MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 10319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009511	ACG	2	6	534172	534177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_009511	CCG	2	6	534196	534201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_009511	AGC	2	6	534230	534235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009511	CCA	2	6	534278	534283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_009511	GTT	2	6	534298	534303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009511	CGT	2	6	534333	534338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_009511	GAT	2	6	534342	534347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009511	CATC	2	8	534375	534382	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_009511	AGC	2	6	534392	534397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009511	TCCG	2	8	534418	534425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_009511	CG	3	6	534437	534442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_009511	GAA	2	6	535549	535554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009511	GGC	2	6	535565	535570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009511	CCG	2	6	535604	535609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_009511	GAGG	2	8	535625	535632	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009511	GC	3	6	535633	535638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_009511	TCA	2	6	539692	539697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009511	CGG	2	6	539737	539742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009511	CCT	2	6	542480	542485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_009511	GGCG	2	8	542502	542509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_009511	CCG	2	6	542526	542531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_009511	CGGG	2	8	542616	542623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_009511	GCC	2	6	543596	543601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_009511	CCCCA	2	10	543607	543616	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1025	NC_009511	CGG	2	6	544663	544668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009511	AAG	2	6	544680	544685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009511	CGG	2	6	550854	550859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009511	TCG	2	6	550873	550878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009511	GCCC	2	8	550908	550915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1030	NC_009511	CG	3	6	551296	551301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_009511	AAAGG	2	10	552391	552400	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009511	G	7	7	552443	552449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009511	CCG	2	6	553681	553686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_009511	CCG	2	6	556122	556127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_009511	GGCT	2	8	558230	558237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_009511	CAC	2	6	562365	562370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_009511	GAA	3	9	562429	562437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009511	ACA	2	6	562495	562500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009511	CCA	2	6	562508	562513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_009511	GCA	2	6	562564	562569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_009511	GCAGC	2	10	562600	562609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1042	NC_009511	GA	3	6	562611	562616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009511	CCA	2	6	565873	565878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_009511	CGG	2	6	565884	565889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009511	TC	4	8	569010	569017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_009511	GGCCGG	2	12	569098	569109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_009511	CGA	2	6	569112	569117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_009511	CCCT	2	8	569747	569754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1049	NC_009511	AAGATG	2	12	572126	572137	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009511	CG	3	6	572158	572163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_009511	CCG	2	6	572167	572172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_009511	CGG	2	6	575794	575799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009511	CTC	2	6	575830	575835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_009511	CCG	2	6	575853	575858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_009511	GAC	2	6	575860	575865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009511	G	6	6	579766	579771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009511	TGA	2	6	579787	579792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009511	GCA	2	6	579872	579877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009511	ATTT	2	8	579878	579885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009511	CCGTG	2	10	581258	581267	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_009511	GCCG	2	8	581272	581279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_009511	TCT	2	6	581324	581329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_009511	ACG	2	6	583080	583085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009511	CCG	2	6	586859	586864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_009511	GCG	2	6	589815	589820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009511	GGC	2	6	589835	589840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_009511	TCC	2	6	591499	591504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_009511	ACC	2	6	591527	591532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_009511	GTG	2	6	591539	591544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009511	GGGGT	2	10	591547	591556	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009511	GCG	2	6	591577	591582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009511	TCCCCC	2	12	591584	591595	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1073	NC_009511	GC	3	6	591600	591605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_009511	GGA	2	6	591608	591613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009511	CAA	2	6	591623	591628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_009511	ATA	2	6	591639	591644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009511	CCT	2	6	593796	593801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_009511	CG	3	6	595421	595426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_009511	TCG	2	6	595437	595442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_009511	CGA	2	6	595456	595461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_009511	GCG	2	6	595475	595480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009511	TTG	2	6	595524	595529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009511	CG	3	6	595550	595555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_009511	GC	3	6	597648	597653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_009511	C	6	6	598376	598381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1086	NC_009511	CGA	2	6	598843	598848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_009511	GCG	2	6	598885	598890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009511	ACG	2	6	598940	598945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_009511	T	6	6	598974	598979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009511	TAG	2	6	599033	599038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009511	CGG	2	6	599064	599069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_009511	TCG	2	6	599111	599116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009511	AGG	2	6	599186	599191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009511	TCC	2	6	599411	599416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_009511	ATTA	2	8	599475	599482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009511	TAA	2	6	599547	599552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009511	TCT	2	6	599554	599559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_009511	AAG	2	6	601794	601799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009511	CGG	3	9	601807	601815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009511	CAT	2	6	601881	601886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_009511	CCT	2	6	601916	601921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_009511	GCC	2	6	603899	603904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_009511	CGGA	2	8	603919	603926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_009511	CGA	2	6	603931	603936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_009511	GCG	2	6	603966	603971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_009511	GAC	2	6	604019	604024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009511	CGGG	2	8	604048	604055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_009511	GAG	2	6	604130	604135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009511	TCG	2	6	605448	605453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009511	GGC	2	6	605471	605476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009511	GA	3	6	605490	605495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009511	CTG	2	6	605538	605543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_009511	CGG	2	6	605560	605565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009511	AG	3	6	605602	605607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009511	GCG	2	6	605608	605613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009511	CG	3	6	605620	605625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_009511	CCG	2	6	605632	605637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_009511	CCCG	2	8	606457	606464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1119	NC_009511	ATC	2	6	606473	606478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009511	GCT	2	6	607733	607738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_009511	GAC	2	6	607756	607761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009511	AGC	2	6	607780	607785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009511	GCGCG	2	10	608724	608733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1124	NC_009511	GAG	2	6	608757	608762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009511	TGT	2	6	610771	610776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009511	GCCG	2	8	610778	610785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_009511	GGAGCG	2	12	612529	612540	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1129	NC_009511	CCG	2	6	612570	612575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_009511	GC	3	6	612698	612703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_009511	ACC	2	6	612774	612779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_009511	GCA	2	6	612782	612787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_009511	C	6	6	614354	614359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1134	NC_009511	GCC	2	6	615474	615479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_009511	CCG	2	6	615494	615499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1263	NC_009511	CGG	2	6	671605	671610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1270	NC_009511	A	6	6	672736	672741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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