	399786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009620	TCCC	2	8	405698	405705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_009620	TCCC	2	8	409002	409009	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_009620	CCGG	2	8	409067	409074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009620	GCCG	2	8	413386	413393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009620	CGGA	2	8	414704	414711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009620	GAGG	2	8	430432	430439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009620	CCTC	2	8	430446	430453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_009620	GGAA	2	8	436232	436239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009620	CGAA	2	8	437932	437939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009620	CGCA	2	8	447767	447774	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009620	GCCT	2	8	450021	450028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009620	TATT	2	8	450207	450214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009620	CTCC	2	8	452472	452479	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_009620	GCCG	2	8	454584	454591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009620	TGGC	2	8	456133	456140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009620	TGTC	2	8	462060	462067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009620	GCCG	2	8	462110	462117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009620	TCCA	2	8	462189	462196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009620	TCGA	2	8	464658	464665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009620	CCAT	2	8	468319	468326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009620	ACGG	2	8	468370	468377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009620	CCCG	2	8	476250	476257	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_009620	GATC	2	8	477608	477615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009620	CCGC	2	8	483557	483564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_009620	TTAG	2	8	489623	489630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009620	TCCT	2	8	491411	491418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009620	AACG	2	8	492236	492243	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009620	CCGG	2	8	492291	492298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009620	CAGT	2	8	495366	495373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009620	GCTC	2	8	497448	497455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009620	AGGC	2	8	498696	498703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009620	AAAC	2	8	503429	503436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009620	CTTT	2	8	509418	509425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009620	GAAT	2	8	509711	509718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009620	CAAG	2	8	510095	510102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_009620	CGAG	2	8	1357546	1357553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_009620	CTAT	2	8	1357578	1357585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_009620	AAAT	2	8	1382857	1382864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_009620	CAGG	2	8	1382901	1382908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_009620	CGGA	2	8	1388855	1388862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_009620	GGAA	2	8	1391061	1391068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_009620	TGGT	2	8	1396212	1396219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_009620	AACG	2	8	1418870	1418877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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