MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT01

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009507	GC	3	6	393	398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009507	CG	3	6	591	596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009507	CA	3	6	636	641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009507	CG	4	8	774	781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009507	TG	3	6	5905	5910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009507	GC	4	8	19915	19922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009507	CG	3	6	22042	22047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009507	CT	3	6	24253	24258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009507	TC	3	6	24317	24322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009507	CT	3	6	27629	27634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009507	CG	3	6	38560	38565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009507	TC	3	6	39567	39572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009507	TC	3	6	43331	43336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009507	GT	3	6	56766	56771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009507	CA	3	6	57399	57404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009507	GC	3	6	57424	57429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009507	GA	3	6	57895	57900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009507	GA	3	6	59105	59110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009507	AG	3	6	61792	61797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009507	CG	3	6	61911	61916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009507	CG	3	6	62366	62371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009507	GC	3	6	64038	64043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009507	GC	3	6	64103	64108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009507	GC	3	6	64168	64173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009507	GC	4	8	66582	66589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009507	GC	3	6	69085	69090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009507	GC	3	6	75872	75877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009507	CG	3	6	76360	76365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009507	GC	3	6	76366	76371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009507	GC	3	6	78307	78312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009507	GC	3	6	84179	84184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009507	TG	3	6	84761	84766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009507	CG	3	6	86524	86529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009507	GC	3	6	86548	86553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009507	CG	3	6	88397	88402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009507	GC	3	6	89467	89472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009507	CT	3	6	89492	89497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009507	TG	3	6	89797	89802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009507	AG	3	6	89946	89951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009507	AT	3	6	90125	90130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009507	CG	3	6	95436	95441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009507	GC	3	6	95445	95450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009507	GC	3	6	95547	95552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009507	GC	3	6	95813	95818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009507	GC	3	6	98240	98245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009507	GA	3	6	99065	99070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009507	CG	3	6	99092	99097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009507	GC	3	6	100979	100984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009507	GC	3	6	101020	101025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009507	CG	4	8	101602	101609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009507	CG	3	6	101805	101810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009507	AT	3	6	104550	104555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009507	CG	5	10	109228	109237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009507	AG	3	6	119024	119029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009507	CG	4	8	119166	119173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009507	GA	3	6	120592	120597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009507	GC	4	8	120985	120992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009507	GC	3	6	121034	121039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009507	GC	3	6	121691	121696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009507	AG	4	8	122961	122968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009507	GC	3	6	125300	125305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009507	CT	3	6	129222	129227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009507	CG	3	6	132024	132029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009507	CG	3	6	133128	133133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009507	GC	4	8	133876	133883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009507	GA	3	6	134961	134966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009507	GC	3	6	139050	139055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009507	CG	3	6	139337	139342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009507	CG	3	6	139758	139763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009507	GC	3	6	139880	139885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009507	AT	3	6	139947	139952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009507	GC	4	8	139988	139995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009507	CG	3	6	139999	140004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009507	CG	4	8	140208	140215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009507	GC	3	6	140556	140561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009507	GC	3	6	140565	140570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009507	GC	4	8	140634	140641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009507	GC	3	6	141018	141023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009507	CT	4	8	141318	141325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009507	GA	3	6	144797	144802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009507	GC	3	6	144931	144936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009507	GC	3	6	150961	150966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009507	CG	3	6	171543	171548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009507	CG	3	6	172216	172221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009507	GC	3	6	172676	172681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009507	AT	3	6	172849	172854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009507	CG	3	6	172924	172929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009507	GA	3	6	173656	173661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009507	CG	3	6	176436	176441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009507	GC	3	6	176503	176508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009507	GC	3	6	177354	177359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009507	GC	3	6	177497	177502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009507	GC	3	6	179057	179062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009507	GC	3	6	179803	179808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009507	CG	3	6	179898	179903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009507	GT	3	6	180198	180203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009507	CG	4	8	181094	181101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009507	TC	3	6	185709	185714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009507	GC	4	8	185834	185841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009507	CG	3	6	187088	187093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009507	GA	3	6	187719	187724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009507	CG	4	8	191405	191412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009507	CT	3	6	191529	191534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009507	CT	3	6	197632	197637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009507	CG	3	6	205389	205394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009507	CG	3	6	205504	205509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009507	CG	3	6	206084	206089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009507	GC	3	6	207383	207388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009507	CG	3	6	210118	210123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009507	CG	3	6	213961	213966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009507	CG	3	6	214435	214440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009507	CG	3	6	216067	216072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009507	GC	3	6	219671	219676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009507	TC	3	6	220398	220403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009507	TC	3	6	232618	232623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009507	GC	3	6	233910	233915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009507	CG	3	6	234235	234240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009507	GC	3	6	234365	234370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009507	GA	3	6	243212	243217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009507	AT	3	6	249844	249849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009507	GC	3	6	250488	250493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009507	CT	4	8	250513	250520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009507	AC	3	6	250907	250912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009507	TC	4	8	252234	252241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009507	GC	3	6	255194	255199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009507	CG	3	6	255769	255774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009507	GC	3	6	257086	257091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009507	GC	3	6	257525	257530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009507	CT	3	6	260210	260215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009507	CG	3	6	260631	260636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009507	GA	4	8	267252	267259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009507	GT	3	6	267364	267369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009507	CG	3	6	271939	271944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009507	CG	4	8	272040	272047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009507	GC	3	6	291865	291870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009507	GA	3	6	292598	292603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.