MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 3621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009620	TCGG	2	8	533858	533865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_009620	TCGA	2	8	533946	533953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_009620	CCCTG	2	10	535207	535216	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1004	NC_009620	TCC	2	6	535660	535665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_009620	CGG	2	6	535706	535711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009620	AG	3	6	535762	535767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009620	ATC	2	6	535818	535823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009620	TCC	2	6	535835	535840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_009620	ATC	2	6	535853	535858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009620	TGT	2	6	535865	535870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009620	GCG	2	6	535913	535918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009620	CGG	2	6	535939	535944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009620	GGCT	2	8	535955	535962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_009620	TTCA	2	8	535989	535996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_009620	CGC	2	6	536005	536010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_009620	GTTGCC	2	12	536809	536820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009620	AGGC	2	8	536858	536865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_009620	GTT	2	6	537878	537883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009620	TAA	3	9	537933	537941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009620	T	6	6	537958	537963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009620	GCG	2	6	538922	538927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_009620	CGC	2	6	542722	542727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_009620	CGG	2	6	542767	542772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_009620	GGT	2	6	542832	542837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009620	CCCG	2	8	542865	542872	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1026	NC_009620	CG	3	6	542939	542944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_009620	CAC	2	6	542968	542973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_009620	ACG	2	6	542982	542987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009620	GTC	2	6	543034	543039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009620	GCC	2	6	543114	543119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_009620	AGG	2	6	543125	543130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009620	GGC	3	9	543250	543258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_009620	TCGG	2	8	543271	543278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_009620	GC	3	6	543281	543286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_009620	AGGC	2	8	543293	543300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_009620	CCG	2	6	543330	543335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_009620	CGA	2	6	543357	543362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009620	GAG	2	6	543408	543413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009620	ATCC	2	8	543894	543901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_009620	CGGC	2	8	543997	544004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_009620	CGG	2	6	544033	544038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009620	GGA	2	6	544044	544049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009620	CCT	2	6	544226	544231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_009620	GAG	2	6	544246	544251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009620	GC	3	6	545492	545497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_009620	ACCA	2	8	545526	545533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_009620	GAA	2	6	545545	545550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_009620	TCT	2	6	545628	545633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009620	TGGC	2	8	545638	545645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_009620	GCG	2	6	546427	546432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009620	GCC	3	9	546435	546443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_009620	GCCG	2	8	546459	546466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_009620	ACC	2	6	546501	546506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_009620	GCG	2	6	546507	546512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009620	GC	3	6	546922	546927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_009620	GC	3	6	546940	546945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_009620	TCC	2	6	548919	548924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_009620	CG	3	6	548963	548968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_009620	AGC	2	6	549590	549595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009620	CGG	2	6	549639	549644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009620	TGA	2	6	549691	549696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009620	TTC	2	6	549723	549728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009620	TGG	2	6	549752	549757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009620	CTCG	2	8	549762	549769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_009620	TCT	2	6	549879	549884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_009620	TCA	2	6	549886	549891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_009620	CTA	2	6	550153	550158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_009620	CGTCTC	2	12	550192	550203	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_009620	GAG	2	6	550241	550246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009620	GAAA	2	8	550249	550256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009620	GGC	2	6	550272	550277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_009620	TC	3	6	552640	552645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1077	NC_009620	GC	3	6	554069	554074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1080	NC_009620	GATT	2	8	554183	554190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009620	CT	3	6	554212	554217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_009620	CG	4	8	554239	554246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_009620	A	6	6	554305	554310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009620	GGC	2	6	554311	554316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_009620	GAC	2	6	554363	554368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_009620	CG	3	6	554436	554441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_009620	CAG	2	6	554444	554449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_009620	GATA	2	8	555602	555609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_009620	AGGG	2	8	555738	555745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_009620	T	6	6	555781	555786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009620	TAT	2	6	557596	557601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009620	CG	3	6	557610	557615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_009620	CTT	2	6	557627	557632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_009620	CGGG	2	8	558539	558546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_009620	GAA	2	6	558584	558589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009620	TTA	2	6	560101	560106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009620	TAA	2	6	560125	560130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009620	GGCC	2	8	560176	560183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_009620	CCG	2	6	560194	560199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_009620	GCC	3	9	561498	561506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_009620	GCC	2	6	561515	561520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_009620	GCG	2	6	561521	561526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009620	CAT	2	6	562915	562920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009620	TTG	2	6	562961	562966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009620	CAG	2	6	562979	562984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009620	C	6	6	563387	563392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_009620	TG	3	6	563436	563441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009620	TAAA	2	8	565961	565968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009620	TTCCC	2	10	566473	566482	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1115	NC_009620	T	6	6	566500	566505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009620	CTG	2	6	566526	566531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_009620	CG	3	6	566595	566600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_009620	TCC	2	6	567631	567636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_009620	CCG	2	6	567654	567659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_009620	TCC	2	6	567667	567672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_009620	CG	3	6	567752	567757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_009620	CAC	2	6	567832	567837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_009620	CGG	2	6	567849	567854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009620	GAG	2	6	567878	567883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009620	CCGC	2	8	567899	567906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1126	NC_009620	CTT	2	6	568853	568858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009620	TGCC	2	8	568863	568870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_009620	TCG	2	6	568873	568878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009620	A	6	6	568888	568893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009620	CGC	2	6	568900	568905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_009620	CCGG	2	8	568913	568920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_009620	GGA	2	6	568929	568934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009620	CGG	2	6	573225	573230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009620	GCG	2	6	573257	573262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_009620	G	6	6	573285	573290	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009620	GGC	2	6	573292	573297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_009620	GAGG	2	8	573304	573311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_009620	GCC	2	6	573321	573326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_009620	GTCG	2	8	573328	573335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_009620	TGT	2	6	573343	573348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_009620	TCA	2	6	574325	574330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1144	NC_009620	CGA	2	6	574347	574352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1256	NC_009620	AGG	2	6	618468	618473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_009620	CG	3	6	619037	619042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1259	NC_009620	GGT	2	6	619128	619133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_009620	GGGA	2	8	700234	700241	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_009620	GGA	2	6	708524	708529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_009620	CGA	2	6	710083	710088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_009620	CTC	2	6	724695	724700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1408	NC_009620	GAT	2	6	724772	724777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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