MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 472

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009508	TCT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009508	ATT	2	6	6402	6407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009508	TAA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009508	GGA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009508	TAT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009508	AGG	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009508	TCC	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009508	CTT	2	6	9407	9412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009508	CGC	2	6	9430	9435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009508	AAC	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009508	AAT	2	6	10581	10586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009508	CCA	2	6	10590	10595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009508	CGC	2	6	13592	13597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009508	CAA	2	6	13620	13625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009508	TCA	2	6	14581	14586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009508	TCG	2	6	14587	14592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009508	CGC	2	6	15790	15795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009508	TTC	2	6	15859	15864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009508	ATT	2	6	17896	17901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009508	CCG	2	6	17924	17929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009508	AGG	2	6	17966	17971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009508	TCG	2	6	17981	17986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009508	ATC	2	6	20175	20180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009508	CAA	2	6	20239	20244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009508	GAC	2	6	20964	20969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009508	CCG	2	6	21021	21026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009508	ACC	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009508	CGC	2	6	21065	21070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009508	GGC	2	6	21074	21079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009508	CAG	2	6	21089	21094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009508	GAG	2	6	21343	21348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009508	CGA	2	6	21366	21371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009508	GAA	2	6	21432	21437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009508	ATC	2	6	22696	22701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009508	CGC	2	6	22752	22757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009508	ATC	2	6	22776	22781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009508	TCA	3	9	23292	23300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009508	GTG	2	6	23319	23324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009508	GAT	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009508	GAG	2	6	23448	23453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009508	GCG	2	6	27947	27952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009508	GCT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009508	GGC	2	6	28040	28045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009508	GTC	2	6	28133	28138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009508	TCG	2	6	28204	28209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009508	CCG	2	6	28210	28215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009508	CCG	2	6	28217	28222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009508	GAG	2	6	28287	28292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009508	GCG	2	6	28336	28341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009508	CGA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009508	GTC	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009508	CAT	2	6	28545	28550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009508	TGC	2	6	28642	28647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009508	CGA	2	6	28706	28711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009508	GAT	2	6	28782	28787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009508	CAC	2	6	28832	28837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009508	CGG	2	6	28971	28976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009508	CCA	2	6	28996	29001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009508	CGC	2	6	29008	29013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009508	CAC	2	6	29015	29020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009508	CCG	2	6	29090	29095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009508	GCC	2	6	29164	29169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009508	GAT	2	6	29244	29249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009508	AAC	2	6	29268	29273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009508	TAC	2	6	29316	29321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009508	CCT	2	6	29323	29328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009508	CCT	2	6	31407	31412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009508	CGC	2	6	31414	31419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009508	CAA	2	6	31458	31463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009508	GCG	2	6	31500	31505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009508	GCT	2	6	31524	31529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009508	CGA	2	6	31546	31551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009508	GAT	2	6	31736	31741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009508	GAT	2	6	31766	31771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009508	CCG	2	6	31815	31820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009508	ACC	2	6	32203	32208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009508	TTC	2	6	32236	32241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009508	GCT	2	6	32314	32319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009508	ACC	2	6	32320	32325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009508	TCT	2	6	32481	32486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009508	CCT	2	6	33775	33780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009508	CGT	2	6	34764	34769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009508	ATC	2	6	38413	38418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009508	GAG	3	9	38546	38554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009508	GCA	2	6	43541	43546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009508	GAA	2	6	43598	43603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009508	CCA	2	6	43620	43625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009508	TTG	2	6	43661	43666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009508	GGC	2	6	43685	43690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009508	CGG	2	6	43765	43770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009508	CCG	2	6	43871	43876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009508	TCG	2	6	44706	44711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009508	GCC	2	6	44849	44854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009508	CGG	2	6	44860	44865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009508	TGG	2	6	44881	44886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009508	GCC	3	9	44935	44943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009508	CGC	2	6	44966	44971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009508	CGG	2	6	45070	45075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009508	CGA	2	6	45137	45142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009508	ATA	2	6	45240	45245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009508	ATC	2	6	47105	47110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009508	GGC	2	6	47160	47165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009508	GAA	2	6	47173	47178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009508	GCC	2	6	47184	47189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009508	TGG	2	6	47237	47242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009508	CAT	2	6	47259	47264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009508	TCG	2	6	47288	47293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009508	ATC	2	6	47339	47344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009508	CGC	2	6	49274	49279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009508	CGG	2	6	49694	49699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009508	CTC	2	6	50076	50081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009508	CGT	2	6	50692	50697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009508	CGG	2	6	50700	50705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009508	CAG	2	6	51175	51180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009508	AGG	2	6	51198	51203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009508	TGA	2	6	52951	52956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009508	GTC	2	6	52976	52981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009508	CGG	2	6	53113	53118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009508	ATC	2	6	53167	53172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009508	GGC	2	6	53177	53182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009508	TCC	2	6	54260	54265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009508	CGG	2	6	54318	54323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009508	CCG	2	6	54337	54342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009508	CGA	2	6	56700	56705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009508	GAT	2	6	56721	56726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009508	CAC	2	6	56745	56750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009508	TCA	2	6	56828	56833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009508	GGA	2	6	56838	56843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009508	GTG	2	6	56866	56871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009508	CCG	2	6	56895	56900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009508	GAT	2	6	56919	56924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009508	ATC	2	6	56968	56973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009508	CGA	2	6	56985	56990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009508	GCC	2	6	57017	57022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009508	CAG	2	6	57051	57056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009508	ATC	2	6	57169	57174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009508	TCG	3	9	57304	57312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009508	TCG	2	6	57344	57349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009508	TCG	2	6	57388	57393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.